Histopatolojik görüntülerin analizi ve işlenmesi

Nöroblastom çoğunlukla bebekleri ve çocukları etkileyen nöral hücre kökenli bir kanserdir. Tümörün tedavi planlaması için patologlar tarafından histopatolojik inceleme gerekmektedir. Bu histolojik analiz hastalık evresini tespit etmek ve tedavi yöntemleri hakkında bilgi vermek için uzman hekimlere rehberlik eder.Ne yazık ki patologlar tarafından mikroskop altında yapılan nitel görsel inceleme uzun süren bir işlemdir ve çeşitli faktörlerden dolayı hata yapmaya yatkındır. Öncelikle, nöroblastom teşhisi için, patologlar genel olarak daha düşük büyütme oranlarında (2x, 4x, vs.) bazı belirgin bölgeleri alırlar. Tüm slayt hakkındaki son karar bu örnek bölgelere bağlıdır. Bu yaklaşım doğru karar verilmesini sağlasa da heterojen tümörler için yanıltıcı olabilir. İkinci olarak, son teşhis farklı kişilerin incelemesine göre önemli ölçüde farklılık gösterebilmektedir. Deneyim ve yorgunluk patologlar arasında önemli farklılıklara neden olabilir.Bu tezin amacı, görüntü işleme ve sınıflandırma teknikleri kullanarak bir algoritma geliştirmek ve bu algoritma ile teşhisi patologlar için mümkün olduğunca kolaylaştırarak kişisel hataları en aza indirmektir. Bu amaçla, nöroblastom hastasından alınan doku örneğine ait görüntüler histolojik olarak incelenmekte ve analiz edilmektedir. Nöroblastom doku örneğinden elektron mikroskobu yardımı ile farklı büyütme oranlarında görüntüler alınmaktadır. Bu alınan görüntüler kullanılarak nöropil yüzdesi hesaplanır ve tümör hücreleri tespit edilir. Çeşitli görüntü işleme teknikleri uygulandıktan sonra resimlerden çıkarılan bölgesel ve dokusal öznitelikler ile öznitelik matrisleri oluşturulur. Daha sonra bu öznitelik matrisleri yapay sinir ağları ve diğer bazı otomatik öğrenme algoritmalarına giriş olarak kullanılarak hücrelerin sınıflandırılması sağlanmaktadır. Bu sınıflandırma sonuçlarına bağlı olarak mitosis karyoreksis (MK) indeksi ve diferansiyasyon derecesi hesaplanmaktadır. Bu sayede nöroblastom doku görüntülerinden hastalık safhası tespit edilerek patologlara yardımcı bir araç sağlanmaktadır.