Novel signals in mutant calreticulin enhance its secretion in myeloproliferative neoplasms
2024
0 views
0 downloads
Advisor: Yrd. Doç. Ilyas Chachoua
Abstract (TR)
Kalretikülin, protein katlanması ve kalsiyum homeostazisi dahil olmak üzere birçok fizyolojik rolde yer alan, endoplazmik retikulumda yerleşik bir şaperondur. Son zamanlarda, miyeloproliferatif neoplazmlarda kalretikülin (CALR) geninin ekson 9'unda çerçeve kayması mutasyonları belgelenmiştir. Bu mutasyonlar, karboksi terminal alanındaki negatif yüklü dizinin pozitif yüklü ve hidrofobik kalıntılarla değiştirilmesiyle sonuçlanır; bu, trombopoietin reseptörü (MPL) ile doğrudan etkileşim yoluyla JAK/STAT yolunun aktivasyonuna yol açar. Dahası, endoplazmik tutma sinyalinin (KDEL) kaybı, bunun hücre dışı ortama salgılanmasını kolaylaştırır ve burada serseri bir sitokin gibi davranır. Bu çalışmada kalretikülin mutant salgısının ardındaki moleküler mekanizmanın daha iyi anlaşılmasını amaçlıyoruz. Bu amaçla, CALR mutantlarının yeni üretilen dizisini analiz ettiğimiz in siliko çalışmaları gerçekleştirdik ve bu dizilimin, esas olarak arginin içeren salgı sinyallerinde oldukça zengin olduğunu gösterdik. İki çevrimiçi tahmin aracını kullanarak, bu sinyalleri alaninlere dönüştürmenin, mutantların salgılanmasını önemli ölçüde azalttığını tahmin ediyoruz. İlginç bir şekilde, bu sinyallerin vahşi tip CALR'ye dahil edilmesi, KDEL sinyalinin varlığına rağmen onun salgılanmasını arttırır. Toplamda bu sonuçlar, protein salgılanmasının ardındaki moleküler mekanizmalara ilişkin mevcut anlayışımıza meydan okuyor ve tahmin edilen sinyalleri küçük moleküllerle hedefleyerek CALR ile ilişkili MPN'ler için yeni tedavi stratejilerinin geliştirilmesine yönelik yeni yollar açıyor.
Author
Dr. Scott Davıd Auerbach
How to Cite
Scott Davıd Auerbach (Yüksek Lisans Tezi). Novel signals in mutant calreticulin enhance its secretion in myeloproliferative neoplasms, 2024, Bilkent University.
Keywords
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Bilkent University
- The Lower Danube in Late Antiquity: The case of Histria(2023)
- Oil price surges and the yield curve(2024)
- Essays on forward guidance(2014)
- Multi-armed bandit algorithms for communication networks and healthcare(2022)
- Comparative constitutional happiness in the light of the jurisprudence of the Turkish Constitutional Court(2023)
- Density functional theory investigation of linear carbon chains(2023)
