Irak'ta idrar yolu enfeksiyonu hastalarında klinik enterokok türlerinin genetik çeşitliliğinin rastgele çıkartılmış polimorfik DNA (RAPD) analizi ile incelenmesi

Enterococcus cinsi bakterilerin son yıllarda önemli nozokomiyal patojenler olarak ortaya çıkması, bu mikroorganizmaların neden olduğu enfeksiyonların patogenezinde rol oynayan faktörlerin araştırılması ihtiyacını ortaya çıkarmıştır. Bu çalışmanın amacı, Irak'ın Salahaldeen kentindeki hastanelerde yüksek oranda görülen Enterococcus cinsi bakterilerin varlığını, virülans özelliklerini ve genetik çeşitliliğini belirlemektir. Dolayısıyla bu tez çalışması çerçevesinde en yüksek oranda E. faecalis türü tespit edilmiş, bunu E. faecium, E. avium ve E. gallinarum türleri izlemiştir. En sık izole edilen klinik kaynaklar idrar yolu enfeksiyonları (İYE), gastrointestinal sistem (GİS) ve kan örnekleridir. İYE ve hastanede kolonize izolatlardan E. faecium ve E. gallinorum olarak tanımlanan tüm izolatlar antibiyotiklere dirençliyken, E. avium izolatları vankomisine dirençli olarak tespit edilmiştir. En yüksek direnç oranları eritromisin, kinupristin/dalfopristin, tetrasiklin, norfloksasin, siprofloksasin, levofloksasin ve vankomisinde belirlenmiştir. Ayrıca, çalışma örneklerinin 83'ü (%78,3) çoklu ilaca dirençli olarak sınıflandırılmıştır. E. faecalis örnekleri arasında en yaygın virülans genetik belirleyicisi gelE iken, bunu asa1, cylA ve esp genleri takip etmiştir. E. faecium örnekleri arasında esp geninin sıklığı daha yüksek olup bunu hyl geni izlemiştir. Çalışma örnekleri arasında üç klonal grup baskın bulunmuştur; bunlardan biri vankomisin ve yüksek düzeyde aminoglikozidlere dirençli örneklerin çoğunluğu ile tanımlanan ve asa1, cylA ve gelE genlerinin oluşturduğu virülans genetik profilini taşıyan E. faecalis; diğer ikisi ise çoğunlukla vankomisine dirençli olan ve virülans genetik belirteçlerini, özellikle de hyl'i taşıyan E. faecium örneklerini içermektedir. Buna ek olarak, vankomisine dirençli ve esp virülans genini taşıyan tek bir E. avium örneğinin varlığı dikkat çekicidir. Ayrıca hastaların gastrointestinal sisteminin (GİS) kolonizasyonundan iki vankomisin dirençli E. gallinarum klonu izole edilmiştir ki, bu da çok sık karşılaşılan bir durum değildir. Yüksek çoklu ilaç direnci oranlarının çoğunluğu yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalardan izole edilmiştir. Bu çalışma, hastanelerde Enterococcus enfeksiyonları, özellikle de çoklu ilaç direnci ve vankomisin direnci konusunda artan endişeleri vurgulamaktadır. Dirençli bakterilerin yayılmasını önlemek için sürveyans ve enfeksiyon kontrol önlemleri şarttır. Tedavisi zor olan bu enfeksiyonlarla mücadele etmek için alternatif tedavi stratejileri ve antibiyotiklerin geliştirilmesi önem arz etmektedir