Determination of the effect of KIF3A gene polymorphism in children with atopic dermatitis

Atopik dermatit (AD), çocukluk çağında en sık görülen kronik, kaşıntılı, tekrarlayan inflamatuar deri hastalığıdır. Deri bariyerinin bozulması ve immün yanıtın (özellikle Th2 yanıtının) abartılı olması, atopik hastalıkların gelişimi, şiddeti ve devamlılığı ile ilişkili görünmektedir. Deri bariyeri/epidermal düzenleme genleri ve bağışıklık yanıtı/konak savunmasında yer alan genler kilit roller oynar. Ancak bu ilişkilerin mekanizması henüz net değil. Son yıllarda KIF3A'nın cilt bariyeri homeostazı ve inflamasyonunda önemli rolü olabileceğini gösteren çalışmalar artmaktadır. Literatürde KIF3A geni (rs2897442) polimorfizmi ile AD arasındaki ilişkiyi ortaya koymaya başlamıştır. Bugüne kadar atopik dermatit ile genetik mutasyon arasındaki ilişki Türk popülasyonunda gösterilememiştir. Bu çalışmada, atopik dermatitli Türk çocuklarında meydana gelen inflamatuvar değişiklikler ve KIF3A mutasyonu ile bunların birbirleri ile ilişkisinin araştırılması amaçlanmaktadır. KIF3A geni (rs2897442) polimorfizmi 2 ay ile 16 yaş arası 48 atopik dermatitli, 46 sağlıklı çocukta araştırıldı. Yaş, cinsiyet, atopi durumu, SCORAD, eşlik eden başka alerjik hastalık varlığı, aile öyküsü gibi klinik veriler ile eozinofil sayısı, yüzdesi, total Ig E, deri prik testi sonuçları kaydedildi. DNA izolasyonu DNA İzolasyon Robotu kullanılarak yapıldı. Sonra sonra KIF3A tespit kiti kullanılarak Real-Time PCR (RT-PCR) yapıldı. Daha sonra hem hasta hem de kontrol gruplarından alelik ayrım elde edildi. Daha sonra SPSS 26.0 programında Fisher's Exact Testleri ve Ki-kare testleri kullanılarak istatistiksel analizler yapılmış ve ayrıca sayısal değerler için student's t-testi ve Mann-Whitney U-test ve Kruskal-Wallis testinden yararlanılmıştır. 0,05'ten küçük veya eşit olan p değerleri istatistiksel olarak anlamlı kabul edilir. Atopik dermatitli 48 hasta ( E: 25, K: 23, ortalama yaş 4,89 ± 3,67 yıl) ve kontrol grubundaki 46 sağlıklı çocuğun (E: 27, K: 19, ortalama yaş 3,76 ±2.83 yıl) KIF3A bölgesi genotiplendi. Atopik dermatitli bireylerde total IgE, mutlak eozinofil sayısı ve eozinofil yüzdesi sağlıklı bireylere göre daha yüksekti. KIF3A genotipi ile atopik dermatit ve kontrol grupları arasında anlamlı fark yoktu (p=0,08). CC genotipini taşımak, atopik dermatit hastalık riskini kontrol grubuna göre 4 kat arttırmaktadır (p=0,043, χ2 =4,610, OR=4,053, %95). CI=1.051-15.631). T alelinin taşınması atopik dermatite karşı koruma sağlar (p=0.040, OR=0.235, %95. CI=0.061-0.905). TT genotipinde mutlak eozinofil sayısı daha düşükken (p=0,023), C alleli olanlarda daha yüksek değerlere sahiptir (p=0,023). KIF3A gen polimorfizmi ile atopik dermatitin şiddeti arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmadı. Sonuç olarak, Bu çalışma,Türk popülasyonu için atopik dermatit gelişiminde KIF3A gen polimorfizmi riskini araştıran ilk pilot çalışmadır. Homozigot bir C (CCgenotip) taşımak AD geliştirme riskini artırır ve T aleli taşımak AD riskini azaltır. TT genotipinde mutlak eozinofil sayısı daha düşük, C aleli olanlarda ise daha yüksektir. Bu bağlamda gen polimorfizminin daha geniş bir çalışma grubunda yapılması, genotip-fenotip ilişkisi ve tedaviye etkisinin daha fazla analiz edilmesi önerilmektedir.