3
Archived Theses
0
DOIs Assigned
0%
DOI Rate
Discipline
Investigation of the antibiotic resistance Escherichia coli from the water and fish samples from mogan lake: An insight for the possible humain health risks
The use of antibiotics, important for human and animal health, is constantly increasing. It is observed that antibiotic resistance increases in pathogenic or non-pathogenic bacteria. In this study, the presence of antibiotic-resistant E. coli in the intestines of Mogan Lake water and fish living here and offered for consumption was investigated. Thus, the risks in terms of human health were evaluated. 8 waters in total; A total of 16 fish samples, 3 from each of 2 invasive species (A. boyeri and P. parva) and C. carpio (carp), Esox lucius (pike) and T. tinca (velvet) fish, were taken. Intestinal contents and water samples from fish were cultured, DNA of E. coli isolates was isolated, and then RT-PCR was performed. According to the PCR results, the presence of some genes encoding amoxicillin-clavulanic acid (OXA1) quinolone (qnrA) and colistin (mcr1-5) resistance was also detected in most of the E. coli detected samples. These results suggest that the aquatic environment may play an important role in the development of resistant antibiotics and the spread of resistance genes among bacteria
Isolation and molecular identification of some types of soil bacteria, testing its ability to produce silver nanoparticles and investigating their effectiveness against leishmania tropica and molecular analysis of this parasite
This study was designed to synthesize AgNPs from supernatant-free cellcultures of some soil bacteria. Three bacteria (Pseudomonas aeruginosa (strain ALK320), Bacillus cereus (strain HNB5), and Corynebacterium striatum (strain 1910I14)) have been isolated and confirmedby PCR with universal primers. Then, the sequence results aligned with National Center for Biotechnology Information (NCBI) to ensure the species. These three bacteria were grown in nutrient broth to produce nanoparticles. Many approachesareusedtoverifytheproduction of AgNPs. Theystartwithcolorchanges, UV-visible, TEM, Scanning Electron Microscope, and end with EDX. The polymerase chain reaction (PCR) was used to identify Leishmania tropica (L. tropica); in which two primers were used to amplifythe 18sRNA gene, and they are a specific primer of gene LITSR/L5.8S, which gave an amplification product of 450bp, and a specific primer of gene mkDNA, which provided an amplification product of 120bp. The sequencing results showed a matchof 100% for L.tropica in the NCBI using the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). The maximum antileishmanial activity of extracellular AgNPs on L. tropica is recorded as growth inhibition (64.72%)at 400 μL /mL after being suppressed following 24 h of incubation by AgNPs synthesized using P. aeruginosa, B. Cereusand C. Striatumassays.The MTT assay revealed incredible results for AgNPs as Leishmania antiparasitic activity, to sum up, our novel approach to leishmaniasis treatment opens up new possibilities. Also, these AgNPs synthesized from natural materials can be used to treat a wide range of pathogenic bacteria and parasites.
Farklı sürelerde ve koşullarda bekletilen buttum (pistacia khinjuk stocks) tohumlarında fizyolojik dormansinin araştırılması
Olumsuz çevresel faktörlerin, canlı yaşamı için zorlayıcı boyutlara ulaştığı dönemlerde, hayatta kalmayı başarabilecek adaptasyonlar geliştirmek, tür neslinin devamı bakımından kritik önem taşımaktadır. Bitkilerde bu davranış canlılık fonksiyonlarının minimum düzeye indirildiği dormansi ile sağlanır. Tohumların bekletilme koşulları ve süresinin fizyolojik dormansi üzerinde etkisinin olduğu bilinmektedir. Yabani Pistacia türleri ülkemizde özelikle Pistacia khinjuk Stocks (buttum) fıstık anacı olarak kullanılmaktadır ve düşük çimlenme oranları günümüzde istenilen anaç sayısını elde etmede hala bir sorun olarak devam etmektedir. Bu çalışmada fizyolojik dormansinin değerlendirilmesi amacıyla yeni hasat edilen ve 1, 2, 3 ve 4 yıllık tohumlar 4 oC ve 25 oC de bekletilerek çimlendirilmiştir. Bu çimlenme verileri endospermde, nişasta miktarı ve beta amilaz aktivitesi embriyoda, absisik asit (ABA) giberellik asit (GA3) miktarı ile desteklenerek fizyolojik dormansi anlaşılmaya çalışılmıştır. Çalışmamızda tohumlara herhangi bir dormansi kırıcı ön işlem uygulanmamıştır. Bu koşullarda en yüksek çimlenme oranı (%81) yeni hasat edilen tohumlarda görülmüştür. Nişasta miktarı en yüksek (56 mg/g) yeni hasat, en düşük (29.71 mg/g) değeri ile 25 oC 4 yıl bekletilen tohum endospermlerinde tespit edilmiştir. Beta amilaz aktivitesi en yüksek (26.86 EU/g) 4 yıl 25 oC, en düşük (10.95 EU/g) yeni hasat tohumu endospermlerinde görülmüştür. ABA/GA3 oranı en yüksek (5.05 ng/g) yeni hasat, en düşük (0.89 ng/g) değeri ile 3 yıl bekletilen tohum embriyolarında bulunmuştur. Tohumların bekletilme sıcaklığının tohum çimlenmesinde fark edilir bir etkiye sahip olmadığı görülmektedir. Bekletilme süresince ABA/GA3 oranında azalma olmasına rağmen çimlenme oranında fark edilir derecede çimlenme artışı olmamıştır. Bekletilme süresince ABA/GA3 değerinin azalması ile beta amilaz aktivitesinde artma ve nişasta miktarında azalma görülürken çimlenme oranının artmadığı tespit edilmiştir. Bu bulgular, P. khinjuk tohumlarında fizyolojik dormansisinin belirlenmesi için alternatif parametrelerin araştırılması gerektiğini göstermektedir.