In silico target prediction of 6-gingerol and similar compounds as possible anticancer agents

Kanser halen milyonlarca insanı etkilemekte ve dünya çapında hastalık ve ölümlere neden olmaktadır. Yaygınlığı nedeniyle, yeni antikanser ilaçların keşfi farmasötik kimyada her zaman popüler bir konu olmuştur. Doğal ürünler, güvenilir bir biyoaktif madde kaynağı ve yeni terapötik ipuçları için zengin bir kaynak sağlar. Ayrıca, bitkisel maddeler daha az yan etkiye sahiptir, nispeten ekonomiktir ve güçlü bir alternatif sunar. Bu nedenlerle, çalışmada, zencefildeki (Zingiber officinale Roscoe) polifenollerden biri olan ve özellikle antikanser aktivite olmak üzere çeşitli biyolojik aktivitelerle karakterize edilen 6-gingerol üzerine odaklanıldı. İlk olarak benzerlik taraması kullanarak 6-gingerol'ün benzer analoglarını tarandı ve daha sonra in silico hedef belirleme sunucuları kullanılarak 6-gingerol ve benzer bileşiklerinin varsayılan biyolojik hedefleri araştırıldı. Özellikle bir antikanser hedef olarak kinazlar üzerindeki etkisine odaklanıldı. 6-gingerol ve benzerleri için B-Raf proto-onkojen serin/treonin kinaz (B-RAF), Janus kinaz (JAK1/2), hücre dışı sinyale düzenlenen kinaz (ERK1(MAPK3)) ve insan p38 mitojen-aktive kinazı (p38γ) ile kenetlenme çalışmaları gerçekleştirildi. Hesaplamalı çalışmalar, vanilglikol, L-(+)-vanilmandelik asit, dehidrozingeron, 2-metoksiestron, metilvanilat, dihidrokoniferil aldehit, pratensein, asetovanillon, asetosiringon, likokalkon B, izoferulik asit, kurkumin PE ve koniferaldehitin bu hedeflerden en az biriyle etkileşime girebileceğini ortaya koymuştur. Ayrıca, incelenen tüm bu bileşikler Lipinski'nin beş kuralını karşılamıştır. Toksisite tahminleri için kullanılan hesaplamalı yaklaşımlar, bileşiklerin hiçbirinin kardiyak ve hepatik organlar üzerinde toksisiteye sahip olmadığını ortaya koymuştur. Ayrıca, seçilen bu bileşikler bir veya daha fazla tümör hücresi üzerinde toksisiteye sahiptir. Sonuç olarak, in silico hedef ve toksisite tahminleri, 6-gingerol ile benzer moleküller olan bu bileşiklerin, gelecekteki öncü optimizasyon çalışmalarında daha da geliştirilebilecek potansiyel antikanser adaylar olduğunu ortaya koymuştur.