Analysis of PI(3,5)P2 throughout mitosis
2022
0 views
0 downloads
Advisor: Dr. Öğr. Üyesi Ayşe Koca Çaydaşı ; Yrd. Doç. Dr. Nurhan Özlü Sıcakkan
Abstract (TR)
Fosfatidilinositol 3,5-bifosfat (PI(3,5)P2), membran füzyonu/fisyonu, Ca+2 sinyali, koful asitliği, seçici ve genel otofaji, stres tepkisi, MVB yolu, RNA granül taşınması gibi çeşitli sinyalleme ve düzenleyici yolaklarda yer alan az miktarda bulunan bir fosfatidilinositol türevidir. Tomurcuklanan mayada gerçekleştirmiş önceki genetik araştırmalar VAC7, VAC14 ve FAB1 gibi PI(3,5)P2 regülatörlerini mitozdan çıkışta görevli genlerin iyi çalışmadığı durumda hücre bölünmesi için gerekli genler arasında bulundu. Bu tezde mitoz ve PI(3,5)P2 arasındaki etkileşimi araştırmayı amaçladık. Önce PI(3,5)P2 sentezinin hücre döngüsü tarafından düzenlenip düzenlenmediği soğulandı. Bu amaçla, florasan hücre mikroskobu kullanılarak hücre döngüsü boyunca bilinen bir PI(3,5)P2 efektörü olan Atg18'in lokalizasyonu ve seviyeleri analiz edildi. Atg18-GFP'nin, PI(3,5)P2 ve Vac7'ye bağlı olarak koful zarına lokalize olduğu görüldü. Atg18-GFP'nin ağırlıklı olarak mitoz sırasında ana hücrenin kofulundan ziyade yeni oluşan hücre kofulunun çevresinde lokalize olduğunu görüldü. Daha sonra, mitoz sırasında PI(3,5)P2 'nin hangi proteinlerle etkileşime girdiği araştırıldı. Bunun için mitotik hücre pelletleri ve PI(3,5)P2 kaplı boncuklar kullanarak presipitasyon yaklaşımı kullandık. Mitotik çıkışı tetikleyen fosfataz Cdc14'ü bağlayan bir nükleolar protein olan Net1, PI(3,5)P2 kaplı boncuklar üzerinde tespit edildi. Ek olarak, presipitasyon deneyinin sonucunda ribozomal ve rRNA ile ilgili proteinler de elde edilmiştir. Birlikte ele alındığında, Atg18'in yavru hücreye özgü lokalizasyonu ve dolayısıyla PI(3,5)P2 tomurcuklanan mayanın asimetrik hücre bölünmesinde yavruya özgü bir rolü olduğunu gösterebilir. Ek olarak, potansiyel PI(3,5)P2 efektörleri mitotik çıkış, rRNA granül taşınması ve translasyonda PI(3,5)P2 'nun görevleri olabilir. İlerleyen çalışmalar asimetrik PI(3,5)P2 sentezinin fonksiyonel önemini ve ayrıca tanımlanan yeni PI(3,5)P2 efektörlerinin özgüllüğünü ve önemini ortaya çıkaracaktır.
Author
Dr. Cansu Dilege
Institution
How to Cite
Cansu Dilege (Yüksek Lisans Tezi). Analysis of PI(3,5)P2 throughout mitosis, 2022, Koç University.
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Koç University
- Turkish coffee fortune-telling ritual as a source of inspiration for designing object-mediated advice interactions(2017)
- International marketing strategies of Ekom-Eczacıbaşı in the Russian market(1995)
- The Balkans in an Age of Baroque transformations in architecture, decoration, and patterns of patronage ad cultural production in Ottoman Europe, 1718-1856(2006)
- On the de Rham-Witt complex(2011)
- Single machine scheduling with timelag constraints(2014)
- Ottoman olfactory traditions in a palatial space: Incense burners in The Topkapi Palace(2015)
