Molecular mechanisms underlying mammalian cytokinesis and cellular differentiation

Sitokinez, aktin hücre iskeletinin, plazma zarının ve hücre bölünmesi mekanizmasının yeni oluşan kardeş hücreleri fiziksel olarak ayırmak için etkileşimde bulunduğu, ökaryotik hücre bölünmesinin son evresidir. Bu süreç boyunca meydana gelecek herhangi bir hata normal hücreleri kanser hücrelerine dönüştürebilir. Fakat oldukça karmaşık bir mekanizma olan memeli sitokinezi hala cevaplanmaya ihtiyaç duyulan belli başlı sorular içermektedir. Daha önce gerçekleştirdiğimiz proteomik analizimiz, chloride intracellular channel (CLIC) proteinlerinin sitokinez sırasında bir rolü olabileceğini öne sürmüştür. Bu çalışmanın birinci kısmında, yakınlık bağımlı protein etkileşim ağının kütle spektrometresi temelli sistematik bir analizi, CLIC4'ün etkileşim gösterdiği sitokinez ile ilgili yeni proteinleri açığa çıkarmıştır. Bu etkileşimlerin sitokinezin doğru bir şekilde gerçekleşmesini desteklediğini bulduk. İkinci kısımda, insan meme epiteli hücrelerinin mezenkimal hücrelere dönüşümünü sağlayan biyokimyasal değişikliklerin sistematik şekilde analizi için nicel proteomik bir yaklaşım kullanıldı. Normalde epitel-mezenkimal dönüşüm (EMT) embriyonik gelişimde temel bir rol oynamaktadır, fakat hücreler metastazın ve karsinogenezin başlamasını ve ilerlemesini hızlandırmak için EMT'yi hücresel farklılaşmanın bir yolu olarak kullanabilirler. Şimdiye kadar yapılan birçok çalışma EMT'nin transkripsiyonel düzenlemesi üzerinde sınırlandırılmıştır. Fakat, transkriptom analizi transkripsiyon sonrası değişikliklerden dolayı protein seviyesindeki düzenlemeyi tam olarak yansıtamayabilir. Bizim proteomik analizimizin sonucu olarak EMT'nin birçok yeni mRNA ve/veya protein seviyesindeki modülatörleri tespit edilmiş ve in vitro ve in vivo deneyler ile doğrulanmıştır. Bunların arasından DNAJB4'ü ve CD81'i meme kanserinde yeni metastaz indükleyicileri olarak açığa çıkardık. Bu çalışma aynı zamanda metastaza ve karsinogeneze odaklanacak çalışmalar için eşsiz bir platform ve kaynak sağlamaktadır.