3.803
Arşivlenen Tez
2
DOI Atanmış
0%
DOI Oranı
Anabilim Dalı
Investigation of antimicrobial activities of some fluorinated benzaldehyde derivative schiff base compounds
Multidrug resistant bacteria are a serious problem that has grown alarmingly in recent decades. There is an urgent need to identify ways to treat bacterial resistance because the emergence of resistant diseases caused by these germs has led to death and morbidity. In our study, we aimed to discover and find new antimicrobial drugs against microbes to resolve resistance and to evaluate the potential and efficacy of some fluorinated Schiff base compounds derived from benzaldehyde as antibacterial agents on the standard strains of Staphylococcus aureus Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli. At the beginning all of the bacterial strains have been reactivated in nutrient broth medium at 37 °C and for 24 h and all of the Schiff base compounds (C1-6) have been added into culture plates (96-well) in triplicate order at: 1, 10, 100 to 1000 μM doses. Reactivated Bacterial number adjusted at 0.5 McFarland standards, and then 100 μl added into each culture plate well, then was incubated at 37 °C and for 18 h after incubation, 10 μl of MTT dye (300 μM/ml concentration) have been added to each well and was incubated for 4 h eventually, 100 μl of dimethyl sulfoxide was added to each well, in order to dissolve formazan crystals. The optical density (OD) values for each well were recorded by an microplate reader at 570 nm and MIC50 value of any compound have been calculated through linear regression analysis. Gentamicin's MIC50 for E. coli, S. aureus and P. aeruginosa were found (2.14, 2.21, 2.19 μM, respectively). We found among six fluorinated phenylhydrazıne benzaldehyde compounds, C3 has most effective against E. coli (MIC50 value was 3.81 μM) C4 has most effective against S. aureus (MIC50 value was 3.45 μM) C6 has most effective against P. aeruginosa (MIC50 value was 3.31 μM).Our study could lead to the discovery of new antibacterial agent candidates which will benefit our country's drug industry and human health care. We believe that further testing of C3 for E. coli, C4 for S. aureus, and C6 for P. aeruginosa infections may result in important data for new drug research.
Yüzey aktif madde üreten bakterilerin denizel çevrelerden izolasyonu ve moleküler tanılaması
Mersin ili kıyı şeridindeki farklı lokasyonlardan toplanan deniz suyu örnekleri yüzey aktif madde üreten bakterilerin elde edilmesi için ön zenginleştirme ve izolasyona tabi tutulmuştur. Toplamda 52 bakteri izole edilmiştir. Saf kültürler biyosürfaktan üretim ortamında büyütülmüş ve tarama testlerinde kullanılmak üzere hücresiz kültür sıvıları elde edilmiştir. Kültür sıvıları ile drop collapse testi, parafilm M testi, CTAB-metilen mavisi agar testi ve yağ yer değiştirme testleri uygulanarak biyosürfaktan varlığı değerlendirilmiştir. İlave olarak, hücresiz kültür sıvılarının siklohegzan, benzen, toluen ve ksileni emülsifiye etme kapasitesiteleri emülsifikasyon indeksinin hesaplanmasi ile belirlenmiştir. 16S rDNA sekans analizine dayalı moleküler tanılamaları sonucunda etkin yüzey ve arayüzey aktivitesi gösteren biyosürfactant üreticisi bakterileri izolatlarının Pseudomonas, Enterobacter, Staphylococcus ve Klebsiella cinlerine üye olduğu tespit edilmiştir. Pseudomonas sp. HYN-8 suşu tarafından üretilen anyonik karakterdeki biyosürfaktan, 40 mm yağ yer değiştirme çapı ile en etkili biyosürfaktan olduğu belirlenmiştir.
Detection of trigonella taxa of North Iraq, phytochemical analysis and physiological activity of some species of trigonella
Trigonella is one of the most important and oldest known medicinal plants in the world. It is used in treating many diseases due to its various effective compounds. Trigonella strangulata Boiss., Trigonella filipes Boiss. and Trigonella uninata Banks & Sol. are three widely used species that grow well in the northern suburbs of Iraq and are highly used in oral consumption and folk medicine. Therefore, the present study was designed to evaluate and identify the effective compounds of these plant species and to investigate their physiological and biochemical effects on biochemical and hematological parameters in rats treated with alcohol and cholesterole. Phytochemical analysis of the seeds and leaves of these three plant species were performed by GC-MS, and their morphological evaluation was performed by SEM electron microscopy. For macro elements, nitrogen (N), phosphorus (P), Potassium (K), Calcium (Ca) and Magnesium (Mg) concentrations of three species were evaluated. The nitrogen and potassium concentration of T. filipes were higher (2.93% and 1.98%, respectively) than two other species. However, the phosphorus and calcium concentration of T. strangulata was higher (0.93% and 3.58%, respectively) than others. Also, the concentration of Magnesium in T. uncinata was the highest (0.96 %). For micro elements, iron (Fe), zinc (Zn), manganese (Mn), and copper (Cu) were evaluated in the studied species. The concentration of iron in T. filipes was the highest (197.5 mg/kg). Zinc concentration was the highest in T. uncinata (18.9 mg/kg), and the concentration of manganese and copper was the highest in T. strangulata (341.2 and 29.1 mg/kg, respectively). The oxidative stress index (OSI), total oxidant status (TOS), and total antioxidant status (TAS) of plant extracts were measured. Cytotoxic activities of Trigonella filipes, Trigonella strangulata, and Trigonella uncinata plants' extracts on 3 different cell lines in different concentrations (1-10-100-1000 µg/mL) after 24 hour of incubation were studied using MTT cytotoxicity assay. DNA-protecting activity of those plants also were studied. Hematological and biochemical variables such as hepatic enzyme activity, glucose, lipid profile, ESR, CRP, renal function tests, and oxidative biomarkers were measured. Histological evaluation was also performed. Among the hematological parameters in the treated groups with different species of Trigonella, only lymphocytes showed a significant change in the treated group with T. uncinata. The levels of liver enzymes, lipid profile, and glucose in the positive group increased significantly compared to the control, while in the groups treated with these three taxa, these parameters were significantly improved. In the positive group, renal function and oxidative indices with ESR showed a significant increase, and treatment with these three taxa was able to improve these parameters. These results were also supported by histological findings. It can be concluded that these three plant taxa have high phytochemical compounds that have physiological effects such as improving the immune status, improving the function of liver and kidney function, and antioxidants effect against induced hepatotoxicity.
Anti-D antibody isolation and identification from fetuses and neonates with hemolytic disease in the erbil city
Rhesus D (Rh⁃D) antigen alloimmunization has been a focus of concern for hematologists and obstetricians. It contributes to perinatal morbidity and mortality. In this study, it was aimed to design a geographic data profile for mothers who are Rh(D) negative and produced Anti-D antibody at Erbil-city. In our study, we collected 1028 (blood samples) from Mothers who is Rh(D) negative and Fathers who are Rh(D) positive. We performed ABO and RhD typing tests for all samples (Fathers and Mothers), then tested all mother samples for Du test and performed antibody screening for all mothers sample. All the mothers' blood samples have been divided into five different Age category 20-25: 35 (7%), 26-30: 165 (32%), 31-35: 191 (37%), 36-40: 112 (22%), and over 40: 11 (2%), Age groups. The most common blood type among Rh-negative mothers was Group O which was (42.4%), followed by A, B and AB groups which were 27.6%, 26.7% and 3.7%, respectively. The highest percentage of Anti-D positive antibody was in (36-40) age category which was 44%, followed by 22% in both (26-30) and (31-35) and 11% in (over 40) Age category, and there was not any positive case inside (20-25) Age category. Haemolytic illness brought on by ABO incompatibility and other alloantibodies have thus become the main cause of hemolytic disease of the fetus and newborn. It is important to provide this data to prevent negative effects on newborns and to provide antigen-negative blood urgently
Endemik Cousinia birecikensis ve Hypericum salsolifolium'dan elde edilen farklı ekstrelerin fitokimyasal analizi ve biyolojik aktivitelerinin incelenmesi
Doğa her zaman insan sağlığına faydalı gıda ve bileşenlerin kaynağı olmuştur ve olmaya da devam etmektedir. Tıbbi bitkiler ve onların biyoaktif molekülleri doğanın ayrılmaz bileşenleridir ve binlerce yıldır insanların sağlığını desteklemiş ve desteklemeye devam etmektedir. Günümüzde bitki özlerinin, antimikrobiyal, antioksidan ve antikanser aktiviteye sahip polifenoller ve karotenoidler gibi biyoaktif bileşikler içermeleri nedeniyle sağlık sektöründe önemi giderek artmaktadır. Bu çalışmanın amacı; endemik Cousinia birecikensis ve Hypericum salsolifolium bitkilerinin antikanser, antioksidan ve takviye edici gıda ürünü olarak kullanım potansiyelini araştırmaktır. Çalışmada; toz haline getirilen bitkilerin farklı polariteye sahip çözücüler (hekzan, diklorometan, metanol ve su) ile bitki ekstreleri hazırlandı. Elde edilen ekstrelerin TPC, TFC ve antioksidan aktivitesi faklı metodlarla (DPPH, ABTS, FRAP, CUPRAC) analiz edildi. Antioksidan aktivitesi yüksek olan bitki ekstresinin fenolik bileşen analizi LC-MS/MS ile, eser element analizi Icp ile analiz edildi. Antikanser aktivitesi; akciğer kanser hücresi (A549) ve prostat kanser hücresi (DU-145), normal akciğer hücresi (BEAS-2B), normal prostat hücresi (PNT-1A) üzerinde antikanser aktivitesi incelendi. Sitotoksik etki MTT ile apoptotik etki annexin-V ve akridin orange yöntemiyle, hücre döngüsü üzerindeki etkisi cell cycle yöntemiyle incelendi. Serbest amino asit ve karnitin profili LC-MS/MS yöntemiyle incelendi. Her iki bitki türünün toplam fenolik ve flavonoid madde metanol ekstresinde yüksek olduğu tespit edildi. Bitki ekstrelerinin antioksidan aktiviteleri metanollü ve sulu ekstrelerde diğer çözücülü ekstrelere göre daha yüksek çıktığı saptanmıştır. Fenolik bileşik olarak H. salsolifolium ekstresinde başlıca siringik asit ve vanilik asit yüksek bulunurken C. birecikensis ekstresinde fumarik asit ve vanilik asit daha yüksek bulunmuştur. Element içerik analizinde başlıca kalsiyum, potasyum, sodyum ve magnezyum değerleri yüksek bulunmuştur. Serbest amino asit profilinde ise; H. salsolifolium ekstresinde glutamin ve valin miktarı çok yüksekken, C. birecikensis ekstresinde prolin ve alanin miktarı yüksek bulunmuştur. Çalışmamızda her iki bitki ekstresinde serbest karnitin ve asetil karnitin miktar olarak en fazla karnitin çeşidi çıkmıştır. Her iki bitkinin metanol ekstrelerinin akciğer kanseri üzerinde sitotoksik etki gösterirken normal akciğer hücreleri üzerindeki sitotoksik etkisinin düşük olduğu tespit edildi. Metanol ekstresinin akciğer kanser hücerelerinde apoptotik etki gösterdiği, hücre döngüsünü G0/G1 fazında durdurarak antikanser aktivite gösterdiği tespit edildi. Yapılan çalışma sonucunda H. salsolifolium ve C. birecikensis endemik bitkilerinin antioksidan ve antikanser potasiyeline sahip olduğu tespit edildiğinden dolayı bu bitkiler ile ilgili ayrıntılı analizlerin yapılması sonucunda insan sağlığına katkı sunacak fitoterapik ürünlere dönüşme potansiyeli olduğu tespit edilmiştir.
Kanserde geleneksel halk ilacı olarak kullanılan bazı bitkilerdeki aktif fenolik bileşiklerin fitokimyasal ve kemoterapötik aktivitelerinin meta analizi
Bu çalışmanın amacı, dünya çapında prevalansı günden güne artan ve çok yüksek bir mortalite oranına sahip olan kansere karşı kemoterapötik ajan tespiti yapmaktır. Bitkilerde aktif bileşiklerin önemli bir grubunu meydana getiren fenolik bileşikler, en aktif antioksidan türevleri olarak yer alırlar ve antikanser ajan olarak da farklı kanser hücreleri üzerinde antikanser etkilere sahiptirler. Bu çalışmaya dahil edilen bitkilerin belirlenmesinde etnobotanik çalışmalardan yararlanılmıştır. Buna göre, kanserde geleneksel halk ilacı olarak kullanıldığı kayıt altına alınmış bazı bitkiler (Malva neglecta, Nerium oleander, Quercus brantii, Rosa canina, Rubus sanctus, Urtica dioica subsp. dioica, Urtica pilulifera ve Vitis vinifera), 24 fenolik bileşik açısından fitokimyasal olarak araştırılmıştır. Veriler, SPSS 27 ve R 4.3.1 istatistik programlarında analiz edilmiştir. İstatistiksel olarak, 15 fenolik bileşiğin bitkilerin kimyasal kompozisyonu içerisinde çok önemli (p<0.01) derecede yer tuttuğu görülmüş ve bu bileşiklerin etki büyüklüğü (η2) belirlenmiştir. Bitkilerin, large etki büyüklüğünde (0.14≤η2) potansiyel aktiviteye sahip 9 başlıca fenolik bileşik içerdiği tespit edilmiştir. Bu bileşiklerin kemoterapötik aktiviteleri, meta analiz ile belirlenmiştir. Bitkilerin, 13 kanser türü üzerinde antikanser aktivite potansiyeline sahip olduğu saptanmıştır. Kanser türleri üzerinde en yüksek düzeyde antikanser aktivite potansiyeli gösteren bitkiler şu şekildedir: Akciğer kanseri; Q. brantii, U. pilulifera ve V. vinifera, Cilt kanseri; U. pilulifera, Endometriyal kanser; U. pilulifera, Glioblastoma Multiforme; Q. brantii, Karaciğer kanseri; M. neglecta, U. pilulifera ve V. vinifera, Kolorektal kanser; Q. brantii, R. canina, U. pilulifera ve V. vinifera, Kronik Myeloid Lösemi; N. oleander, Meme kanseri; N. oleander, Q. brantii, R. canina ve V. vinifera, Mesane kanseri; R. canina, Mezotelyoma; Q. brantii, Prostat kanseri; Q. brantii ve U. pilulifera, Rahim ağzı kanseri; Q. brantii ve R. canina, Yumurtalık kanseri; V. vinifera. Ayrıca kanser türleri üzerinde başlıca fenolik bileşik seviyesinde 6 farklı kemoterapötik ajan içeriği ile R. canina'nın ve U. pilulifera'nın fitokimyasal açıdan en zengin bitkiler olduğu tespit edilmiştir.
