Dna mikrodizi analizleri ile meme kanseri hastalarında prognozun genetik algoritma kullanılarak belirlenmesi

Meme kanseri ölüme neden olabilen ciddi bir rahatsızlıktır. Erken teşhis hastalığın tedavisinde önemli rol oynar. Son yıllarda mikrodizi teknolojisi kanser teşhisinde sıklıkla kullanılmaktadır. Mikrodizi gen ifade bilgisi ölçmeye yarayan bir araçtır. Mikrodizi verisi genellikle on binlerce gen bilgisi ve az sayıda örneklem içermektedir. Ancak bu genlerin pek çoğu ilgisiz ve klinik teşhis için gereksiz bilgiden ibarettir. Yüksek boyut ve aşırı eğitim riski sebebiyle makine öğrenme teknikleri ile bu verilerin sınıflandırılması zordur. Bu sebeple nitelik seçme gen analizlerinde çok önemlidir. Nitelik seçme, sınıflandırma başarısını en iyi yapacak niteliklerin seçilmesi işlemidir.Bu çalışmada meme kanseri hastalığında etkin rol oynayan genlerin belirlenmesi için filtreleme yöntemi ve genetik algoritma tabanlı yeni bir gen seçme metodu önerilmektedir. Yapılan çalışma iki aşamadan oluşmaktadır: İlk aşamada filtreleme yöntemi ile gen ifade verisi indirgenmiş, ikinci aşamada genetik algoritma ile meme kanserinde etkin rol alan genlerin tespiti gerçekleştirilmiştir. Destek vektör makinesi, genetik algoritma için uygunluk fonksiyonu olarak kullanılmıştır. Yapılan çalışmada belirlenen 7 gen ile sınıflandırma doğruluğu %96,15 olarak elde edilmiştir.