Adana ve Mersin illeri domates alanlarında hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus, cmv)'nün karakterizasyonu

Bu çalışma, 2017-2019 yılları arasında ilkbahar ve yaz dönemlerinde Adana ve Mersin illerinde domates üretim arazilerinde Hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus, CMV)'nün saptanması ve karakterizasyonu amacıyla yürütülmüştür. Domates alanlarında simptomatolojik olarak CMV ile enfekteli olduğundan şüphelenilen toplam 150 adet domates bitkisinden yaprak ve meyve örnekleri alınmış ve DAS-ELISA testleri sonucunda 29 bitkide CMV infeksiyonu saptanmıştır. RT-PCR çalışmaları, CMV'ye spesifik RW8 (5'-GGTTCGAA (AG)(AG)(AT)ATAACCGGG–3') ve RV11 (5'-GTTTATTTACAAGAGCGTAC GG–3') dejenere primer çifti kullanılarak, DAS-ELISA da pozitif olarak saptanan 29 örnek içerisinden 9 izolat ile yürütülmüş ve 650 bp büyüklüğünde bant elde edilmiştir. Bunlar içinden survey alanlarını temsil edecek şekilde CMV-12 (Tuzla K12), CMV-17 (Ceyhan C25) ve CMV-21 (Erdemli E29) olmak üzere 3 izolat seçilmiş ve DNA dizileme çalışmalarında kullanılmıştır. Dizi analizleri sonucunda, dünyanın farklı ülkelerinden rapor edilen CMV izolatları kullanılarak oluşturulan filogenetik ağaç üzerinde CMV-12 ve CMV-21 izolatları aynı grupta yer alırken, CMV-17 izolatı farklı bir gruba dahil olmuştur.