Mersin'deki eczanelerde ve aktarlarda fitoterepide kullanılan bitkiler
Bu araştırmada 2023 senesinde Mersin kentindeki eczane ve aktarlarda fitoterapi hedefli satışa sunulan bitkisel ürünlerin varlığını tespit etmek için yapılmıştır. Son yıllarda modern tıptaki ilerlemenin olmasına rağmen devam etmekte olan geleneksel tıp uygulama alanları süreç olarak devam etmektedir. Hasta insanların geneli aktarda satılan bitkilerden kendi ilacını hazırlayıp, kullanmaktadır. Birçok bitki türlerinin doğadan elde edilmekte olup, buna ek ilave olarak aktar, internet ve medya sanal alanlarından elde edilebilmektedir. Aktarlar ziyareti sonucunda elde edilen numuneler stereo mikroskop altında gözlemlenip incelenmesi, gerekli teşhisleri elde edilmiş ve bitkilerin nerelerinin kullanıldığı tespit edilmiştir. Satışa sunulan numuneler arasında en fazla romatizma, diyabet, kalp hastalıkları, boşaltım sistemi hastalıkları, kanser tedavisi sürecinde tercih edildiği gözlemlenmiştir. Mersin yöre halkı aktarlardan en çok zayıflamak ve kış aylarında soğuk algınlığına iyi gelen bitkileri tercih etmektedir. Bu çalışmada Mezitli, Merkez, Çamlıyayla, Erdemli ve Tarsus gibi ilçelerindeki aktar ve eczanelerde fitoterapi amaçlı satışa sunulan bitkiler hakkında araştırma yapılmış ve 41 kaynak kişi ile görüşmeler sağlanmıştır. Etnobotanik özelliklere sahip çalışmada ortalama 23 eczane ve 18 aktar ziyaret edilmiştir. Yapılan çalışmalar sonucunda 58 familyanın yer aldığı 122 türde 105 taksonun yer aldığı tespit edilmiştir. Merkez ve Tarsus'taki eczanelerde ve aktarlarda satılan bitki türlerinin benzerlik oranının fazla olduğu tespit edilmiştir. Ziyareti yapılan aktar ve eczanelerde en sık tercih edilen ürünler arasında zayıflama, saç bakım yağları, baş ağrısı, soğuk algınlığı, grip, cilt problemler, sindirim problemleri, kalp damar rahatsızlıkları ilk sırada satışa sunulmaktadır. Soğuk kış aylarının vazgeçilmez fitoterapi bitkileri arasında Tilia (ıhlamur), Salvia officinalis (ada çayı), Curcuma longa (zerdeçal), Zea Mays (mısır püskülü), Zingiber officinale (zencefil), Althaea officinalis L. (hatmi çiçeği), Mentha Piperita (nane limon) ilk sıralarda yer almaktadır. Sıcak mevsimi olan yaz aylarında zayıflamak veya mide rahatsızlıkları için bitkilerden faydalanılmaktadır. Özellikle yaz aylarında Stipites Cerasarum (kiraz sapı), Ilex paraguariensis (mate yaprağı), Salvia hispania L. (chia tohumu), Cassia (açlık otu), Rosmarinus officinalis L. (biberiye) satışı en çok olan bitkiler arasında yer almaktadır. ANAHTAR KELİMELER: Mersin, Aktar, Fitoterapi, Bitkisel Droglar, Tedavi
Sıvı yosun gübresinin farklı dozlarının tuz stresi koşullarında arpa gelişimi ve rizosferdeki bazı biyolojik özelliklere etkisi
Bu çalışmada, arpa gelişimi ve rizosferdeki bazı mikrobiyolojik özellikler üzerine sıvı deniz yosunu gübresinin tuz stres koşullarındaki etkisini belirlemek amaçlanmıştır. Deneme serada yapılmıştır. Denemede ticari olarak satılan yosun gübresi kullanılmıştır. Sıvı deniz yosun gübresi ekimle birlikte topraklara dozda (% 0, % 0.4, % 0.8, % 1 ve % 2 yosun gübresi) uygulanmıştır. Tuz ise 3 dozda (0 mM, 75 mM ve 150 mM) uygulanmıştır. Bitkiler ekimden 12 hafta sonra hasat edilmiştir. Arpa bitki boyu, yeşil aksam ve kök yaş ve kuru ağırlıkları, kök uzunluğu, yaprakların klorofil içerikleri, kök bölgesi β-glukosidaz ve alkalin fosfataz enzim aktiviteleri gibi bazı toprak biyolojik özellikleri incelenmiştir. Elde edilen veriler ile uygulamalar arasındaki farklılık istatistik analiz ile ortaya konulmuştur.
Pistacia vera L. kabuklarının soya (Glicine max L.) nın büyüme ve gelişimine etkisi
Bu tez çalışmasında baklagiller familyasından olan soya dünyada en önemli endüstri bitkilerindendir. Soya farklı endüstri kolları için hammadde sağlamasının yanında, değişik şekillerde insan ve hayvan beslenmesinde önemli rol oynamaktadır. Soya ve soya yağı insana faydalı yağ asitlerini içermesinden dolayı şeker, koroner kalp ve damar sertliği gibi hastalıkları olan kişilere önerilmektedir. Soya bitkisinin ana vatanı uzak doğu iken ekonomik olması bakımından başka ülkelerde de yetiştirilmeye başlamış bir bitkidir. Bitkisel proteini yüksek, unundan ekmek yapılabilen, sütünden faydalanılabilen, yemeklik yağı olan endüstriyel bir bitkidir. Yukarıda bahsedilen bilgiler ışığında bu tez çalışmasında hormon etkisi yapan Pistacia vera L. yumuşak dış kabuklarının soya (Glicine max L.) bitkisinin yetiştirilmesi amaçlanmaktadır. Soya yağlı bir bitki olduğundan sıcaklık şartlarına adaptasyonu önemlidir. Daha önce tarafımızdan yapılan birçok araştırmada soyanın tolerans sınırı artırılmaya çalışılacaktır. Bu çalışmada ise önceki deneyimlerimize ve literatüre kazandırılan bilgiler ışığında ekonomik değeri olan soya bitkisinin bölgeye adaptasyonu akımından yetiştirilmesi için önemli bir çalışma olacaktır.
Farklı ışık şiddetlerinde yetiştirilen soya (Glycıne max L.) bitkisinde bazı enzim miktarının belirlenmesi
Bu çalışmada bitkiler âleminde zengin içeriğiyle öne çıkan soya (Glycine max L.) bitkisi kullanılmıştır. Soya bitkisinin varlığı insanlar tarafından 3-4 bin yıl öncesine kadar bilinmektedir. Protein bakımından oldukça zengin olan soya bitkisinden, süt, yağ, un üretilmekte artan küspesinden bile hayvan yemi olarak kullanılmaktadır. Hem endüstriyel hem de ekonomik değeri olan soya bitkisi 28 gün boyunca, laboratuvar ortamında farklı dalga boylarındaki yedi renk (mor, mavi, mavi yeşil, yeşil, sarı, turuncu ve kırmızı) altında yetiştirilmiştir. 28. günün sonunda hasat edilen örneklerde klorofil, MDA, antosiyanin ve bazı enzim aktivite miktarları ölçülmüştür. Bitkide olumsuz etmenlere karşı belirleyici parametre olarak yer alan klorofil, antosiyanin ve MDA, bitki gelişiminde birbirlerini destekler yönde etkilenmiştir. Bitkide tolerans belirleyici olarak bulunan enzim aktiviteleri de diğer parametreleri destekler miktarda bulunmuştur. Buna göre birim alandan verimli ürünler alabilmek için ışık kalitesi, dayanıklı bitki türleri gibi faktörler bitkinin yetişmesi ve verimli ürün elde edilmesi için önem arz etmektedir. Sonuç olarak kırmızı, turuncu ve sarı renklerin bitki büyüme gelişme ve enzim aktivitelerinde belirleyici tolerans artırıcı etki yaptığı anlaşılmıştır.
Cladophora sp. ve Microcystis sp. alglerinin biyolojik gübre olarak, oğul otu (Melissa officinalis L.) bitkisinin gelişimi ve büyümesi üzerine etkisi
Bu çalışma oğul otu (Melissa officinalis L.) türünün en uygun yetiştirme ortamlarının geliştirilmesi ve belirlenmesi amacıyla, Cladophora sp. ve Microcystis sp. alg gübrelerinin altı farklı kuru dozu (Kontrol, %0.2; %0.4; %0.6; %0.8; %1) ve karışımları ise (%50+%50 olarak) toprağa sıvı olarak üç defa uygulanmıştır. Deneme üç tekerrürlü olarak 13.10.2022 ile 12.06.2023 tarihleri arasında Biyoloji Bölümü Serası'nda 7 litrelik saksılarda yapılmıştır. Araştırma sırasında oğul otu kalitesinin bazı ayırt edici özelliklerinden olan; en kısa ve en uzun dal uzunluğu, yaş ve kuru aksam ağırlığı, yaş ve kuru kök ağırlığı, yaprak sayısı, ortalama dal sayısı, klorofil verimi gibi kıstaslar incelenmiştir. Elde edilen sonuçlar istatistiki olarak değerlendirilmiştir. ANAHTAR KELİMELER: Bitki gelişimi, Cladophora sp, Microcystis sp., Karışık alg kültürü, Oğul otu (Melissa officinalis L.)
Karkamış Baraj Gölünde yetiştirilen alabalıklardan aeromonas bakterilerinin izolasyonu ve litik bakteriyofajlarının araştırılması
Bu tez çalışmasında amaç, Karkamış Baraj Gölü'nde yetiştirilen ve hastalık semptomları göstererek ölen alabalıklardan Aeromonas türlerini izole etmek ve çevresel örneklerden bu türlere spesifik litik bakteriyofaj varlığını araştırmaktır. Bu çalışmada Şanlıurfa iline bağlı farklı konumlardaki 4 farklı çiftlikten farklı zaman periyotlarında, bakteriyel izolasyon için toplam 96 ölü gökkuşağı alabalığı ile bakteriyofaj izolasyonu için su ve bentos örnekleri toplandı. Balıklara uygulanan nekropsi sonrasında, deri lezyonları ve balıkların çeşitli organlarına ait 138 inceleme örneğinden klasik bakteriyel izolasyon ve identifikasyon yöntemiyle Aeromonas'ların izolasyonu için ekimler yapıldı. Elde edilen izolatların doğrulama analizleri MALDİ-TOF ile gerçekleştirildi. Balıklardan 18 adet Aeromonas etkeni izole edildi. Bu etkenlerin altısının Aeromonas veronii, dördünün Aeromonas hydrophila, dördünün Aeromonas sobria, ikisinin Aeromonas ichthiosmia, birinin Aeromonas caviae ve birinin de Aeromonas bestiarum olduğu tespit edildi. Bakteriyofajların tespiti için alınan su ve bentos örneklerine ön zenginleştirme işlemi uygulanarak şüpheli süspansiyonlar hazırlandı. Bu süspansiyonlardan elde edilen izolatlar ile spot-test yapılarak bakteriyofaj içeriği yönünden araştırıldı. Bir adet çiftlikten elde edilen Aeromonas hydrophila bakterisine karşı litik aktivite gösteren 1 adet faj belirlenerek izole edildi. İzole edilen faj çift tabaka agar yöntemiyle saflaştırıldı, besiyerinde konakçısıyla çoğaltıldıktan sonra faj titresi 6.40 x 108 Pfu/ml olarak belirlendi. Optimal MOI değeri 0.1 bulundu. Faj, pH 3-11 ve sıcaklık 4-60°C aralıklarında test edildi. Fajın pH 5-9 ve sıcaklığın 4-40°C arasındaki test ortamlarında stabil olduğu tespit edildi. Bakteriyofaj morfolojik inceleme amacıyla geçirimli elektron mikroskobunda (TEM) görüntülendi. Fajın Siphoviridae familyasına ait olabileceği morfolojik olarak belirlendi. Fajın moleküler analiziyle, daha önce tanımlanarak gen banka bilgileri girilen Aeromonas'ların T7-Ah ve PZL-Ah152 fajlarına genetik olarak çok yakın bir faj olduğu görüldü. Sonuç olarak Şanlıurfa bölgesinde Karkamış barajında üretim faaliyetleri gösteren balık çiftliklerinde Aeromonas etkenlerinin enfeksiyonlara sebep olduğu, etkenlerle birlikte bakteriyofajlarının da izole edilebileceği görüldü. Hastalıklardan korunma için gerekli tedbirlerin alınabileceği ve bakteriyofajların koruma ve tedavide kullanılabilirliğiyle ilgili ileri çalışmaların yapılması gerektiği kanaatine varıldı. ANAHTAR KELİMELER: izolasyon, enfeksiyon, Aeromonas, bakteriyofaj, balık
Antimicrobial effects of fluor bearing schiff base derivatives and their metal complexes on Streptococcus pyogenes, Proteus mirabilis and Klebsiella pneumoniae
The development of resistance in pathogens to existing drugs is one of the world's biggest health problems. In this study, in order to contribute to new antibacterial drug research, two fluorophenyl-butylsalicysyl aldimine Schiff base ligands and their antibacterial activities on Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis and Streptococcus pyogenes containing copper and palladium complexes were investigated by MTT analysis. Chemicals and positive control (gentamicin) were seeded on microplates in triple order as 1μM, 10μM, 100μM and 1000μM, and bacterial strains were added at a dose of 0.5 McFarland. After 18 h incubation, dimethyl sulfoxide was used as a solvent to dissolve formazan crystals after applying MTT dye as a viability indicator to determine the MIC50 values of each of the compounds. OD values obtained with a microplate reader at 570 nm wavelength for each well were used to calculate the MIC50 of each chemical. Gentamicin MIC50 values were determined to be 2.09, 1.873, and 1.68 µM for K. pneumoniae, P. mirabilis, and S. pyogenes, respectively, and the strongest MIC50 values against K. pneumoniae and P. mirabilis were 6 by C1 and C4, respectively. It was determined as .06 and 5.314 µM. While S. pyogenes exhibited strong activity against almost all compounds, the most effective MIC50 value was determined as 3.728 µM with C3. In our study, we think that the strong antibacterial effect of Schiff base copper complex on S. pyogenes is particularly noteworthy.
