Development of a home-built light sheet fluorescence microscope for cleared tissue imaging
2020
0 views
0 downloads
Advisor: Prof. Dr. Alper Kiraz
Abstract (TR)
Işık tabakası floresans mikroskopisi, konfokal mikroskop ve yansıma floresans mikroskop yöntemlerine nazaran çeşitli yararları nedeniyle biyomedikal alanı gibi yaşam bilimlerinde sıkça uygulanan bir görğntüleme yöntemi haline gelmiştir. LSFM yöntemi aydınlatma için odaklanmış bir nokta yerine dar bir ışık çizgisi kullanıldığından tahribatsız bir tekniktir bu da geniş görüş alanlı hızlı görüntüleme sağlamaktadır ve fotoışıldama bozulması etkisi de azalır. Bu çalışmada ticari olarak erişilebilir donanımlar kullanarak kendi labaratuvarımızda yaptığımız LSFM doku görüntüleme düzeneğinin gelişimini tanıtıyoruz. LSFM için silindirik mercek kullanarak ince bir lazer ışığı tabakası oluşturmak gerekir. Ornek bu ışık tabakası boyunca taranır böylece örnek düzlemleri seçime bağlı olarak aydınlatılır. Ornek düzlemlerinin seçime bağlı olarak aydınlatılması, istenilen odak düzlemlerinde tercihe bağlı floresan uyarılmasına imkan verir. Orneğin üç boyutlu görüntüsü bu seçili düzlemler kullanılarak elde edilir. LSFM düzeneği "Open Access Platform for Selective Plane Illumination Microscopy" isimli açık kaynak platformundan yararlanılarak yapılmıştır. Görüntüleme için kullandığımız örnek, floresan boya ile boyanmış şeffaflaştırılmış dokudur. Örneği dalga boyu 525 nm olan birkaç lazer kaynağı ile aydınlatabilmek için SHG yöntemiyle Coherent Chameleon ayarlanabilir lazer ve diyot lazeri kullanılmıştır. Üç boyutlu görüntülerr ise Fiji ImageJ yazılımı vasıtasıyla daha önce görüntülenen düzlemlerin birleştirilmesiyle oluşturulmuştur.
Author
Dr. Ömer Yaman
How to Cite
Ömer Yaman (Yüksek Lisans Tezi). Development of a home-built light sheet fluorescence microscope for cleared tissue imaging, 2020, Koç University.
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Koç University
- International marketing strategies of Ekom-Eczacıbaşı in the Russian market(1995)
- The Balkans in an Age of Baroque transformations in architecture, decoration, and patterns of patronage ad cultural production in Ottoman Europe, 1718-1856(2006)
- Single machine scheduling with timelag constraints(2014)
- Ottoman olfactory traditions in a palatial space: Incense burners in The Topkapi Palace(2015)
- The connectedness of the Rum Seljuks and the Kingdom of Georgia: A framework for artistic exchance in the thirteenth century(2015)
- Turkish coffee fortune-telling ritual as a source of inspiration for designing object-mediated advice interactions(2017)
