Çukurova bölgesinde domates sarı yaprak kıvırcıklık virüsü (Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)nün ırklarının araştırılması

Tomato yellow curl virus (TYLCV) örtüaltı domates yetiştiriciliğinin yapıldığı alanlarda domateste (Lycopersicum esculentum) önemli ekonomik kayıplara neden olan bir viral etmendir. TYLCV ile bulaşık bitkilerde gelişme geriliği ile beraber yapraklarda kıvırcıklık, küçülme ve sararma gibi simptomlar görülmektedir. Birçok ırkı rapor edilen TYLCV'nin ırklarının simptomatolojik olarak ayırt edilmesi mümkün değildir. Bu çalışma, 2017 yılında Adana ve Mersin illerinde TYLCV'nin ırklarının araştırılması amacıyla gerçekleştirilmiş. Yaprak örnekleri TYLCV ile bulaşık bitkilerden toplanmış ve TYLCV'nin varlığı saptanmıştır. Bu çalışmada kullanılan TYLCV ırklarına spesifik primer çiftleri (TYLCV-IL , TYLCV-Mld) ile iki ırkı tespit edilmiştir. Aynı simptomları gösteren fakat ırklara spesifik primer çiftlerine bant vermeyen izolatlar, V1 kılıf protein bölgesini amplifiye eden (777 bp) primer çiftiyle testlenmiştir. Filogenetik analizler sonucunda, TYLCV-IL ve TYLCV-Mild'e bant veren izolatlar farklı ülkelerde rapor edilmiş bu ırklar ile yaklaşık %99 benzerlik göstermiştir. Ancak Mersin'den alınan iki izolatın, 777 bp büyüklüğündeki kılıf proteinin filogenetik analizinin sonucunda, dünya genelinde rapor edilmiş birçok TYLCV ırkı ve izolatıyla benzerliği olduğu tespit edilmiştir. Bu sonuçlar ışığında, TYLCV'nin birçok viral varyantının Akdeniz Bölgesi'nde örtüaltında gerçekleştirilen domates yetiştiriciliğini tehdit ettiği ortaya konmuştur. Anahtar Kelimeler: PCR, Domates, Karakterizasyon, DSYKV, Irk