Phenotypic and genotypic detection of clinical staphylococcus aureus isolates and their ability to form biofilm under different antibiotics
Staphylococcus aureus is the main pathogen, which can harm tissues, causing severe chronic, and recurrent infections that need extended antimicrobial therapy. Methicillin-resistant S. aureus's (MRSA) ability to produce biofilm is promoting the bacteria's spread and making it difficult to treat. Bacterial biofilm formation is frequently enhanced in the existence of antibiotics with sub-minimum inhibition concentrations (sub –MICs). The study aimed to evaluate the effectiveness of sub-inhibitory concentrations of antibiotics on biofilm formation. In a cross-sectional plan, a total of 40 S. aureus were isolated in Erbil hospitals from July to November 2023. Identification of isolates was carried out by the standard methods, the Vitek®2 system, the nuc gene, and 16S rRNA with specific primers. All isolates were tested for sensitivity toward 18 antibiotics using the common disc diffusion technique and Vitek®2 system. Biofilm formation by all the isolates was estimated by tube adherent and micro plate methods. The induction of biofilm by 1/2 and 1/4 MIC of four antibiotics were determined by a crystal violet assay. All the obtained data were statistically analyzed by GraphPad prism and SPSS programs. The study revealed that S. aureus had a high resistance to benzylpenicillin (90%), cefoxitin (75%), oxacillin (67.5%), erythromycin (52.5%), and clindamycin (50%). Screening for MRSA showed that 75% of the isolates were MRSA. For biofilm production (40%), (32.5%), and (12.5%) of isolates were strongly, moderately, and weakly positive, respectively, and (15%) didn't show biofilm formation. In the selected 10 strains, biofilm formation increased in an average from 35% to 55% by using 1/2 MIC and 1/4 MIC of the antibiotics. Our findings concluded that the effect of sub-MICs of various antibiotics on biofilm formation may make treatment difficult and lead to the creation of chronic infections.
Phenotypic and molecular detection of bio-ecological cutaneosis leishmanisis vector (diptera: psychodidae), with diagnosis cutaneous leishmaniasis in patients in Erbil province, Iraq
Phlebotomine sandflies are an important group of insects from a medical perspective that are responsible for the transmission of leishmaniasis. The phenotypic and genotypic investigation of species of sand flies (Al-Harms) as the vector of CL, with the microscopic investigation of bio-Ecological CL in Patients was conducted in the Erbil province-Iraq for the first time between January and December 2022. Out of 2054 collected samples 1137 (55.4%) were male and 917 (44.6%) were female. statistically, there is no correlation between gender and sandfly species at (P=0.20). Three species were identified as belonging to the genus Phlepotomus: P. papatasi, P. sergenti, and P. alexandria. P. papatasi was the most common species, with 1163 (15.6%), followed by P. sergenti 598 (29.1%), and P. alexandri 293(14.1%). There were two peaks of seasonal abundance of sand flies, the first peak of the seasonally abundant CL vectors occurred in May, while the second peak occurred in September, statistically, there is a correlation between the periods and sand fly species at (p<0.05). This study used sequencing analysis of the mtDNA COI gene region to verify the results of morphological identification of sandfly species in Erbil province, Iraq. The current work used PCR-direct sequencing to find and identify P. papatasi, P. sergenti, and P. alexandria. originated from Erbil province endemic CL. According to a phylogenetic tree analysis using the Phlebotomus species standard NCBI BLAST program, local Phlebotomus papatasi, Phlebotomus sergenti, and Phlebotomus alexandri isolates from various places in the Erbil province were subjected to DNA sequencing. Phlebotomus papatasi, Phlebotomus sergenti, and Phlebotomus alexandri isolates from the local area were used to analyze the mtDNA COI gene sequence using M'EGA 6.0, a multiple alignment analysis tool. The city's health system must take the necessary precautions to control sand fly species as the vectors of CL disease. Controlling the sandflies will be a key to controlling (CL) disease. The microscopic investigation was carried out using oil immersion light microscopy (100X) subsequent to the staining of smear samples, due to of getting treatment or contamination the human CL cases: only 82(65.6%) cases were positive CL, out of 135 obtained from human patients' cases. There was significant difference between the genders at (P>0.05) in the CL rate, which was higher in males than females 84(62.2%) versus 51 (37.8%). CL had a significant frequency and was the most frequent endemic disease in the Makhmur district. In this investigation, 82patients (65.6%) were shown to have CL infection in a lab setting. A CL infection is more likely to affect younger age groups. The investigation discovered two cases of severe and numerous CL lesions in children younger than a year old. At 63 cases (46.6%), CL was most common in the 1 to 25-year-old age range. In terms of clinical outcomes, the most frequently affected areas by CL were the upper limbs in 62/135 patients (45.9%), the lower limbs in 39/135 patients (28.9%), and the face (including the ears and nose) in 28/135 patients (20.7%). Additionally, 6/135 patients (4.4%) had several organs in their bodies where CL lesions were found. P<0.05 indicates that these results are statistically significant. According to the findings, february 2022, January 2022, March 2022, December 2022 and November 2022 all had higher infection rates (31.9%, 20%, 9.6%, 6.7% and 5.9% respectively). Following that, there was a significant decline in the rates. According to the findings, the rate of infection was highest in the months of February, January, and March at moderate mean temperatures (Cº). In contrast, the rate decreased in the hotter months of April, May, June, July, August, and September (infection rates: 4.4%, 6.7%, 3.7%, 3.7%, 3.7%, and 3.7%, respectively), but it was zero in October. Significant variations in the rate of CL were seen in these data at (P<0.05). The winter months of January, February, and December had the highest percentage, while the summer and fall had the lowest. The study tries to find out the correlation between emerging of sand flies spp. and CL cases. In the lighting of study findings, the study noticed a strong relationship between emerging sand flies spp. and CL disease. In comparing the Leishmania parasite incubation period to the emergence of Sandflies and CL cases, statistical analysis reveals significant differences at (P<0.05). There were two peaks of existing CL. along the year, first peak was in February and the second peak was in December.
Antibacterial activity of fluorinated 3,5'-di-tert butylsalicylaldehyde ligands with palladium and copper complexes against some pathogenic bacteria
After a while, following the advantages provided by the discovery of antibiotics, attention quickly turned to drug resistance due to the development of antibacterial resistance in bacteria. This breakthrough of resistance led to exploring new ways of treating infectious diseases like the invention of new compounds including Schiff bases with their metal complexes that can create a new class of antimicrobial drugs with exciting potential. In this study, the antibacterial activity of fluorinated 3,5'-di-tert butylsalicylaldehyde Schiff base ligands with their palladium and copper complexes (6 compounds) were tested against Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, and Streptococcus pyogenes. The MTT method was used to determine the MIC₅₀ values of gentamicin and each tested compound. The compounds and the antibiotic were prepared in four concentrations: 1 μM, 10 μM, 100 μM, and 1000 μM, and were added to 96-well culture plates with 100 μL of bacterial suspension (0.5 McFarland) followed by MTT application and reading plates by by ELIZA plate reader at 570 nm. The results showed an MIC50 value of 1.91 μM for gentamicin against K. pneumoniae, 1.92 μM, and 2.09 μM against P. mirabilis and S. pyogenes, respectively. The MIC50 values of Schiff base compounds ranged between 10.82 to 25.44 μM for K. pneumoniae, 5.28 to 11.12 μM for P. mirabilis, and 3.11 to 5.10 μM for S. pyogenes. The most effective compound for both P. mirabilis and S. pyogenes was (Bis(2,4,6-trifluorophenyl-3,5-di-tert- butylsalicilaldiminato) Cu(II)) with an MIC50 value of 5.28 μM and 3.11 μM, respectively. While for K. pneumonia it was (3,4,5-trifluorophenyl-3,5-di-tert-butylsalicilaldiminato) with an MIC50 value of 10.82 μM. The fluorinated Schiff bases showed moderate to good antibacterial activities. The effectiveness of the copper complexes of the compounds on both gram-negative and gram-positive bacteria was more significant than their corresponding ligands.
Determining antimicrobial activities of tri- and tetra-fluorine bearing Schiff base ligands against infectious bacteria
Treatment of infectious diseases is becoming increasingly complex for medical professionals. One of the main reasons is the increase in drug-resistant bacterial species. For this purpose, there is a great need for the discovery of new antibacterial drugs. Schiff bases are organic compounds with proven potential against bacteria, fungi, and viruses, especially cancer. Adding fluorine atoms to Schiff bases to increase their antimicrobial properties is one of the latest approaches. Our research is based on testing the antibacterial effect of six fluorinated Schiff base derivatives (C1-6) in comparison with gentamicin against three infectious bacterial species: Streptococcus pyogenes, Klebsiella pneumoniae, and Proteus mirabilis. The MIC50 values of each compound on the tested bacteria were determined using the colorimetric MTT method. MIC50 values of each compound were calculated using OD data. In general, Schiff base compounds were found to be more effective against S. pyogenes, with MIC50 values ranging from 4.03 to 8.17 μM, with C6 (4.03 μM) showing the strongest antibacterial activity. The MIC50 values of the compounds against K. pneumoniae varied widely, from 13.29 to 23.59 μM, and the MIC50 values for P. mirabilis ranged from 8.77 to 88.13 μM. It is concluded that fluorinated Schiff base derivatives should be examined in more detail with further analyses and in vivo studies, especially in terms of S. pyogenes.
Antibacterial effects of chlorine bromine and methyl bearing Schif base derivatives on P. mirabilis, S. pyogenes and K. pneumoniae
Schiff bases are crucial class of ligands in the field of co-ordination chemistry. Schiff bases have been employed in treating a wide range of diseases because of their biological activity. We employed artificial chlorine bromine methyl bearing Schiff bases to study their effects on three strains of pathogenic microorganisms Proteus mirabilis, Streptococcus pyogenes and Klebsiella pneumoniae resistant to most antibiotic. After dissolving the compounds in ethanol, they were added in triple order 1 µM, 10 µM, 100 µM, and 1000 µM to 96-well culture plates. The same concentrations of gentamicin served as positive controls. Following adjustment to the 0.5 McFarland standards for the nutrient broth, 100 µL of bacteria suspension was added to each well and incubated at 37 °C. Once the incubation period had lasted for four hours, each culture well received a dose of 10 µL of MTT solution at a 250 µM concentration. The formazan produced by live bacteria was then dissolved by adding DMSO. The MIC50 for gentamicin against K. pneumoniae was 2.6 µM, while for P. mirabilis and S. pyogenes was 2.59 and 2.26 respectively. We measured the optical density (OD) of each well of culture plates by using an ELIZA micro-plate reader at 570 nm. MIC50 values for each compound were determined through the application of nonlinear regression analyses as a result, the MIC50 values against Streptococcus pyogenes varied from 6.27 to 38.00 µM. While the effectiveness of SB compounds against Proteus mirabilis ranged from 7.59 to 32.60, µM. However, the MIC50 for Klebsiella pneumoniae was between 19.80 and 80.90 µM. Based on their different cellular structure the compound ligands had effects differently on these bacteria.
