Peynirden izole edilen çeşitli Bacillus türlerinin 16S sRNA yöntemi ile tanılanması

Farklı ekosistemlerden endüstriyel enzim üreticisi olan mikroorganizmaların taranması, izolasyonu ve konvensiyonel yöntemlerle tanılanması mikrobiyal biyoteknolojinin temel konularından biridir. Mikroorganizmalar tanılanırken morfolojik ve biyokimyasal verilerin moleküler veriler ile desteklenmesi gerekmektedir. Bakteriyel moleküler taksonomide en çok kullanılan moleküler yöntem 16S rRNA sekans analizidir. Çalışmada, peynirden endüstriyel öneme sahip olan Bacillus türlerinin izole edilerek tanılanması amaçlanmıştır. Bu amaçla morfolojik ve biyokimyasal testlerin yanı sıra 16S rRNA'ya dayalı moleküler tanılamadan yararlanılmıştır. 16S rRNA bölgeleri PCR ile çoğaltılarak sekans analizi gerçekleştirilmiştir. Analiz sonucunda elde edilen profil, gen bankasındaki verilerle karşılaştırılarak tanılama yapılmıştır. 16S rRNA bölgeleri sekans sonuçları gen bankasındaki verilerle %99-100 oranında homoloji göstermiştir. Buna göre çalışmada tanılanan bakteriler; Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus pumilus, Bacillus safensis, Enterococcus faecalis, Lactobacillus casei, Lactobacillus coryniformis, Lactobacillus curvatus, Lactobacillus rhamnosus ve Raoultella ornithinolytica olarak tespit edilmiştir. Çalışmanın sonucunda, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus pumilus ve Bacillus safensis bakteri türleri değerlendirilmeye alınmıştır ve filogenetik analizle tespit edilen diğer bakteri türleri ile olan ilişkileri ortaya konulmuştur.