Identification of novel components of the mammalian circadian clock

Sirkadiyen saat bir biyolojik zamanlama sistemi olup 24 saatlik periyoda sahiptir ve işleyişi gece-gündüz döngüsüne göre düzenlenir. Birçok fizyolojik ve davranışsal işlem sirkadiyen saatin kontrolü altındadır, bu yüzden sirkadiyen saatlerin çalışma mekanizmasını tamamen çözmek sirkadiyen saatin bozulmasından kaynaklanan bazı sağlık problemlerine karşı tedavi geliştirmeye yardımcı olacaktır. Bu sağlık sorunlarının arasında obezite, jetlag, insomni ve psikolojik rahatsızlıklar yer alır. Geçtiğimiz on yıl içerisinde sirkadiyen saatin moleküler mekanizması birçok grup tarafından araştırılmış olup pek çok saat bileşeni ve düzenleyicisi saptanmıştır. Buna rağmen moleküler mekanizma bütünüyle çözülmüş değildir. Araştırmacılar arasında yeni bileşenler keşfetmek için ciddi bir rekabet söz konusudur ve bu uğurda sıklıkla kullanılan yöntemlerden biri naif Bayesian stratejisidir. Bu tez çalışmasında, naif Bayesian stratejisiyle tanımlanmış yüksek ihtimalli aday saat genleri bilinen saat bileşenleriyle olası bir etkileşim bulmak amacıyla memeli ikili melez yöntemiyle deneysel olarak taranmıştır. Bütün taramanın sonucunda iki protein bulunmuştur: leptin reseptörü ile örtüşen transktript-benzeri 1 (Leprotl1) ve sterol O-asetiltransferaz 1 (SOAT1), bu iki proteinin de metabolik fonksiyonları vardır. LEPROTL1 proteininin hem mCRY1 hem de mCRY2 ile etkileştiği görülürken, SOAT1 proteininin yalnızca mCRY1 ile etkileştiği saptanmıştır. Bu çalışmada Leprotl1 geninin sirkadiyen saat mekanizmasındaki rolü araştırılmıştır. Leprotl1 geni susturulduğunda hücrelerde salınım şiddeti azalırken süre fazının arttığı ve geciktiği görülmüştür, bu da Leprotl1 geninin sirkadiyen saatin düzgün işleyişinde bir görevi olduğunu gösterir.