Farklı akrep türlerinde zehir bezlerinin transkriptomik analizi vezehrin amino asit profilinin incelenmesi
Akrep zehri, enzimler, toksik peptitler, serbest amino asitler, karbonhidratlar, lipitler ve diğer metabolitler dahil olmak üzere farklı biyolojik olarak aktif bileşiklerin karmaşık karışımlarından oluşur. Hayvan zehirleri üzerine yapılan çalışmalar, yeni biyoaktif moleküllerin keşfedilmesi için fırsatlar yaratan teknolojik ilerlemelerle sürekli olarak geliştirilmiştir. Proteomik,transkriptomik,genomik ve metabolomik gibi zehir araştırmalarına yönelik "omik" teknolojilerinin tanıtılması, büyük ölçekli veri toplamayı ve bunların analizini mümkün kılmıştır. Farklı akrep türleri üzerinde yaptığımız zehir bezi transkriptom analizlerinde elde edilen zehir dokusundan QIAGEN izolasyon kitiyle RNA izole edildi. İzole edilmiş RNA materyalinin kütüphane hazırlığında, Illumina Stranded mRNA Prep kiti (Illumina, ABD, #20040534) kullanıldı. Biyoinformatik analizlerde diziler, fastp v0.23.4 kullanılarak düzenlendi ve filtre edildi. Bu işlem sırasında 3' ve 5' uçlarındaki minimum kalite değeri 30 (1bp ile), minimum ortalama okuma kalite değeri 30, minimum belirsiz baz sayısı 0 ve minimum okuma uzunluğu 100bp olarak ayarlandı. Aminoasit çalışması için JASEM aminoasit kiti kullanıldı. Analiz için LC-MS/MS cihazında ki HPLC kısmında bulunan tepsi bölmesine yerleştirildi ve okutuldu. Sonuç olarak Androctonus carssicauda türünde 8 farklı protein elde edildi. En uzun aminoasit dizisi colorectal mutant cancer protein-like isoform X1 proteininde 974, en kısa aminoasit dizisi apoptosis regulator R1-like proteininde 189 olarak elde edildi. Hottentotta saulcyi türünde 8 farklı protein elde edildi. En uzun aminoasit dizisi breast cancer anti-estrogen resistance protein 3-like proteininde 910, en kısa aminoasit dizisi apoptosis regulator R1-like proteininde 189 olarak elde edildi. Leiurus abdullahbayrami türünde 7 farklı protein elde edildi. En uzun aminoasit. dizisi colorectal mutant cancer protein-like isoform X2 proteininde 970, en kısa aminoasit dizisi apoptosis regulator R1-like proteininde 189 olarak elde edildi. LC/MS MS sonuçlarına göre A. crassicauda akrep zehrinde; taurin, alfa aminobütirik asit, fosfoetanolamin, lizin, lösin ve arginin amino asitlerinin varlığı tespit edildi. H. saulcyi akrep zehirinde; taurin, lizin, fosfoetanolamin, arginin, alfaaminopimelik asit ve lösin amino asitlerinin varlığı tespit edildi. L. abdullahbayrami akrep zehrinde; alfa amino bütirik asit, taurin, lizin, fenilalanin, arginosuksinik asit, lösin, histamin, arginin, prolin amino asitlerinin varlığı tespit edildi.
Oleuropeinin meme kanseri üzerindeki fitoöstrojenik etkisinin incelenmesi
Östrojen, meme dokusunun normal gelişiminde önemli bir rol oynar ve aynı zamanda meme kanserinin ortaya çıkışını ve ilerlemesini destekleyebilir. Östrojen, hücre çoğalmasını teşvik etmek için meme dokusu hücrelerinde bulunan östrojen reseptörlerine (ER-α ve ER-β) bağlanır. Ancak, yüksek östrojen seviyeleri, hücre bölünmesini artırarak mutasyonların birikmesine ve karsinojenez sürecinin başlamasına neden olabilir. Ayrıca östrojen, oksidatif metabolizma sonucu oluşan genotoksik metabolitler aracılığıyla da meme kanserini tetikleyebilir. Çoğu meme kanseri vakası östrojen reseptörü pozitif [ER(+)] olduğu için östrojen reseptörleri önemli bir tedavi hedefi haline gelmiştir. Ancak, hastaların klinik tedavilere ek olarak alternatif yöntemlere yönelmesi hastalığın seyri üzerinde olumlu veya olumsuz etkiler yaratabilir. Bu nedenle fitoöstrojenik aktiviteye sahip bitkiler veya fitokimyasalların çeşitli tümör modelleri üzerindeki etkinliklerinin test edilmesi önemlidir. Bu çalışmada, oleuropeinin meme kanseri hücrelerindeki östrojen reseptörleri ile etkileşimi incelenmiştir. Farklı sürelerle, tek başlarına ve kombine olarak 5 florourasil veya oleuropein uygulanmış Ehrlich asit tümörü (EAT) taşıyan farelerden elde edilen tümör hücrelerinde östrojen reseptörlerinin (ER-α ve ERβ) varlığı ve ekspresyon durumları mRNA ve protein düzeylerinde araştırılmıştır. Sonuçlara göre, EAT inokülasyonundan sonraki 2. gün başlanarak 6 gün boyunca oleuropein verilen farelerde ve 5 florourasil uygulanan gruptaki farelerde ESR2 ekspresyonunda anlamlı bir değişiklik tespit edilmemiştir. Ancak bu iki bileşiğin kombinasyon halinde uygulanması durumunda, ESR2 ekspresyonu hem kontrole hem de sadece 5FU uygulanan gruba göre artmıştır. Western blot analizi sonuçları PCR bulgularıyla uyumlu olup, ER-β protein ifadesi 5FU verilen grupta artmış, OL'nin tek ve kombinasyon olarak verildiği gruplarda kontrol ile benzer bulunmuştur. ER-α'nın protein ifadesi ise 5FU'nun tek başına veya oleuropein ile kombinasyon halinde uygulanmasıyla azalmış, oleuropeinin tek başına uygulanması kontrol ile benzer bir etki göstermiştir. Oleuropeinin meme kanserinden koruyucu etkisini araştırmak için oluşturulan grupta, ER-β'nın mRNA düzeyindeki ekspresyonu artarken ER-α ve ER-β protein ifadesi azalmıştır. Bu bulgu, oleuropeinin uzun süreli alımında ER-β mRNA ekspresyonunu artırırken bu mRNA'ların fonksiyonel olmayabileceğini ve proteine dönüşmesinin başka bir mekanizma ile engellendiğini düşündürmektedir. Tümör inisiyasyonu üzerinde oleuropeinin etkisini gözlemlemek için 8 gün uygulamanın ardından ER-β'nın ekspresyonunun hem mRNA hem de protein düzeyinde arttığı, ER-α'nın protein ifadesinin ise kontrol ile benzer olduğu belirlenmiştir. Oleuropeinin meme kanseri hücrelerinde östrojen reseptörleri ile etkileşime girebildiği ve bu reseptörlerin ekspresyonunda değişikliklere neden olabildiği gözlemlenmiştir. Özellikle kemoterapi alan hastalarda oleuropein kullanımı, ilacın etkinliğini değiştirebileceğinden hastalarının oleuropein kullanımında dikkatli olmaları önerilmektedir.
Cladophora sp ve mikorizanın mısır gelişimi üzerine etkisi ve rizosferdeki bazı enzimler üzerine etkisi
Bu çalışmamızda mikoriza mantarı aşılaması ve Clodophora sp. ekstratı kullanımının ayrı ayrı ve ortak uygulamalarının mısır bitkilerinin temel bitki büyüme özellikleri, rizosferdeki alkalin fosfataz, dehidrogenaz,üreaz ve ß- glukozidaz enzim aktiviteleri üzerine etkileri değerlendirilmiştir. Çalışma serada tesadüf parselleri faktöriyel deneme desenine göre 3 tekrarlı olarak kurulmuştur deneme iki faktörlü olarak yürütülmüştür. Birinci faktör mikoriza aşılaması (aşısız, 5 g/kg, 10 g/kg,15 g/kg ile aşılı), ikinci faktör Clodopora sp. (%0, 0.5, 1, 1.5) uygulamasıdır. Uygulamaların etkileri temel bitki büyüme özellikleri üzerinde farklı olmuştur Clodophora sp' nin %1.5'luk ekstratı ve 15 g/kg mikoriza aşılamasının birlikte uygulanması ile alkalin fosfataz, üreaz, dehidrogenaz enzim aktivitelerinde en yüksek değer elde edilmiştir. Clodophora sp'nin %1'lik ekstratı ve 10 g/kg mikoriza aşılamasının birlikte uygulanması ile en yüksek ß- glukosidaz aktivite elde edilmiştir. Mikoriza ve Clodophora sp'nin birlikte uygulanması bitki kök bölgesi yani rizosferdeki bazı enzim aktivitelerini artırarak daha sağlıklı bir rizosfer ile bitki kalitesini artırmak için çevre dostu bir strateji olarak sunulabilir.
Bor elementinin soyada (Glycıne max L.) sıcaklık stresine karşı etkisinin araştırılması
Deney materyali olarak soya (Glycine max L.) kullanılmıştır. Soya tohumları magentalarda besi ortamında çimlendirilerek daha sonra saksılara perlit ortamına alınmıştır. Saksı ortamına alınan soya fidelerine %25, %50, %75 ve %100 oranında potasyum tetraborat dekahidrat [K2B4O7 4H2O] bor bileşiği, 6 gün ve 25±2, 12 gün ve 30±2 ve 18 gün ve 35±2 ºC de sıcaklık stresi altında ayrı ayrı bitkiler yetiştirilmiştir. 18. günün sonunda bitkiler hasat edilerek klorofil, MDA, prolin ve iyon (Na+, K+ ve Ca++) analizleri yapılmıştır. Soya bitkisinin bor konsantrasyonlarına ve zamana vereceği tepkiler farklı olmakla beraber genel olarak borun yüksek dozlarının daha iyi etki yaptığı düşük dozların ise borun olumlu etkisini azalttığı anlaşılmıştır. Prolin ve bor negatif etkilere karşı koruyucu özellik göstermiştir. Sıcaklığa dayanacak bitki çeşidi ve seçimi, toprak yapısı gibi birçok faktör ile ilgili dikkatli seçimler yapılarak birim alandan, en yüksek bitkisel verim alınacağı sonucuna varılmıştır. Böylece, %0.75 ve %100 mM bor dozunun sıcaklık stresi olan alanlarda tolerans artırıcı etki yaptığı anlaşılmıştır. ANAHTAR KELİMELER: bor, soya, sıcaklık, prolin, iyon
Schiff bazlarının 5 florlu türevlerinin bazı patojen bakteriler üzerinde antibakteriyel etkilerinin araştırılması
Çok sayıda yeni tedavi yönteminin araştırılmasına rağmen, antibiyotikler mikrobiyal hastalıklar için birincil tedavi aracı olmayı sürdürmektedir. Tıpta önemli olan birçok Schiff bazı türevinin kullanıldığı araştırmalar, bu maddelerin antimikrobiyal özelliklere sahip olabileceğini düşündürmektedir. Bu çalışmada, beş flor içeren Schiff bazı türevleri, Proteus mirabilis, Streptococcus pyogenes ve Klebsiella pneumoniae gibi ilaca dirençli organizmalar üzerindeki antibakteriyel özellikleri açısından değerlendirildi. Bileşikler (1-6) etanol içinde çözüldükten sonra, 1, 10, 100 ve 1000 μM konsantrasyonlarında 96 oyuklu kültür plakalarına üçlü düzende ekildi. Gentamisin pozitif kontrol, etanol ise negatif kontrol olarak kullanıldı. Besiyerindeki bakteriler 0.5 McFarland standardına ayarlandı ve her bir kuyucuğa 100 μL miktarında konularak 37°C'de 24 saat kültüre alındı. İnkübasyondan sonra her kuyucuğa 10 μL MTT solüsyonu (250 μM) ilave edildi ve dört saat daha inkübe edildi. MTT-formazan kristalleri, her bir kuyucukta 100 μL dimetil sülfoksit eklenerek çözüldü. Kültür plakaları, ELİZA mikroplak okuyucusu kullanılarak 570 nm'de tarandı ve her bir kuyucuk için optik yoğunluk (OD) değerleri kaydedildi. OD ölçümleri kullanılarak regresyon analizi ile her kimyasal için MİK50 değeri belirlendi. Bileşik 1, Klebsiella pneumoniae üzerinde en güçlü etki göstermiştir (F5 SAL MİK50değeri: 2,95 μM ve gentamisin MİK50: 2,02 μM). Bileşiklerin Proteus mirabilis üzerindeki etkisi ihmal edilebilir düzeyde olduğu belirlenmiştir (bileşikler 1-6'nın MİK50 değerleri 8,72 ila 21,9 μM arasında değişirken gentamisinin 2,95 μM olarak bulunmuştur). Bileşik 2, Streptococcus pyogenes üzerinde dikkate değer etki göstermiştir (F5 3TBS MİK50 değeri: 4,01 μM; gentamisin MİK50: 2,85 μM). Florlu Schiff bazı türevleri, antibakteriyel özellikleri nedeniyle antibiyotiğe dirençli bakterilerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde alternatif bir antibiyotik ajan adayı potansiyeline sahiptirler.
Biyoteknolojik öneme sahip mikroorganizmaların zeytinyağı fabrikası atıklarından izolasyonu ve moleküler tanılaması
Mikroorganizmalar, endüstriyel öneme sahip birçok ürünün biyosentezinde büyük rol oynamaktadırlar. Günümüzde mikrobiyal kaynaklı pek çok üründen çeşitli endüstrilerde yaygın bir şekilde yararlanılmaktadır. Mikroorganizmaların metabolik yolakları ile şekillenen ve farklı biyoteknolojik alanlarda geniş bir uygulama alanı bulan bu ürünler, değişik ekosistemlerden mikropların izolasyonu ve değerli endüstriyel ürünleri üretme potansiyellerinin belirlenmesindeki önemi vurgulamaktadır. Mevcut çalışmada, biyoteknolojik öneme sahip bakteri ve mayaların zeytinyağı fabrikalarının atıklarından izolasyonu amaçlanmıştır. 28 bakteri ve 56 maya olmak üzere toplamda toplam 84 mikrobiyal izolat elde edilmiştir. İzolatların biyosürfaktan üretim potansiyelleri yağ yayma testi, drop collapse testi, parafilm M testi, emülsifikasyon indekslerinin (E24) hesaplanmasını da içeren bir dizi tarama testi ile belirlenmiştir. En yüksek açılma zonları sırasıyla OLV-21 ve OLV-13 suşları için 45 ve 42 mm olarak kaydedilmiştir. Benzen, toluen ve dizel yağına karşı en yüksek emülsifikasyon indeksleri %48, %50 ve %3 olarak OLV-65 suşundan elde edilen hücresiz üst sıvı için hesaplanmıştır. Tarama testlerinde en iyi sonuçları veren bakteri ve maya izolatları sırasıyla 16S rDNA bölgesi ile 26S rDNA bölgesinin D1/D2 domainlerinin sekans analizleri ile moleküler olarak karakterize edilmiştir. Sekans analizi sonuçları bakteriyal izolatların Shimwellia (Shimwellia sp. OLV-51, OLV-53, OLV-56, OLV-61 ve OLV-63), Pseudocitrobacter (Pseudocitrobacter sp. OLV-65) ve Micrococcus (Micrococcus sp. OLV-74) cinslerine, maya izolatlarının ise Pichia (Pichia manshurica OLV-5, Pichia kluyveri OLV-13, OLV-16, OLV-21, OLV-41, and OLV-43), Saccharomyces (S. cerevisiae OLV-17), Nakazawaea (Nakazawaea sp. OLV-20, OLV-22 ve OLV-25) ve Ogataea (O. polymorpha OLV-64) cinslerine ait olduğunu göstermiştir. Bildiğimiz kadarıyla bu çalışma, Pichia kluyveri ve Ogataea polymorpha tarafından biyosürfaktan üretimini gösteren ilk rapordur. Tanılanan suşlar sayesinde biyosürfaktanlar gibi çevre dostu endüstriyel ürünleri üretme potansiyelindeki yeni mikrobiyal suşlar daha ileri araştırmalar için literatüre kazandırılmıştır.
