Türkiye'nin farklı yörelerinden toplanan beyaz peynir örneklerinden laktik asit bakterilerinin izolasyonu, identifikasyonu ve moleküler karakterizasyonu

Laktik asit bakterileri (LAB) karbonhidrat metabolizmasının ana fermantasyon ürünlerinden biri olan laktik asiti üreten oldukça değerli mikroorganizmalardır. LAB genellikle besin içeriği zengin olan ortamlarda ve özellikle de süt ürünleri, et ve sebzelerde yaygın bir şekilde bulunurlar. Bu bilgiden yola çıkılarak, tez çalışmamızda Erzurum başta olmak üzere birçok farklı yöreden beyaz peynir örnekleri toplanarak laktik asit bakterilerinin izolasyonu, identifikasyonu ve moleküler karakterizasyonu gerçekleştirildi. Sonuçta; Lactobacillus kefiri, L. brevis, L. casei, L. paracasei, Pediococcus lolii, Prolinoborus fasciculus, Staphylococcus haemolyticus, Lysnibacillus sinduriensis, P.parvulus, L. paraplantarum, Staphylococcus hominis, L. buchneri, L. plantarum, Enterococcus faecium, Micrococcus yunnanensis, Microbacterium paraoxydans ve Rothia dentocariosa türlerine ait 42 adet bakteriyal izolat elde edildi. Bu amaçla ilk önce; bakterilerin gelişme gösterdikleri sıcaklık, pH ve tuz konsantrasyon aralıkları belirlendi. İzole edilen bakterilerin büyük bölümünün 30-45ºC' de, 3-6 pH' da ve % 2 - % 8 tuz konsatrasyon değerlerinde gelişim gösterdikleri tespit edildi. Daha sonra test izolatları API, 16S rRNA gen analizi ve rep-PCR yöntemleri kullanılarak incelendi. Sonuç olarak, genomik parmak izi analiz yöntemlerinden (GTG)5-PCR' ın, BOX-PCR' a göre suşların ayrımında daha başarılı olduğu gözlendi. 16S rRNA sekans analiz verilerine göre ise; MA56 suşunun % 98 oranında L. buchneri' ye, MA13 suşunun yine aynı oranda E. faecium' a ve MA27 suşunun ise % 97 oranında E. faecium' a benzerlik gösterdiği ve bu üç izolatın yeni tür olabileceği sonucuna varılmıştır.