Quantitative and network analysis of cytokinesis specific phosphoproteins

Çekirdek bölünmesi (mitoz) sırasında gerçekleşen protein fosforilasyonları geniş ölçüde tanımlanmıştır ancak çekirdek bölünmesi (sitokinez) sırasında gerçekleşen protein fosforilasyonları ve bu fosforilasyonlardan sorumlu kinazlar kapsamlı olarak tanımlanmamıştır. Kütle spektrometrisi analizimiz yaklaşık olarak 1500 adet protein fosforilasyonunun sitokinez sırasında gerçekleştiğini açığa çıkarmıştır. Bulduğumuz sitokineze özel fosforilasyonlar için kinaz – substrat tahmini algoritması kullanarak, sitokinez sırasında aktif olan 31 adet kinazı ortaya çıkardık. Bu kinazların içinde, daha önceden hücre döngüsünü düzenlediği belirlenmiş olan MAPK, CDK1/2 ve Aurora gibi kinazları da gördük. Yine bu fosforilasyonlar içinden, proliferasyon işaretçisi olan protein MKI67'nin sitokineze özel fosforilasyonunu ortaya çıkardık. MKI67 mitoz sırasında kromozomların etrafına yerleşerek, kromozomların kümelenmesini önleyen bir protein olarak bilinmektedir. Bu proteinde bulduğumuz sitokinez sırasında gerçekleşen fosforilasyonlar, proteinin N terminusuna yakın kendini tekrar eden bölümlerindedir ve bu bölümlerin işlevi bilinmemektedir. Sitokineze özel bu fosforilasyonlar MKI67 proteinin sitoplazmik bölünme sırasındaki işlevini aydınlatmak açısından önemli olabilir. Son olarak, tek kutuplu ve çift kutuplu sitokinez modellerinde görülen fosforilasyonların türler arasındaki korunumlarını, tek kutuplu sitokinezin çift kutuplu sitokinezden farkını görebilmek için karşılaştırdık. İki model arasında kayda değer bir fark göremedik ve tek kutuplu sitokinez modelinde gördüğümüz fosforilasyonların sitokinez çalışmalarında kullanılabileceği sonucuna vardık.