Early postzygotic mutations contribute to de novo variation in a healthy monozygotic twin pair
2014
0 views
0 downloads
Advisor: Prof. Dr. Tayfun Özçelik
Abstract (TR)
De novo mutasyonların özellikleri ve oranının bilinmesi hastalıkların ve evrimsel süreçlerin anlaşılabilmesi için büyük önem taşımaktadır. De novo tek nükleotid değişikliklerinin (SNV) doğrudan incelenmesi ile insanda bir nesilde ortaya çıkan yeni tek nükleotid değişikliği oranı 0.82 – 1.70 ×10-8 baz çifti olarak belirlenmiştir. Ancak, bu tek nükleotid değişikliklerinin gelişimin hangi evresinde ortaya çıktığı ve dolayısıyla erken post-zigotik mutasyonların toplam de novo mutasyon oranına olan katkısı bilinmemektedir. Bu noktada, insanda bir nesilde ortaya çıkan yeni mutasyon oranını ortaya çıkma zamanına göre belirlemek amacıyla; anne, baba ve sağlıklı bir erkek ikiz çiftinden oluşan ailede toplam 170 X kapsamalı tüm genom dizilemesi yaptık. Bulunan her bir mutasyon için her bir bireyin genotiplerini karşılaştırmalı ve eş zamanlı olarak analiz ederek de novo tek nükleotid değişikliklerinin belirledik. Sanger dizilemesi ile yapılan doğrulamanın ardından toplam 32 de novo tek nükleotid değişikliğini karakterize ettik. Bu mutasyonlardan 23 tanesi ikizlerin her ikisinin genomunda, 8 tanesi ikizlerden birinde 1 tanesi ise diğerinde bulunmaktadır. Toplam de novo mutasyon oranını ikizlerden biri için 1.31 × 10-8, diğeri için 1.01 × 10-8 olarak hesapladık. Toplam mutasyon oranı içinde, erken post-zigotik mutasyonların oranını ise ikizlerden biri için 0.34 × 10-8 ve diğeri için 0.04 × 10-8 olarak belirledik. Bulgularımız erken post-zigotik mutasyonların sebep olduğu genom mozaisizminin hastalıkların anlaşılması için önem taşıdığını göstermiştir.
Author
Dr. Gülşah Merve Kılınç
How to Cite
Gülşah Merve Kılınç (Doktora Tezi). Early postzygotic mutations contribute to de novo variation in a healthy monozygotic twin pair, 2014, Bilkent University.
Keywords
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Bilkent University
- The Lower Danube in Late Antiquity: The case of Histria(2023)
- Oil price surges and the yield curve(2024)
- Essays on forward guidance(2014)
- Multi-armed bandit algorithms for communication networks and healthcare(2022)
- Comparative constitutional happiness in the light of the jurisprudence of the Turkish Constitutional Court(2023)
- Density functional theory investigation of linear carbon chains(2023)
