Zebrafish glioma xenograft models: In vivo investigation of injection methods and development of a streamlit application

Glioblastoma (GBM), primer beyin kanserinin en agresif ve ölümcül formlarından biridir ve etkili tedavi bulunması ve hasta sağlığının takibi açısından önemli zorluklar teşkil etmektedir. Kapsamlı araştırma çabalarına rağmen, GBM biyolojisi ve yeni terapötik stratejilerin geliştirilmesi konusundaki anlayışımız sınırlı kalmaktadır. Zebra balığı ksenograft modelleri, kanser araştırmalarında umut verici bir araç olarak ortaya çıkmıştır ve GBM'nin incelenmesinde benzersiz avantajlar sunmaktadır. Bu tez, GBM anlayışımızı ilerletmede zebra balığı ksenograft modellerinin faydasını araştırmaktadır. İnsanlarla olan genetik ve fizyolojik benzerlikleri nedeniyle zebra balığı, GBM patogenezi, tümör ilerlemesi ve ilaç taramasını incelemek için mükemmel bir platform sağlar. Erken gelişim sırasındaki şeffaflıkları, tümör büyümesinin, istilasının ve tedavilere yanıtın gerçek zamanlı olarak görselleştirilmesine olanak tanır. Dahası, zebra balığı modelleri hızlı ve uygun maliyetli yüksek verimli ilaç taramasına olanak tanıyarak potansiyel GBM terapötiklerinin belirlenmesini hızlandırır. Bu tezde, ZenofishDb adlı önceki veritabanımızın daha gelişmiş ve odaklanmış bir versiyonu olan ZenofishDb Glioma adlı bir uygulama oluşturmaya odaklandım. ZenofishDb Glioma, Python Streamlit kullanılarak oluşturuldu ve yalnızca glioma çalışmalarını içeriyor ve daha iyi sınıflandırmak ve zebra balığı glioma xenograft modelleri hakkındaki bilgileri etkili bir şekilde bulmak ve özetlemek için Doğal Dil İşleme (DDİ) kullanıyor. Ek olarak, ZenofishDb Glioma'yı araştırdıktan sonra, enjekte edilen hücre sayılarının etkilerini test etmek için zebra balığı modelinde glioblastoma hücrelerinin enjeksiyonu için deneysel bir protokol araştırmaya karar verdim. MGG-119-GFP hücreleri ve Casper zebra balığı kullanarak, farklı konum ve aşamalarda, yani blastula ve döllenmeden 2 gün sonra, farklı sayıda hücre enjekte ettim ve çoklu kantifikasyon stratejileri kullanarak 5 dpf'de gruplar arasında önemli farklılıklar olduğunu gözlemledim. Sonuç olarak, ZenofishDb Glioma etkili ksenotransplantasyon stratejileri tasarlamaya ve farklı deneysel parametrelerin zebra balığı glioma ksenograft modellerinin sonucunu nasıl etkilediğini anlamak için karşılaştırmalar yapmaya yardımcı olabilir.