Pnömoni enfeksiyonlarında biyokimyasal parametrelerin demografik analizi
Pnömoni enfeksiyonları tüm ülkelerde kişilerin yaşam tarzını olumsuz yönde etkileyen sıklıkla ölümlere neden olan solunum yolu hastalığıdır. Tanı imkanları kısıtlıdır ve en kısa sürede tanı konup uygun ilaçlarla tedaviye başlanması mortaliteyi önemli ölçüde azaltır. Tanıda biyokimyasal parametreler yol gösterici olmaktadır fakat spesifik bir sonuç vermemektedirler. Çalışmamızda enfeksiyonlarda değeri değişen biyokimyasal parametreler ele alınmıştır. Hastalar 18-80 yaş aralığında ve hekim tarafından pnömoni tanısı alan kişilerden oluşmaktadır. 18-40, 41-64 ve 65 yaş ve üzeri olarak hasta gruplaması yapılmıştır. Hastalardaki albümin düzeyi düşüklüğü enfeksiyona ek olarak yaşlı ve yoğun bakımda tedavi alan hastalarda beslenme bozuluğuna ve protein alım azalmasına bağlı karaciğerde albümin sentez azalması ile ve yaşa bağlı kardiyovasküler hastalık bulundurma ihtimali ile alakalı olabileceğini akla getirmektedir. Erkek ve kadın hastalarda istatistiksel olarak farklı bulunan albümin düzeyleri ise alkol kullanım oranlarının erkeklerde daha fazla olduğu bilindiğinden, erkeklerdeki bu düşüklüğün sebebi olarak alkol kullanımı ile karaciğer harabiyetine bağlı albümin salınımının azalmasını akla getirmektedir. CRP'nin kardiyovasküler hastalıklarda, sigara kullanımında arttığı bilinir ve genelde bu oranlar erkeklerde yüksektir. Bizim çalışmamızdaki farkın sebebinin erkeklerin kalp hastalığı bulundurma ihtimali ve sigara içme oranlarındaki yüksekliğe bağlı CRP artışı görülmüş olabileceğini düşünmekteyiz. Bir diğer parametre ferritin değeridir ve enfeksiyonlarda yükseldiği çoğu kez çalışmalarla kanıtlanmıştır. D-Dimer düzeylerine baktığımızda 65 yaş üzeri hastalarda görülen yüksekliğin artan yaşta görülen kardivasküler hastalık bulundurma ihtimali ile alakalı olabileceği gibi fizyolojik olarak yaşlılıkta yüsekselen D-Dimer seviyeleri ile de alakalı olabilmektedir. Yaş arttıkça artan D-dimer düzeyleri hastalığın şiddeti ve yaş arasında bir anlamlılık olabileceğini bize göstermektedir. Artan yaş ile birlikte ve yoğun bakım tedavisi gören hastalarda prognozun biyokimyasal parametrelerdeki değişimleri göz önünde bulundurularak daha kötü ilerlediğini tespit ettikk. Bu çalıştığımız parametreler pnömonide prognozu izlemede ve mortalite tahmininde önemli bir yere sahiptir ve en kısa sürede tetkilerin hızlı ve güvenilir şekilde çalışılması gereklidir.
Obez bireylerde aspprosin ve karnitin profilinin incelenmesi
Dünya Sağlık Örgütü (WHO) obeziteyi, sağlığı bozabilecek anormal veya aşırı yağ birikimi olarak tanımlamaktadır. Güncel veriler, aşırı kilolu ve obezitenin küresel bir salgın olarak hızla yayıldığını ve dünya nüfusunun yaklaşık %30'una denk gelen 2 milyar kişinin aşırı vücut ağırlığına sahip olduğunu göstermektedirAyrıca, günümüzde obezite ve obeziteye bağlı hastalıkların salgınları, küresel sağlık ve ekonomi açısından büyük bir sorun haline gelmiştir. Bu nedenle, obezite ile mücadele etmek için patofizyolojisinin ve tedavi yöntemlerinin araştırılması son derece önemlidir. Bu çalışmada, obez bireylerde serum asprosin düzeyleri ve karnitin profili incelenerek, bu moleküllerin yeni tanı veya tedavi belirteçleri olarak kullanım potansiyeli değerlendirilecektir. Asprosin, yağ hücrelerinden salınarak karaciğerde şekerin kana geçişini uyaran yeni keşfedilmiş bir hormondur. Yapılan çalışmalar, asprosin hormonunun diyabet başta olmak üzere birçok hastalığın nedenlerinden biri olabileceğini öngörmüştür. Karnitin ise, diyetten elde edilen ve esansiyel amino asitler lizin ile metioninden biyosentezlenen düşük moleküler ağırlıklı bir bileşiktir. Karnitin, uzun zincirli yağ asitlerinin mitokondriyal oksidasyonunda önemli bir rol oynarKarnitinler, enerji metabolizmasında büyük bir rol oynamaktadır. Ancak, asprosin ve karnitin türevlerinin obezitedeki rolleri henüz tam olarak anlaşılmamıştır. Bu nedenle, bu çalışma ile ilk defa asprosin ve karnitin düzeylerinin obezitedeki değişimleri belirlenerek, vücut kitle indeksi (VKİ) ile olan korelasyonları incelenecektir. Bu çalışmada, vücut kitle indeksine (VKİ) göre iki farklı obez kategori oluşturulacak tip-1(vki=30-35),tip-2(vki=40 ve üzeri) ve her bir gruptan 30 olmak üzere toplamda 60 obez ve 30 sağlıklı bireyden kan örnekleri alınacaktır. Elde edilen kan örneklerinden asprosin miktarı ELISA yöntemiyle, karnitin profili ise LC-MS/MS yöntemiyle analiz edilmiştir. Elde edilen veriler, SPSS ve MetaboAnalyst programları kullanılarak değerlendirilmiştir. Çalışma sonucunda elde edilen veriler, asprosin ve karnitin düzeylerinin vücut kitle indeksi (VKİ) ile olan korelasyonları belirlenmiş ve obezite tanı ve tedavisindeki kullanım potansiyelleri araştırılmıştır.
Şanlıurfa merkez ilçelerindeki rekreasyon alanlarının yabancı ot florası
Bu çalışma ile Şanlıurfa'nın Eyyübiye, Haliliye ve Karaköprü merkez ilçelerinin sınırları dahilinde bulunan rekreasyon alanlarının yabancı ot florasının tespit edilmesi amaçlanmıştır. Bu ilçeler dahilindeki 34 rekreasyon alanında arazi çalışması yapılmıştır. Çalışma sonucunda 27 familyaya ait 134 takson belirlenmiştir. Bu taksonlardan 82'si tür, 31'i alttür ve 21'i ise varyetedir. Bu taksonların 109 tanesi dikotiledon, 25 tanesi monokotiledondur. Bu bitkiler hayat formu açısından değerlendirildiğinde 1 tanesi fanerofit, 1 tanesi kamefit, 32 tanesi hemikriptofit 1 tanesi kriptofit (geofit) ve 99 tanesi ise terofittir. Bitkilerin fitocoğrafik bölgeler açısından dağılımları sırasıyla İranTuran elementleri %13 (17), Akdeniz elementleri % 7 (10), Avrupa-Sibirya elementleri % 5 (7), Doğu Akdeniz elementleri % 4 (5)ve bilinmeyenler % 71 (95)'dir. Tanımlanan bitkiler takson sayısı dikkate alındığında ilk beş familya sırasıyla; Fabaceae (29), Poaceae (24), Asteraceae (23), Brassicaceace (6), Plantaginaceae (6) Apiaceae (5) ve Caryophyllaceae (5)'dır.
Farklı kültür ortamları kullanılarak çelik biyoreaktörde Brucella abortus S-19 bakterisinin üretiminin optimize edilmesi
Bruselloz, Brusella bakterilerinin yol açtığı zoonotik enfeksiyonlardan olup, bulaşmada doğrudan ya da dolaylı olarak enfekte hayvan veya ürünleri ile temas önem taşımaktadır. Brusellozun önlenmesinde alınacak tedbirlerin başında aşılama gelmektedir. Ülkemizde brusella aşısı üretiminde kullanılan metodlarla aşı üretimi yetersiz kalmakta ve yüksek oranda iş gücüne ihtiyaç duymaktadır. Aşı üretiminde kullanılan mediumları optimize ederek sanayi tipi üretimi arttırmak bir ihtiyaç haline gelmiştir. Son yıllarda paslanmaz çelik biyoreaktörler aşı üretiminde önemli yer tutmakta olup, aşınınkalitesini ve üretim miktarını önemli ölçüde etkilemektedir. Paslanmaz çelik biyoreaktörler, aşı hazırlamada bakteri üremetimi için gerekli ortamı (sıcaklık, pH, oksijen, karıştırma hızı) sağlamada önemli katkılar sunmaktadır. Bu çalışma ile hali hazırda sığırlarda uygulanmakta olan Brusella S19 aşısı için bakterilerin sıvı besiyerinde üretiminin optimizasyonu amaçlanmıştır. Katı besiyerinde üremesi tamamlanan bakterilersteril paslanmaz çelik biyoreaktörde üç farklı sıvı besiyerinde pasajlanmıştır (1. besiyeri: tryptose , yeast extract, glucose , NaH2PO4, Na2HPO4, 2. besiyeri:proteose peptone ,yeast extract, glucose , NaH2PO4, Na2HPO4, 3. besiyeri: tryptone, yeast extract, glucose , NaH2PO4, Na2HPO4). Pasajlama işlemi %30 O2 ortamında, 37 oC'de, pH 6.8'de sürdürülmüştür. Pasajlamalarda karıştırma hızı 300 ile 420 rpm arasına ayarlanmıştır. Pasajlamalar esnasında:0, 6,12, 24, 36, 48. saatlerde numune alınarak canlılık sayımı yapılmıştır. Her bir besiyeri için uygulamalar üç kez tekrarlanmıştır. 1., 2. ve 3. besiyerlerinde 48. saatlerde en yüksek miktarda bakteri sayıları 10.2x1011, 7.1x109ve 6.0x1010 olarak belirlenmiştir. Üç farklı besiyerinin karşılaştırılması sonucunda en ideal üreme ortamının tryptose, yeast extract, glucose , NaH2PO4, Na2HPO4olduğunu söyleyebiliriz. Çalışmamız koruyucu hekimliğin en önemli unsuru olan aşılamalara katkı açısından önem taşımaktadır.
Sıvı yosun gübresi ve vermikompostun arpa gelişimi ve kök bölgesi mikrobiyolojik özelliklerine etkisi
Günümüzde kimyasal gübre kullanımına alternatif olarak organik gübre kullanımı tercih edilmektedir. Kimyasal gübre kullanımıyla toprağın yapısının bozulduğu, bitki gelişimine oldukça büyük zararlar verdiği tespit edilmiştir. Bu da bizleri organik gübreye yönlendirmektedir. Tercih edilen organik gübrelerden vermikomposttun bitki büyümesini hızlandırdığı, çimlenme hızını arttırdığı aynı zamanda toprak kökenli bitki hastalıklarını baskıladığı yapılan çalışmalarla gözlenmiştir. Bir çok ülkede gerek sıvı ekstratı gerekse direk toprağa karıştırılarak kullanılan sıvı yosun gübresinde de ; bitkide kuvvetli kök gelişimi, bitkilerde klorofil oluşumunu hızlandırması, bitkilerin hastalıklara ve çevresel streslere karşı daha dirençli olması, mikro ve makro elementlerin dengeli bir şekilde topraktan alınması, tarımsal ilaçların etkisini arttırması ve topraktaki nematotların zararlarını azaltması gibi etkileri yapılan çalışmalarla gözlenmiştir. Bu tez çalışmasında, sıvı yosun gübresi ve vermikompost gübresi kullanılarak arpa gelişimi ve kök bölgesi mikrobiyolojik özelliklerine etkisi incelenmiştir. Vermikompost ve sıvı yosun gübresi ticari gübre satan bayilerden temin edilmiştir. Arpa tohumu da GAP Tarımsal Araştırma Enstitüsünden sağlanmıştır. Denemede kullanılan topraklarda herhangi bir uygulama yapılmamış yerden yüzeyden 0-25 cm derinlikten alınmış, 2mm elekten geçirilerek saksılara doldurulmuştur. Denemede 2 kg'lık tabaklı saksılar kullanılmıştır. Temel gübre olarak 6 kg N/da dozunda Amonyum sülfat ve 6 kg P2O5/da dozunda TSP ekimle birlikte tüm saksılara verilmiştir. Vermikompostun 4 dozu (%0, %10, %20 ve %40), sıvı yosun gübresinin 4 dozu (%0, %1, %2 ve %3) ile vermikompost ve sıvı yosun gübresinin kombinasyonu ekim öncesi ayrı ayrı topraklara uygulanmıştır. Her uygulama grubu için 3 saksı paraleli olmak üzere toplam 48 saksı kullanılmıştır. Sıvı yosun gübresi 50 ml olacak şekilde saksılara uygulanmış, bitkiler gerektiğinde hasat edilene kadar düzenli olarak distile su ile sulanmıştır. Arpa tohumları her bir saksıya 5 adet ekilmiş, çıkıştan sonra 3'e seyreltilmiştir. Deneme tesadüf parselleri deneme desenine göre doğal ışık alan serada yürütülmüştür. Bitkiler ekimden 60 gün sonra hasat edilmiştir. Hasat sonunda elde edilen sonuçlar ise klorofil miktarında artış, bitki boyunda uzama, kuvvetli kök gelişimi ve uzaması, yeşil aksam da yaş ve kuru ağırlıklarda gözlenebilir değişimler olmuştur. Ayrıca kök bölgesindeki toprakta bulunan bazı mikrobiyolojik aktivitelerin kullanılan vermikompost ve sıvı yosun gübresi ile faaliyetleri incelenmiştir. Türkiye toprakları organik besin açısından fakir olması nedeniyle kullanılan bu alternatif organik gübre tarımın sürdürülebilirliği açısından büyük bir önem arz etmektedir.
