Kuraklık ve tuz stresi altındaki phaseolus vulgaris L'e ait set domain gen ailesinin omik yaklaşımlar ile ifade seviyelerinin belirlenmesi

SET domain gen ailesi, histon metiltransferaz genleri olarak bilinen ve kromatin yapısının epigenetik düzenlenmesinde görev yapan önemli gen ailelerinden biridir. Korunmuş bir SET domaini içeren proteinler tarafından, histon kuyruklarında bulunan lizin kalıntılarının metilasyonu katalize edilmektedir. Yapılan literatür taramalarına göre, Phaseolus vulgaris'in SET domain gen ailesi için yapılan genom çaplı analiz çalışmalarının olmadığı tespit edilmiştir. Bu çalışmada, tuz ve kuraklık stres faktörlerine maruz bırakılan fasulye yapraklarında SET domain genlerinin ifade profillerinin değerlendirilmesi ve omik yaklaşımlar aracılığıyla SET domain gen ailesi üyelerinin genom çaplı analizlerinin yapılması amaçlanmıştır. Yapılan çalışma sonucunda, Phaseolus vulgaris genomunda 11 farklı kromozom üzerinde yer alan 49 SET domain geni tespit edilmiştir. P. vulgaris, Glycine max, Arabidopsis thaliana ve Hordeum vulgare türlerinden SET domain proteinleri kullanılarak filogenetik analiz yapılmıştır. P. vulgaris ve G. max türlerinin SET proteinlerinin evrimsel süreçte daha yakın ilişki gösterdiği saptanmıştır. Seçilen 10 Phvul-SET geni üzerinde RT-qPCR çalışmaları yapılarak ifade seviyeleri tuz ve kuraklık uygulamaları altında incelenmiştir. Phvul-SET-34 ve Phvul-SET-36 genlerinin tuz ve kuraklık stresine karşı aşırı ifade edilmesi ile elde edilen sonuçlar bu genin kuraklık stresine karşı yanıtta görev aldığını doğrulamıştır. Bu çalışmadan elde edilen bulguların, tuz ve kuraklık streslerine yanıt olarak Phvul-SET-34 ve Phvul-SET-36 genlerinin rolü ile ilgili literatürdeki mevcut bilgi boşluğunu doldurması beklenmektedir ve fonksiyonel çalışmalarla doğrulanması gerekebilir. Anahtar Kelimeler: Phaseolus vulgaris, SET domain gen ailesi, abiyotik stres, domain, intron