Süperpiksel tabanlı sayısal mikroyansıtıcı aygıt ile ayarlanabilir ışık tabakası mikroskopu

Bu tez çalışmasında düşük maliyetli, farklı görüntüleme seçeneklerine sahip ve çeşitli örnek boyutlarıyla uyumlu bir floresan ışık tabakası mikroskopu düzeneği oluşturulmuştur. Süperpiksel kurulumu ile ışık tabakasını oluşturan optik düzeneğin arka odak noktasına eşlenik olarak yerleştirilen bir sayısal mikroyansıtıcı aygıt ile ışık tabakasının oluşumu sırasında hem genlik, hem de evre yönetimi sağlanmaktadır. Kazanılan bağımsız ışık biçimlendirme olanağı ile renk düzeltmesi, ışık tabakasının iyileştirilmesi, ışık tabakasının örneğe göre biçimlendirilmesi, yapısal aydınlatma yöntemlerinin uygulanması, hızlı ve dış yansıtıcı kullanmadan ışın tarama olanağı ve olabildiğince çeşitli görüntüleme gereksinimlerine uyum sağlamak olasıdır. Düzeneğin göreceli olarak kolay kurulumu ve düşük bedelli olması, optik ve görüntüleme uzmanlığı bulunmayan araştırma takımlarının görüntüleme gereksinimlerini karşılamakta yarar sağlayabilir. Süperpiksel kurulumu özünde sadece genlik değiştirici olarak davranan mikroyansıtıcı aygıtların hem genlik, hem de evre değiştirebilmesine olanak kılmaktadır. Zernike evre dağılımlarından yararlanarak belirli evre dağılımına sahip kırınımsız Bessel ve Airy ışınlarının oluşturulup, 180 um genişliğine kadar dış yansıtıcı kullanmadan taranması gösterilmiştir. Durağan ve değişken iki kurulum arasında kolay değiştirilebilen düzenek yeniden hizalamaya gerek kalmadan geri döndürülebilir. Gösterilen düzenek ve tasarım adımları örnek gereksinimlerine göre uyarlanabilir, eşzamanlı yönetim ile yüksek çözünürlüklü görüntüleme yapabilir ve gereksinimlere göre görüntüleme isterlerini karşılaması için başka tekniklerle birleştirilebilir. OpenSPIM projesinin yaklaşımından esinlenerek bu çalışma kapsamında kurulan düzenek ile ilgili kurulum ve tasarım ayrıntıları ile kullanılan yönetim yazılımları CC-BY-SA lisansı altında açık kaynak olarak sunulacaktır.