Biyostimülant olarak kullanılan yosun gübresi ve mikorizanın mercimek gelişimi ile rizosferdeki bazı biyolojik özelliklere etkisi
Bu çalışmada, mercimek gelişimi ve rizosferdeki bazı mikrobiyolojik özellikler üzerinde yosun gübresi ve mikorizanın ayrı ayrı ve birlikte etkisini belirlenmek amaçlanmıştır. Deneme serada yürütülmüştür. Denemede ticari olarak satılan yosun ve mikoriza gübreleri kullanılmıştır. Biyostimülant olarak satılan sıvı yosun gübresi 50 ml su birlikte mercimek bitki topraklarına dört dozda (%0, %0.1, %0.2 ve %0.4), mikoriza ise 2 dozda uygulanmıştır. Bitkiler ekimden 15 hafta sonra hasat edilmiştir. Mercimeğin bitki yeşil aksam boy uzunluğu, bitki ağırlığı, kök kuru ağırlıkları, kök uzunluğu, yaprakların klorofil içerikleri ,kök bölgesi β glukosidaz, dehidrogenaz, alkalin fosfataz enzim aktiviteleri, CO2 içeriği incelenmiştir. ANAHTAR KELİMELER: Biyostimülant, mercimek, bitki gelişimi, Rizosferin bazı mikrobiyolojik özellikleri
Mardin'de farklı etnik gruplarda yabani gıda bitkilerinin gastronomik açıdan araştırılması
Bu çalışma 2021 ve 2022 yıllarında Mardin'in Midyat, Nusaybin, Ömerli ve Yeşilli ilçelerine bağlı 11 mahalle/köyde farklı etnik gruplar üzerinde yapılmıştır. Çalışmanın amacı yörede değişen yabani gıda bitkilerinin halk arasındaki gastronomik kullanım biçimlerini araştırmaktır. Bu kapsam Süryani, Kürt ve Arap köylerinden bazıları pilot çalışma alanı olarak seçilmiş ve farklı yaş ve farklı eğitim düzeyine sahip 66 kaynak kişi ile görüşmeler yapılmıştır. 50 farklı bitkinin halk geleneğindeki gıda bitkisi olarak kullanım şekilleri belirlenmiştir.
Capsicum annum (biber) bitkisinin Şanlıurfa'da geleneksel kullanımı ve gıda olarak üretim yöntemleri
Bu çalışma, 2020-2022 yılları arasında Şanlıurfa'da biber bitkisinin üretimi ve gıda olarak kullanım çeşitlerini araştırmak amacıyla yapılmıştır. Şehirde bitkinin folklorik/etnobotanik anlamda kullanımını tespit etmek ve tarladan sofraya kadar bitkiye ait tüm aşamaların bilimsel olarak kayıt altına almak amacıyla biberin en yoğun olarak üretildiği, işlendiği ve pazarlandığı 8 ilçe ve 7 mahalle pilot bölge olarak seçilmiştir. Ayrıca, biber üretimi yapan bazı üretici ve satıcıların yanı sıra ve biberi geleneksel olarak işleyen yerel halk ile de birebir görüşmeler sağlanmıştır. Çalışma alanında 70 kaynak kişi ile yüz yüze ve katılımlı gözlem tekniği kullanılarak görüşmeler yapılmıştır. Bu çalışma kapsamında biber bitkisi ile ilgili hem derlenen hem de sahada özgün olarak elde edilen verilere yer verilmiştir. Sonuç olarak, Şanlıurfa mutfağında geleneksel olarak biberin çoğunlukla baharat, salça, turşu, kurutmalık ve taze olarak değerlendirildiğini tespit ettik. Etnobotanik açısından da halk tıbbında kullanımının yanı sıra, saplarının yakacak olarak ve yeşil yapraklarının da hayvan yeminde kullanıldığı tespit edilmiştir. Periyodik olarak her sene düzenlenen İsot festivalleri de yerinde tarafımızdan gözlenmiştir. Yerel halkın bu bitkiyle ilgili bilgi birikimleri görsellerle kayıt altına alınmıştır.
Heterosiklik schiff bazı ligandları ve metal komplekslerinin lösemi hücreleri üzerindeki antikanser etkileri
Kemoterapi, lösemilerin tedavisinde en önemli tedavi seçeneklerinden biridir, ancak çoklu ilaç direnci (MDR) genellikle bu tedavinin başarısına engel olmaktadır. Çalışmada, heterosiklik salisilaldiminlerin ve bunların Cu(II) komplekslerinin K562 miyelomonositik lösemi hücreleri üzerindeki antikanser özellikleri araştırıldı. Pozitif kontrol olarak Doksorubisin (DOX) ve Etoposide (ETO) kullanıldı. Bileşikler (C1-8 ve DOX, ETO), 1, 10, 100, 1000 µM dozlarda triple düzende 96 kuyucuklu kültür plaklarına aktarıldıktan sonra üzerine K562 hücreleri 105/ml dozunda eklendi. 72 saatlik inkübasyondan sonra, her bir bileşiğin IC50 değerlerini belirlemek için kolorimetrik MTT testi uygulandı. Her bir bileşiğin değerlerine göre akış sitometrisinde CFSE analizi kullanılarak bileşiklerin antiproliferatif etkileri belirlendi. Her bir bileşiğin apoptoz indüksiyon potansiyeli, akış sitometrisinde mitokondriyal membran potansiyeli analizi (Rho123), ve yarılmış kaspaz-3 ekspresyon analizi ve immunfloresan boyama ile, hücre morfolojisi analizleri giemza, H&E ve PAP protokolleri ile belirlendi. Bileşiklerin metal kompleksleri, ligandlarından daha güçlü sitotoksik etkilere ve yarılmış kaspaz-3 ekspresyonuna sahipti. Schiff bazı bileşikleri ve DOX ile tedavi edilen hücrelerde mitokondriyal membran potansiyeli düşük seviyelerde bulundu. Hücre morfolojisi analizlerinde, apoptoz oluşumunun kanıtı olarak kromatin yoğunlaşması ve kenarda birikimi, hücre zarında kabarcıklanmalar ve çıkıntılar, hayalet hücreler ve apoptotik cisimcikler gözlendi. Daha ileri in vitro ve in vivo çalışmalara ihtiyaç olmakla birlikte test edilen heterosiklik Schiff bazı bileşikleri arasında, 1,1,7,7-tetra-metil-jululidin-N-heptil-salisildimin Cu(II) kompleksinin güçlü sitotoksik ve apoptoz indükleme potansiyeli umut verici olarak dikkat çekmektedir.
Bazı salısilaldimin türevi schıff bazı bakır komplekslerinin bazı patojenik bakteriler üzerindeki antibakteriyel aktivitelerinin belirlenmesi
Antibakteriyel ilaçlara karşı artan mikrobiyal direnç sorunuyla mücadele etmek için günümüz dünyasının dirençli bakterilere karşı güçlü kimyasal veya doğal antibakteriyel ilaçlara yönelik acil ihtiyacı kritik öneme sahiptir. Çalışmamızda, 8 Salisilaldimin türevi Schiff baz bileşiginin (ligandlar ve bunların bakır kompleksleri) ve gentamisin'in (pozitif kontrol) antibakteriyel etkisi, Klebsiella pneumonia, Proteus mirabilis ve Streptococcus pyogenes gibi patojenik bakteri suşlarına karşı antibakteriyel etkisi MTT testi ile belirlendi. Bileşikler 1, 10, 100 ve 1000 μM olmak üzere farklı konsantrasyonlarda eklendikten sonra standart dozda bakteri ile kültür edilmiştir. Kültür sonrası kuyucuklara MTT boyası eklendikten sonra oluşan formazan kristallerini çözme için dimetil sülfoksit eklendi. Her bir kültür kuyucuğu için optik dansite değerleri 570 nm'de bir Microplate okuyucu ile belirlendi. Her bir bileşiğe ait MIC50 değeri hesaplandı. Gentanisinin MIC50 değeri P. Mirabilis, S. Pyogenes, K. pneumonia için sırasıyla; 1.6 μM, 1.8 ve 2.4 μM olarak izlemiştir. Bileşiklerin S. pyogenes için MIC50 aralığı 1.9-3.9 uM, K. pneumoniae için 5.7 - >100 uM ve P. mirabilis için 3.9 - >100 uM olarak belirlenmiştir. Çalışmamızda, gram negatif bakteriler üzerinde C3 ve S. pyogenes (Gram pozitif) üzerinde C1 en iyi antibakteriyel aktiviteye sahipken, C6 dışındaki bileşiklerin neredeyse tamamı orta düzeyde aktiviteye sahiptir. Bakteri bileşiklere tepkileri ile ilgili olarak, bakır komplekslerinin bakteriler üzerinde ligandlardan daha etkili olmasının nedeninin farklı yapılarından kaynaklanmış olabileceğini düşünmekteyiz
Hipoksik koşullarda uygulanan naringeninin voltaj kapılı sodyum kanalı aracılı kanser hücre hareketi üzerindeki etkisi
Hipoksi normal koşullara göre daha az oksijen seviyelerini ifade eder. Tümörlerde hacim arttıkça mikroçevresinde oksijen azlığı ortaya çıkmaya başlar. Aynı zamanda damarlanmanın yetersiz olması ve tümörün bazı bölgelerinin kan damarına uzak yerleşimi nedeniyle hipoksik koşullar ortaya çıkar. Tümör hücreleri de sağ kalımı sürdürebilmek için bu koşullara adapte olur. Hipoksiyle indüklenebilir faktör (HIF) aracılığıyla hücre sağ kalımını, anjiyogenezi, apoptozu, invazyon ve metastazları kendi lehine destekleyecek genlerin ekspresyonunu indükler. Hipoksinin, metastatik süreçte rol oynayan matriks metalloproteinazlar ve katepsinleri aktive etmenin yanı sıra voltaj kapılı sodyum kanalı (VGSC) aracılı hücre hareketi ve invazyonu da desteklediğine dair bulgular mevcuttur. Son yıllarda yapılan çalışmalar ile VGSC'lerin prostat, meme, akciğer, kolon vb birçok kanser hücresinde metastatik hücre davranışları ile ilişkili olduğuna dair bulgular artmaktadır. Bu çalışmanın amacı, yüksek metastatik özelliğe sahip ve metastatik yeteneği VGSC'ler ile ilişkili olan PC-3 prostat kanseri hücrelerinin hareketi üzerinde, naringenin doğal bileşiğinin, normoksik ve hipoksik koşullarda oluşturacağı etkileri araştırmaktır. Bunun için öncelikle hücre proliferasyonunu etkilemeyen bileşik konsantrasyonu Alamar blue kullanılarak belirlendi. Daha sonra yara kapanma analizi yapılarak bu konsantrasyondaki naringeninin hücrelerin yanal yöndeki hareketi üzerindeki etkisi tespit edildi. Ayrıca bileşik uygulamasından sonra hücre içi sıvıdaki sodyum iyon konsantrasyonları indüktif eşleşmiş plazma spektroskopisi (ICP) yöntemi ile ölçüldü. Naringeninin hücre proliferasyonunu etkilemeyen konsantrasyonları 75 ve 100 µM olarak tespit edildi. Bu konsantrasyonlarda naringeninin her iki koşulda hücrelerin hareketini etkilemediği görüldü. ICP analizi sonuçlarına göre naringenin uygulanan grupta, normoksik koşulda hücre içi sodyum iyon konsantrasyonu kontrol grubuna (59.5mM) göre azalırken (NAR75: 47.8mM; NAR100: 54.8mM), hipokside arttığı (K: 47.7mM; NAR75: 51.6mM; NAR100: 61.9mM) dikkat çekmiştir. Tüm sonuçlar birlikte değerlendirildiğinde naringeninin insan prostat kanseri PC-3 hücrelerinin hareketini normokside etkilemezken hipoksik koşulda arttırabileceği tespit edilmiştir. Bu nedenle naringeninin özellikle kanser hastaları tarafından kullanımı konusunda dikkatli olunması gerektiğini vurgulamak istiyoruz.
