Kültürden bağımsız metotlarla aydın ili ve çevresindeki sıcak su kaynaklarında siyanobakteri çeşitliliğin belirlenmesi

Amaç: Bu tezin amacı, Aydın ili ve çevresindeki kaplıcalardan kültürden bağımsız yöntemlerle siyanobakteri çeşitliliğini belirlemektir. Materyal ve Metodlar: Toplam genomik DNA'lar su, çamur veya toprak örneklerinden izole edildi ve ekstrakte edilmiş çevresel DNA'lardan 16S rDNA genleri PCR yöntemi ile amplifiye edildi. Amplikonlar daha sonra E.coli hücrelerine klonlandı, mavi-beyaz koloniler arasından transforme olmuş beyaz koloniler seçildi ve M13 primerleri kullanılarak PCR reaksiyonları yapıldı. M13 PCR ile elde edilen amplikonlar dizilendi ve GenBank veri tabanında BLAST analizine göre diğer bakteriyal gruplar ile olan homolojiler belirlendi. Bulgular: Klonlama sonucu elde edilen fragmanların toplam sayısı 298 olup, yapılan sekans analizi sonucunda 201 tanesinin siyanobakteriler ile, 97 tanesinin ise diğer bakteriyal filumlar ile en yüksek homolojileri gösterdikleri belirlenmiştir. BLAST analizi sonucu bulunan yüzde özdeşlik %78 ila %100 aralığındadır. En sık tespit edilen taksonlar, Planktothricoides raciborskii, Trichocoleus desertorum, Spirulina subsalsa, Gleobacter violaceus, Leptolyngbya laminosa, Synechococcus sp. ve Alkalima pantanalense olarak belirlenmiştir. Sonuç: Çalışmamız, Türkiye'de Aydın İli ve çevresindeki termal ortamlardan termofilik siyanobakterilerin belirlenmesinde kültürden bağımsız bir yaklaşım içermesi açısından önemlidir ve ekstrem habitatlardaki siyanobakteri araştırmalarına yeni bakış açıları sağlayabilir. Anahtar Kelimeler: Siyanobakteriler, Kültürden Bağımsız Yöntem, Kaplıcalar ve 16S rDNA.