XML - based framework for WEB-based neurocardiovascular simulation

ÖZETWEB-TABANLI NEUROCARDIOVASCULARSİMÜLASYONU İÇİN XML-TABANLI BİRÇERÇEVEİsmail UZUNElectrik-Elektronik Mühendisliği, Yüksek LisansTez Yöneticisi: Prof. Dr. Yusuf Ziya İDERAğustos 2004Neurocardivascular kontrol sisteminin matematiksel modellemesi venumerik simulasyonu, sistemin işleyişinin daha iyi anlaşılması ve sinirselbozuklukların teşhis edilmesinde önemli bir rol oynamaktadır. Şu andaneurocardiovascular modellerin simulasyonu, uzaktan erişim ve bilgi paylaşımıgibi özelliklerden yoksun masaüstü uygulamaları ile gerçekleştirilmektedir.Son 20 yılda, web teknolojisinin profesyonel yaşam ve araştırma hayatınıniçine yerleşmesine rağmen, bu alanda web teknolojilerinin sunduğuolanaklardan yeterince yararlanılmamaktadır. Web teknolojisi kullanılarak,masaüstünden web'e geçiş, beraberinde global erişim, platform bağımsızlığı,bilgi paylaşımı ve kolay bakım gibi özellikler vaad etmektedir. Bu özelliklergözönüne alındığında, web-tabanlı simulasyona olanak sağlayan bir ortamaduyulan ihtiyaç daha açık görülmektedir.Bu tezde, neurocardiovascular modellerin web-tabanlı simulasyonunaolanak sağlayan XML-tabanlı bir ortam sunulmuş ve gerçekleştirilmiştir. Bubağlamda, neurocardiovascular modellerin yapısal olarak tanımlanmasınısağlayan bir XML tanımlama dili, Java tabanlı bir simulasyon paketi ve webvmimarisi oluşrumak üzere destekleyici uygulamalar geliştirilmiştir.Günümüzde, XML web üzerinden yapısal veri taşınmasında evrensel standarthalini almaktadır. Bu nedenle, neurocardiovascular model kümesininolabildiğince geniş bir kümesindeki modellerin tanımlanabilmesine olanaksağlayabilecek, genel bir tanımlama dili olan NeuroCardioVascular ModellemeDili (NCVML)'nin geliştirilmesinde XML'den yararlanıldı.Neurocardiovascular model tanımlarının NCVML ile kodlanmaları ve internetüzerinde bu formatta taşınmaları beklenmektedir. Java tabanlı simulasyonpaketi NCVJSim, kendine has bileşenler içeren bir kütüphane ile birsimulatör'den oluşmaktadır. Kütüphane, zamanla gelişebilecek şekildegenişleyebilir bir yapıdadır. Buna ek olarak, Java Dinamik Bağlama ve JavaReflection Mekanizmalari'ndan yararlanılarak, işletim aşamasında kullanıcıtarafından yazılmış Java sınıflarının işletime dahil edilmesi imkanıkazandırılmıştır. Son olarak, web tabanlı erişim ve web tabanlı işlem sağlamaküzere, Java Servlet teknolojisi ile HTML'den yararlanılmıştır.Sunulan bu çerçeve, tüm modellerin simulasyonuna yönelikgeliştirilmiş olup, belirli bir modelin gerçekleştirimi ile sınırlı değildir.Anahtar sözcükler: Web tabanlı simulasyon, XML, tanımlama diliNeurocardiovascular sistem, Neurocardiovascular model.vi