Agaricus bisporus kültür mantari yetiştiriciliğinde verimin arttirilmasi amaciyla cladophora glomerata ve arthrospira (spirulina) platensis algleri̇n kullaniminin araştirilmasi
Agaricus bisporus MANTAR YETİŞTİRİCİLİĞİNDE VERİMİN ARTTIRILMASI İÇİN Cladophora glomerata VE Arthrospira (Spirulina) platensis ALGLERİNİN KULLANILMASININ ARAŞTIRILMASI Bu çalışma, Agaricus bisporus türünün en uygun yetiştirme ortamlarının geliştirilmesi ve belirlenmesi amacıyla, Cladophora glomerata ve Arthrospira (Spirulina) platensis alglerinin üç farklı dozu (C. glomerata kuru ağırlık dozu 10 gr, 25 gr ve 50 gr; A. platensis kuru ağırlık dozu 5 gr, 12,5 gr ve 25 gr) kullanılarak üç tekerrürlü olarak yapılmıştır. 28.04.2021 ile 10.07.2021 tarihleri arasında Antalya İli'nin Korkuteli İlçesi'nde özel bir mantar üretim işletmesinde araştırma denemeleri yapılmıştır. "Amycel Firması"'nın tohumluk mantar miselleri içinde ekilmiş ve aşılı olan kompostlar, "SMS Ersanlar Kompost Firmasın'dan yine bu ilçe içinden temin edilmiştir. Araştırmada sırasında mantar kalitesinin bazı ayırt edici özelliklerinden olan; mantar verimi, ortalama mantar ağırlığı, mantar şapka ve sap ağırlıkları, mantar şapka çapı ve yüksekliği, mantar sap çapı ve uzunluğu, toplam mantar uzunluğu, kuru ağırlık, kül ağırlığı ve pH gibi kıstaslar incelenmiştir. Mantar kompostlarına alg uygulamalarının genelde kontrol grubuna göre daha iyi sonuçlar verdiği görülmüştür. Cld 250 ve Spr 250 uygulama dozlarının toplam mantar verimini sırasıyla % 7 ve % 15 oranda arttırdıkları tespit edilmiştir. ANAHTAR KELİMELER: Agaricus bisporus, Arthrospira (Spirulina) platensis, Cladophora glomerata, Kültür mantarı, Yenilebilir mantar
Cladophora sp. ile spirulina sp. ve karişimlarinin mercimek (Lens culinaris Medik.)gelişimi üzerine etkisi
Mercimek (Lens culinaris Medik.) gelişimi üzerine Cladophora sp.ile Spirulina sp. alg gübrelerinin etkilerinin belirleneceği bu çalışmada kullanılacak algler Karkamış baraj Gölünden toplanıp kurutulmuştur. Alglerin altı dozu (Kontrol, %0,2; %0,4; %0,6;% 0,8; %1) ve karışımları ayrı ayrı ekimle birlikte topraklara uygulanmıştır. Deneme 3 tekerrürlü olarak serada yürütülmüştür.. Denemede 2 kg'lık saksılar kullanılmıştır. Denemede kullanılacak tohumlar GAP Araştırma Enstitüsün'den alınmıştır. Ekimden 60 gün sonra hasat edilen mercimeklerde, kök uzunluğu, bitki boyu, yaprak boyu, bitki ve kök ağırlıkları, klorofil içeriği, incelenmiştir. Elde edilen sonuçlar istatistiki olarak değerlendirilmiştir.
Karaköprü (Şanlıurfa)'nın kentsel alanlarındaki ruderal bitkiler
Bu çalışma ile Şanlıurfa'nın Karaköprü ilçe merkezindeki kentsel alanlarda yer alan ruderal bitki türlerinin tespit edilmesi amaçlanmıştır. İlçe merkezini oluşturan 14 mahallede yapılan çalışma sonucunda kentsel alanlarda 30 familya, 121 cins ve 147 taksona ait 95 tür, 33 alttür ve 19 varyete tespit edilmiştir. Bu taksonlar sırasıyla Asteraceae (25), Poaceae (19), Fabaceae (17), Brassicaceae (9), Apiaceae (6), Papaveraceae (4), Lamiaceae (4), Boraginaceae (3), Caryophyllaceae (3), Plantaginaceae (3) ve diğer familyalara dağılmışlardır. Taksonlar hayat formu açısından ise terofit (103), hemikriptofit (35), kamefit (4), kriptofit- geofit (3) ve fanerofit (2) şeklinde bir sıralamaya sahiptir. Taksonlar ait oldukları fitocoğrafik bölgeye göre ele alındığında İran-Turan (25), Akdeniz (11), Doğu Akdeniz (6), Avrupa-Sibirya (5) sıralaması ortaya çıkmıştır. Diğer 100 taksonun ait oldukları fitocoğrafik bölge ile ilgili bir değerlendirme yapılamamıştır. Karaköprü kentsel alanlarında belirlenen bitkiler arasında bozkıra ait bitkiler ile yabancı ot olarak ifade edilen bitkilerin önemli bir yer tuttuğu belirlenmiştir.
Astragalus aduncus (geven otu) bitki ekstresinin prostat kanseri üzerindeki antikanser etkilerinin incelenmesi
Günümüzde kanser tedavisinde kemoterapi, radyoterapi, cerrahi müdahale, immünoterapi ve alternatif tedavi yöntemleri yaygın olarak kullanılmaktadır. En sık tercih edilen yöntem olan kemoterapinin en büyük dezavantajı, kanserli hücreleri yok ederken sağlıklı hücrelere de zarar vermesidir. Bu durum, daha düşük toksisiteye sahip bitki kökenli ilaçlara yönelimi artırmıştır. Kanser tedavisinde kullanılan ilaçların %60'ı doğal ürünlerden elde edilmekte olup, bunların önemli bir kısmı bitkisel kaynaklıdır. Vinka alkaloidleri, taksanlar ve epipodofilotoksinler gibi birçok bitkisel kökenli bileşik, kemoterapi amacıyla yaygın şekilde kullanılmaktadır.Bu çalışmada, halk arasında "geven otu" olarak bilinen Astragalus Aduncus bitki ekstresinin prostat kanseri üzerindeki antikanser etkileri araştırılacaktır. Çalışmada, bitkinin farklı ekstreleri elde edildikten sonra prostat kanseri ve normal prostat hücreleri üzerindeki sitotoksik etkileri MTT testi ile değerlendirilecektir. En etkili ekstre, kanser hücrelerindeki apoptotik etkiler açısından flow sitometri yöntemiyle annexin V ve floresan acridin orange metotlarıyla incelenecek, ayrıca LC-MS/MS yöntemiyle içerik analizi yapılarak etkili bileşikler belirlenecektir.Bu araştırma, Astragalus Aduncus ekstresinin kanser tedavisinde potansiyel bir kemoterapötik ajan olarak kullanılabileceğini ortaya koymayı hedeflemektedir.
Gut microbiota composition in COVID-19 survived patients
The proposed doctoral research examines the chronic changes in the intestinal microbiome of patients with COVID-19 survivors with attention to their sex-dependent differences and associations with post- acute COVID-19 syndrome. The study used stool samples of 30 COVID-19 recovered (21 female, 9 male) and 10 matched healthy individuals and compared them using various methods such as bacteria culture, 16s rRNA sequencing, and a metagenomics approach in Erbil, Iraq. Findings showed that COVID-19 survivors maintain gut dysbiosis three months after infection. The survivors had much lower alpha-diversity (Shannon index 3.1 vs. 4.2, p < 0.001), meaning that they had fewer species and lower equality. Shifts in beta-diversity were significantly different between control and survivor groups, with appreciable patterns of sex. The beneficial microbes (Faecalibacterium prausnitzii) were reduced significantly (2.8-fold, p = 0.003), whereas pro- inflammatory microbes (Prevotella copri in case of males and Bifidobacterium pseudocatenulatum in case of females) were augmented. PICRUSt2 functional predictions showed sex dissimilar metabolic abnormalities, such as inhibited carbohydrate metabolism, which could be associated with long COVID effects such as glucose intolerance. The paper has also suggested new ecological measures--bimodal rank-abundance and midcurve depletion-- as a candidate with post- acute COVID-19 syndrome biomarker. Close relations (r = 0.72, p = 0.008) between microbial imbalance and gastrointestinal symptoms also underpinned the role of the gut in post-COVID issues. Because of evident sex-related microbial differences, the given study underlines the necessity of gender-specific microbiome therapies, such as precision probiotics and personalized diets. Longitudinal and multi-omics studies may help to define causal relationships and provide insights into clinical approaches to dealing with post- acute COVID-19 syndrome.
Toplu beslenme sistemlerinde sürdürülebilir faaliyetler
Dünyada doğal kaynakların yoksunlaştığı, azaldığı ve giderek tükendiği göz önüne alındığında, gelecekteki nesillerin gıda, su, enerji gibi ihtiyaçlarının karşılanabilmesi için sürdürülebilir üretim, dağıtım, tüketim yapılması gerekmektedir. Dünyada gerçekleşen küresel ısınmayla beraber, artan çevre kirliliği ve nüfus artışı ile birlikte doğal kaynakların tüketimi hızlıca artmış bulunmaktadır. Su kaynaklarının kirletilmesi, tükenmesi, biyoçeşitliliğin azalması, karbon ayak izinin oluşumu ve sera gazlarının artışı ile beslenme bozukluklarının sonucu ile insanlarda kaygı oluşmaya başlamıştır. Bu seviyede gelecek kuşakları göz ardı etmemek gereklidir. Bunun sağlanması üreticiden tüketiciye kadar olan herkesin sorumluluğu altında olması gereken bir durumdur. Dikkat edilmediği takdirde doğal kaynaklarımız bize bile yetmeyecek duruma gelip artan nüfusa karşılık beslenme güçlüğü, güvenilir ve yeterli besin ihtiyacı karşılanamayacak durumlar yaşanacaktır. Toplu beslenme sistemlerinde karşılaşılan sürdürülebilir faaliyetler sürdürülebilir sistemin bir parçasıdır. Toplu beslenmenin yapıldığı kurumların sürdürülebilirliğe birçok yönden etkisi bulunmaktadır. Dolayısıyla bu derlemede ilk olarak sürdürülebilir sistemler araştırıldı, toplu beslenme sistemleri araştırıldı, ardından sürdürülebilir faaliyetlerin toplu beslenme sistemine etkisi incelendi. ANAHTAR KELİMELER: Sürdürülebilirlik, gıda güvencesi, su ayak izi, toplu beslenme, karbon ayak izi, sürdürülebilir gıda, sürdürülebilir sistem, gıda güvenliği, sera gazı, emisyon, gıda israfı, Akdeniz diyeti
Harran Üniversitesi herbaryumunda bulunan fabaceae familyasına ait teşhis edilmemiş örneklerin değerlendirilmesi
Bu çalışma "Harran Üniversitesi Herbaryumu'nda (HARRAN) Bulunan Fabaceae Familyasına Ait Teşhis Edilmemiş Örneklerin Değerlendirilmesi" üzerine yapılan bir çalışmadır. Çalışmanın temel amacı, herbaryumda bu familyaya ait teşhis edilmemiş bitkilerin teşhis edilerek herbaryuma kazandırılması ve ayrıca daha önceden çeşitli araştırıcılar tarafından toplanan bitki örneklerinin herbaryum kartonlarına yapıştırılıp, lokasyon bilgilerinin etiketlere yazılması ile birlikte bitkilerin kayıt altına alınması amaçlanmıştır. Harran Üniversitesi Herbaryumu'nda Fabaceae familyasına ait 1223 bitki örneği incelendi. Flora of Turkey kaynağı dikkate alınarak, teşhis edilmeyen bitki örneklerinin teşhisi yapıldı. Herbaryum kartonlarına yapıştırılmayan ve lokasyon bilgileri eksik olarak bitki örneklerinin ise eksikleri giderildi. 1223 bitki örneğinin incelenmesi sonucunda 29 cins ve bu cinslere ait 195 takson tespit edilmiştir. Harran Üniversitesi Herbaryumun'da en çok bulunan cinsler belirlenmiş olup, cinslere ait bulunan taksonların fitocoğrafik dağılımı ve endemik tehlike kategorileri belirlenmiştir. HARRAN Herbaryumu'nda Fabaceae familyasında bulunan 29 cinse ait, en çok takson içeren cinsler sırasıyla; Astragalus (49), Medicago (32), Trigonella (26), Trifolium (21) ve Vicia (17) yaygın olarak tespit edilmiştir Bu taksonlar fitocoğrafik olarak değerlendirildiğinde en çok takson içeren fitocoğrafik bölge; İran-Turan elementi (74), Akdeniz elementi (47),Avrupa Sibirya (4) ve fitocoğrafik bölgesi çok bölgeli /bilinmeyen takson sayısı ise (68) olarak tespit edilmiştir. 195 takson içerisinden ise 34 taksonun endemik olduğu tespit edilmiştir. Çalışmada tespit edilen taksonların tehlike kategorileri incelendiğinde ise ; 5'nin (NT), 1'nin (CD), 10'unun (LC), 6'sının (CR), 5'inin, (VU) 3'nün (EN) ve 4'nün (NE) olduğu tespit edilmiştir.
