Bazı kendilenmiş domates hatlarında ssr markörlerle filogenetik analizi

Bu çalışmada özel bir firmadan elde edilmiş 12 adet kendilenmiş domates hattın 20 adet SSR markörü kullanılarak birbirleri arasındaki farklılıkların tespit edilmesi ve SSR markör yöntemi ile çeşit adayı olarak birbirinden ayırabilmek amacı ile yapılmıştır. Çalışmada toplam 139 adet allel elde edilmiş ve en düşük allel sayısı 3, en yüksek allel sayısı 10 olarak gözlemlenmiştir. Ayrıca en düşük ve en yüksek polimorfizm bilgi içerikleri (PIC) sırası ile 0,562 ile 0,893 arasında değişmiştir. Ortalama polimorfizm bilgi içeriği ise 0,810 olarak hesaplanmıştır. UPGMA yöntemi kullanılarak yapılan dendogram ile kendilenmiş domates hatları 2 ana gruba ve bu grupların altında alt gruplara ayrıldığı tespit edilmiştir. Kendilenmiş domates hatlarının üzerinde bağlanan SSR markörlerinin oluşan allellerin moleküler büyüklükleri kullanılarak her bir kendilenmiş domates hattı belirli bir düzende kod verilmiştir ve bu hatlar arasında bu şekilde tanı yapılmıştır. Bu çalışma sonucunda SSR markör kullanılarak kendilenmiş domates hatlarının birbirinden ayrılarak diğer tanımlama yöntemlerinin yetersiz kaldığı durumlarda yol gösterici olacağı ortaya konulmuştur.