TAF7 ekspresyonunun sirna ile baskılanması sonrasında apoptotik süreçteki değişikliklerin araştırılması

HIV enfeksiyonunun biyoloji ve immunopatogenezini anlamak, terapötik stratejilerin ve profilaktik aşıların geliştirilmesinde büyük önem taşımaktadır. HIV genomundaki 9 genden biri olan Tat, gen ekspresyonu için gerekli olup işlevlerini üç başlık altında toplayabiliriz: 1) Proviral genlerin transkripsiyonel transaktivasyonu, inisiyasyon ve elongasyon süreçlerini desteklemek 2) Kimi konak hücre genlerinin ekspresyonlarını özellikle pre-inisiyasyon kompleks yapısını bozarak transkripsiyon düzeyinde baskılamak 3) Konak hücrelerde apoptozu tetiklemek. Genel transkripsiyon faktörü TFIID'nin yapısında yer alan TAF7 geninin HIV Tat' ın ökaryotik işlevsel homoloğu olduğu ileri sürülmüştür. TAF7, HIV Tat proteinine benzer şekilde elongasyonu destekleme veya transkripsiyonu baskılayabilme özelliklerini barındırmaktadır. Ancak HIV Tat gibi programlanmış hücre ölümünde rolü olup olmadığı araştırılmamıştır. Apoptoz yolaklarının tanımlanması büyük önem taşımaktadır. Fakat apoptoz sürecinin parçası olan genel transkripsiyonun baskılanma mekanizması bilinmemektedir. Hipotezimiz, bir apoptoz bulgusu olan transkripsiyon durdurulmasının TAF7 üzerinden gerçekleştiği yönündedir. Bunu test etmek amacıyla radyasyon, etoposit ve MGBG apoptotik uyarılarını alan hücre kültürlerinde siRNA oligonükleotidleri kullanılarak TAF7'nin ekspresyonunu baskılanıp, apoptotik cevapları ölçüldü. TAF7 ekspresyonu baskılanan HeLa ve Kelly hücre hatlarında radyasyon, etoposit ve MGBG uygulamaları karşısında apoptotik davranışın kontrol grubu hücrelerine göre 4-6 kat azaldığı gözlendi. TAF7 over-ekspresyonu yaptığımız çalışmalarda, hücrelerde HIV Tat'a benzer şeklide mikrotübül stabilizasyonu yoluyla apoptozu tetiklediğini gösterdik. Ayrıca viral ekspresyonlarda interferon uyarımına cevaben protein düzeyi artan CTIIA'in, HIV Tat proteini ile olduğu gibi TAF7 ile de ilişkili olduğunu immün presipitasyon deneyleri ile gösterdik. Sonuç olarak TAF7'nin apoptotik süreçte rol aldığı ve apoptozun genel transkripsiyon mekanizması ile ilişkili olduğu ilk kez gösterilmiştir. TAF7'nin, HIV Tat proteini ile olan işlevsel benzerliklerinin farklı alanlarda gösterilmesi HIV araştırmalarına büyük katkı sağlayacaktır.