Polikistik over sendromunda ve over kanserinde biyokimyasal parametrelerin karşılaştırmalı analizi
Polikistik over sendromu, üreme çağında olan kadınlarda hiperandrojenizm ile birlikte ultrasonografik olarak overlerde polikistik oluşumların gözlenmesi sık karşılaşılan semptomlardandır. Biyokimyasal kan değerlerinde ek olarak uzun süreli, yüksek miktarda östrojen stimülasyonu bulunmaktadır. Over kanseri ise başlangıç evresinde kadınlarda yumurtalıkta büyümeye başlayan ve ilerleyen zamanlarda kontrolsüz bir biçimde çoğalıp çevredeki dokulara yayılarak tümör malignitesi oluşturan, anormal hücrelerdir ve jinekolojik kanserler arasında mortalite oranı en yüksek olan kanser türüdür. PKOS tanısı alan kadınların endometrial hiperplazi oluşturma olasılıklarının ve hatta endometrium kanseri olma olasılıklarının artmaktadır. Çünkü endometrium kanserinde obezite, oligomenore, nulliparite vardır. PKOS hastalarında görülen obezite ve hiperandrojenizm over kanserine yakalanma riskini artırdığını göstermektedir. Çalışmamız 18–80 yaş aralığındaki, tanısı kesinleşmiş Polikistik Over Sendromu (PKOS) ve over malignitesi bulunan kadın hastaların gruplandırılmasıyla oluşmaktadır. Hem PKOS hastalarının bir kısmında hem de over kanseri hastalarının bir kısmında Glukoz seviyeleri normal sınırların üstünde seyretmiştir. Ayrıca her iki hasta grubunda da Ca, HCT, HGB, T-GFH düzeyleri, hastaların yaşları ilerledikçe düşmeye başlamıştır. Her iki gruptaki Glukozdaki ortak değişimlerin hem PKOS hem de over kanseri hastalarında insülin direnci olduğunu, stres ve ağrıya bağlı olarak adrenalin yüksekliğiyle birlikte glukagon artışına bağlı olduğunu düşünmekteyiz. Bunun dışında Ca, HCT ve HGB parametrelerinde her ki grupta da yaşa bağlı olarak düşüş göstermesi literatürdeki geçmiş çalışmayla uyumlu olarak Kalsiyum düşüklüğü bulunan hastaların daha düşük hematolojik seviyelere sahip olduğunu ve hem PKOS hem de over kanseri hastalarında anemi görülebileceğini düşündürmektedir. Her iki hasta grubunda da yaşa bağlı olarak T- GFH düzeylerinde düşüş olması glomerüler filtrasyon hızının düştüğünü ve hastalarda yaş arttıkça böbrek fonksiyonlarında azalma olabileceğini düşündürmektedir. Bu çalıştığımız parametrelerdeki ortak değişimler PKOS hastalarının over kanserine yakalanma riskini değerlendirmede, bu iki hastalıkta da prognozu izlemede önemli yerlere sahiptir ve bu tetkiklerin hızlı güvenli bir şekilde detaylı çalışılması gerekmektedir.
Silene sclerophylla chowdh vesilene araratica scischk subsp. araratica bitkilerinin ekolojik, morfolojik, anatomik özellikleri ve uçucu yağ bileşenlerinin belirlenmesi
Bu tez çalışmasında, farklı ekolojilerde yayılış gösteren Silene sclerophylla Chowdh ve Silene araratica Scischk subsp. araratica taksonlarının morfolojik, anatomik, polen ve tohum özellikleri, uçucu yağ özellikleri ve ekolojik özellikleri belirlendi ve aralarındaki farklar ortaya koyuldu.Polenler ve tohumlar hem ısık hem de Scanning Elektron Mikroskobunda (SEM) incelendi. Morfolojik çalışmalarda taksonların; gövde, yaprak, çiçek, meyve, tohum ve polen kısımlarının ölçümleri yapılarak ayırt edici özellikleri tablolar halinde belirtildi. Anatomik çalışmalarda el ile alınan kesitler safranin-fast green ikili boyama yöntemiyle boyandı. Araştırma mikroskobuyla preparatların fotoğrafları çekildi ve ayırt edici özellikleri tespit edildi. Uçucu yağ bileşenlerinin belirlenmesinde, bitkilerin toprak üstü kısımları kurutularak hidrodistilasyon yöntemiyle uçucu yağları izole edildikten sonrauçucu bileşenleri GC-MS ile analiz edildi. Ekolojik çalışmalarda, bitkilerin genellikle kayalık, taşlık ve step alanlarda yayılış gösterdiği, Akdeniz ikliminin hüküm sürdüğü yerleri tercih ettiği, kumlu-killi-tın ve kumlu-tınlı topraklarda yetiştiği ve topraktaki besin madde durumlarının alandan kaynaklı olarak oldukça yüksek olduğu tespit edildi.
Van'ın Bahçesaray ilçesi Sterrhinae türleri üzerine faunistik bir çalışma (lepidoptera, geometridae)
Tezde, Van İli Bahçesaray ilçesindeki Sterrhinae altfamilyası faunistik olarak araştırılmıştır. Çalışma sonucunda bu altfamilyadaki 5 tribusa ait toplam 25 tür tespit edilmiştir. Alanda tespit edilen tribuslar ve bunlara ait tür sayıları şöyledir: Sterrhini (10), Scopulini (8), Rhodostrophiini (4), Cosymbiini (2) ve Rhodometrini (1). Idaea proclivata ve Rhodostrophia cuprinaria türleri sadece Doğu Anadolu'da bulunur. Buna karşılık, Rhodostrophia bahara, R.cuprinaria, Idaea proclivata, I. humiliata, Scopula transcaspica ve S. diffinaria türleri ise Türkiye, Kafkasya, Iran ve Afganistan başta olmak üzere lokal olarak yayılış gösterir; bundan dolayı nadir türler olarak değerlendirilir.
Van balığı (Alburnus tarichi)'nda üreme göçü sırasında osmoregülasyonda etkili bazı hormonların incelenmesi
Van Gölü, dünyanın en büyük sodalı gölleri arasındadır. Gölün ekstrem özellikleri canlı yaşamını büyük ölçüde sınırlar. Diğer canlılar için ölümcül olan bu ortama Van balığı (Alburnus tarichi) adapte olan tek omurgalı türdür. Van balıkları her yıl üremek için tatlı sulara göç ederler. Üremesini tamamlayan balıklar göl ortamına geri dönerler. Balıklar göç sırasında farklı sucul alanlara maruz kalırlar. Çok hücreli canlılarda olduğu gibi balıklarda da fizyolojik düzenlenmeler endokrin sistem kontrolü altındadır. Bu çalışmada Van balığının üreme göçü sırasında maruz kaldığı göl, mansap, akarsu giriş ve akarsu üst bölgelerdeki suların pH, sıcaklık ve iyon seviyeleri (Na, K, Cl) belirlendi. Ayrıca balıklarda üreme göçü üzerine etkili olduğu bilinen Kortizol, Serbest Triiyodotronin (FT3), Serbest Tiroksin (FT4), İnsülin Benzeri Büyüme Hormonu (IGF-I), Büyüme Hormonu (GH), Prolaktin Hormon (PRL) seviyleri incelendi. Örneklenen iyonların tatlı su lokalitelerinde göl lokalitelerine gore azaldığı, serum iyon seviyelerinin ise belirli düzeyde tutulduğu gözlendi. Hormon seviyelerinin üremenin başladığı göl ortamından üremenin tamamlandığı akarsu üst bölgelerinde farklılık gösterdiği belirlendi. Sonuç olarak, ölçülen hormonların diğer teleost türlerinde olduğu gibi Van balıklarında da osmoregülasyon üzerinde direkt ve dolaylı etkilerinin var olduğu belirlendi.
Pervari (Siirt) ilçesi arı bitkileri
Bu tez çalışmasında, 2017-2019 yılları arasında Pervari (Siirt) ilçesi ve çevresindeki köylerde arıcıların yoğun olarak bulunduğu arı istasyonlarının etrafındaki arı bitkilerinin tespiti yapılmıştır. Ayrıca bu bitkilerin bilimsel adları; nektar, polen ve salgı grupları, yerel ve literatürlerdeki adları, yetiştikleri yerler, yükseklikleri ve bu bitkilerle ilgili zehirli, tıbbi, aromatik, kullanım alanı veya içeriği ile bitkilerin genel özellikleri verilmiştir. Pervari (Siirt) ilçesi Türkiye'nin Güneydoğu Anadolu bölgesinde, Coğrafi Grid sistemine göre C9 karelerine girmektedir. Yapılan çalışmalarda yörede arıcılıkla uğraşan yöre insanlarıyla birebir görüşmeler yapılmış, Pervari Arıcılar Birliğindeki bazı dernek üyelerinden bilgiler alınmıştır. Ayrıca arı ürünleri satan arıcılarla görüşmeler yapılarak arıların yoğun bulunduğu bazı alanlar tespit edilip bu alanlarda arazi çalışmaları yapılıp bitki örnekleri alındı ve fotoğrafları çekildi. Yapılan arazi çalışmaları sonucunda arılar için nektar, polen veya salgı kaynağı olan toplam 50 familyaya ait 264 takson belirlenmiştir. Bu taksonlardan 222 takson otsu, 22 takson çalı formunda, 20 takson Ağaç, 14 takson endemik ve 23 taksonun kültür bitkisi olduğu tespit edildi.
Orta derecede mikrodalga enerjisinin buğdayda çimlenme ve bazı fizyolojik parametreler üzerine etkisi
Bu çalışmada, orta derecede mikrodalga enerjisinin buğday (Triticum aestivum L. Elbistan Yazlığı ve Kayseri Pınarbaşı popülasyonu) tohumlarında çimlenme, erken fide büyümesi, total klorofil, protein, GST ve tiyol miktarı üzerindeki etkisinin araştırılması amaçlanmıştır. İki ekmeklik buğday çeşidine ait tohumlar ev tipi bir mikrodalga fırında 0.5, 1 ve 1.5 dk süre ile orta dereceli enerjiye (460 W) maruz bırakılmıştır. Mikrodalgaya maruz bırakılmış tohumların çimlenme yüzdeleri kontrol bitkilerine göre önemli oranda düşük bulunmuştur. Bu etki, sürenin uzamasına bağlı olarak artmıştır. Islatılarak 1.5 dk mikrodalgaya maruz kalan buğday tohumlarında çimlenme olmadığı gözlemlenmiştir. Fidelerin kök ve gövde uzunluğu üzerinde mikrodalga enerjisinin negatif bir etkisi gözlenmemiştir. Kuru tohumlarda yaş ağırlık parametresinin mikrodalga enerjisinden olumsuz etkilemediği, fakat ıslatılmış tohumlarda süreye bağlı olarak yaş ağırlığın azaldığı görülmüştür. Total klorofil miktarına bakıldığında uygulanan mikrodalga enerjisinin süresi arttıkça klorofil miktarının azaldığı tespit edilmiştir. Protein konsantrasyonununda mikrodalga enerjisinden anlamlı bir şekilde etkilenmediği belirlenmiştir.Total sitozolik GST aktivitesi Kayseri-ıslak, Kayseri-kuru ve Elbistan-kuru örneklerde zamana bağlı artış gösterirken, Elbistan-ıslatılmış örnekte zamana bağlı azalma olduğu belirlenmiştir. Toplam tiyol oranı Kayseri-ıslatılmış ve Elbistan-kuru örneklerde artarken, Kayseri-kuru ve Elbistan-ıslatılmış örneklerde azalmıştır. Anahtar kelimeler: Çimlenme, Mikrodalga enerjisi, Triticum aestivum, Vejetatif büyüme
Türkiye'de yayılış gösteren Muscari mill. (Asparagaceae) cinsi taksonlarına ait morfoloji, palinoloji ve tohum yüzeyi araştırmaları
Bu tez çalışmasında, Türkiye'de doğal yayılışı olan Muscari Mill. (Asparagaceae) cinsine ait taksonların morfolojisi, palinolojisi ve tohum yüzeyi özellikleri araştırılmıştır. Taksonların betimlemeleri yapılmış, teşhis anahtarı hazırlanmış, habitat özellikleri ve arazi gözlemlerine dayalı tehlike kategorileri IUCN kriterlerine göre yeniden düzenlenmiştir. Taksonların palinolojik özellikleri ışık mikroskobu ve taramalı elektron mikroskobu ile belirlenmiştir. Muscari cinsine ait taksonların polenleri monad, monosulkat, şekilleri subprolat-prolat ve ornamentasyonları retikulat olarak tespit edilmiştir. Taksonlara ait tohum yüzeyi özellikleri taramalı elektron mikroskobu ile belirlenmiştir. Tez çalışmasında M. botryoides türü ülkemizden yeni kayıt olarak verilmiştir. M. artvinense ile M. tauricum türleri M. botryoides türünün, M. tuzgoluensis türü M. neglectum türünün sinonimi olduğu yapılan detaylı incelemeler sonucunda tespit edilmiştir. Ayrıca Türkiye'den tanımlanan ve daha sonra sinonim yapılan M. haradjianii türü geçerli isim yapılmış, M. sabihapinari türü de bilim dünyasına yeni bir tür olarak kazandırılmıştır. Bu tez çalışması kapsamında Muscari cinsinin ülkemizdeki tür sayısının 39 olduğu tespit edilmiştir.
Oltu ve narman (Erzurum) ilçelerinde yetişen makromantar üzerinde taksonomik bir araştırma
Bu çalışma, Oltu ve Narman (Erzurum) ilçe sınırları içerisinde doğal olarak yetişen ve 2018-2019 yılları arasında toplanan makromantar örnekleri üzerinde yapılmıştır. Arazi çalışmaları sırasında toplanan mantar örneklerinin yetişme ortamlarında renkli fotoğrafları çekilmiş, mantarların ekolojik ve morfolojik özellikleri ile yöre halkının makromantarlar hakkındaki bilgiler kaydedilmiştir. Arazi ve laboratuvar çalışmaları sonucunda teşhisleri yapılan örneklerin Leotiomycetes, Pezizomycetes, Sordariomycetes, Agaricomycetes ve Dacrymycetes sınıflarına ait 12 takım, 45 familya ve 92 cins içerisinde dağılım gösteren toplam 208 makromantar türü olduğu tespit edilmiştir. Bunların 66'sı yenen, 103'ü yenmeyen, 31'i ise zehirli olarak belirlenmiş ve 8 türün ise yenilebilirlik durumu tespit edilememiştir. Ayrıca 10 makromantar türü ilk defa bu çalışma ile tespit edilerek ülkemiz mikotasına yeni kayıt olarak ilave edilmiştir. Bunlar: Hyaloscypha aureliella, Parascutellinia carneosanguinea, Agaricus leptocaulis, Lepiota bouderi, Cortinarius confirmatus, C. smithii, Entoloma lampropus, Galerina vittiformis, Hebeloma anthracophilum ve Inocybe sublilacina'dır. Teşhisleri yapılan makromantar türlerinin sistematikleri, bazidiokarp, askokarp ve spor fotoğrafları, diğer özellikleri, yayılışları ve yeni kayıt olan türlerin deskripsiyonları verilmiştir.