Konya ve Niğde illeri civarında yeni tesis elma bahçelerinde elma mozaik virüsü (Apple mosaic Virus, APVM'nün saptanması ve karakterizasyonu

Bu çalışma 2017-2019 yılları arasında ilkbahar ve yaz dönemlerinde Konya ve Niğde illerinde yeni kurulan elma bahçelerinde Elma Mozaik Virüsü (Apple mosaic virus, ApMV)'nün saptanması ve karakterizasyonu amacıyla yürütülmüştür. Arazi çıkışlarında simptomatolojik olarak 14 bahçe ve 6220 da alan taranmış ve ApMV ile infekteli olduğundan şüphelenilen toplam 130 adet elma ağacından örnekleme yapılmış DAS-ELISA testleri sonucunda 32 bitki bulaşık bulunmuştur. ApMV'ye spesifik 92D9UP (1) ve 1425RE (2) primer çifti ile kullanılarak yapılan RT-PCR çalışmaları sonucunda, DAS-ELISA'da pozitif çıkan örneklerden 382 bp büyüklüğe sahip band elde edilmiştir. Bunlar arasından seçilen, Konya-Kutören izolatlarının (ApMV-2, ApMV-3, ApMV-4, ApMV-7, ApMV-15 ve ApMV-33), ApMV-2 (Kutören 3-2) ve ApMV-33 (Kutören4-1 ) izolatları diğerlerinden farklı olarak kendi aralarında bir grup oluştururken, ApMV-3 (Kutören 3-3) ve ApMV-4 (Kutören 3-4) izolatları (Türkiye (KX034209.1), Güney Kore ( LC006865.1), Kanada ( KY971021.1), Çek Cumhuryeti ( LT574872.1), Hindistan ( FN564150.1), Slovakya (HG328268.1), Avusturalya (KY883320.1), Belarus (HG328270.1), Antarktika (KC4690368.1), Brezilya (GQ13185.1), İtalya (AY542546.1) ve Norveç (KC469067.1) ile aynı gruba dahil olmuştur. Buna karşılık ApMV-15 (Kutören 1-3) izolatı diğer izolatlarla %80 benzerlik göstermesine rağmen tek başına farklı bir grup oluşturmuştur. ApMV-7 (Kutören 3-7) izolatı ise, Türkiye'de daha önceden tanımlanmış ApMV izolatı (JX155668.1) ile aynı grupta yer almıştır.