Fotooksidatif stresin E. coli'de porin protein sentez düzeyine etkisinin araştırılması

OmpF ve OmpC E. coli'nin dış membranında bulunan porin proteinleridir ve çevresel faktörlere bağlı olarak sentez oranları değişmektedir. Bu çalışmada göl suyunda fotooksidatif stres altında yaşam için E. coli`nin OmpC ve OmpF porin proteinlerinin rolü, bu proteinlerin sentezindeki değişim ve bu değişimde envZ, ompR ve pta mutasyonlarının etkisi araştırılmıştır. Göl suyunda farklı sıcaklıklarda elde ettiğimiz verilere göre fotooksidatif stres altında OmpF ve OmpC porin proteinlerinin mutasyona uğratılmasının E. coli nin yaşam süresini arttırdığı belirlenmiştir. 37°C'de t90 değerine göre 1 log azalma yabani tip E. coli' de 19.4 saatte, ompR mutant (MH1160)'da ise 8 dakikada gözlenmiştir. MSR31 (ompR-) ile yapılan çalışmada ise 48 saatten fazla olarak belirlenmiştir. Dolayısı ile OmpR'nin oksidatif stres genleri ile ilişkisi olduğu düşünülmektedir. OmpF porin proteinlerinin sentezi, göl suyu şartları nedeniyle fotooksidatif stresten bağımsız olarak azalırken, OmpC sentezi fotooksidatif strese bağlı olarak azalmıştır. envZ ve pta gen mutasyonlarının fotooksidatif strese altında E. coli'nin OmpC ve OmpF porin sentezi için etkili olmadığı saptanmıştır. Fotooksidatif stres altında, antioksidant bir madde olan mannitolün koruyucu etkisinin olduğu görülmüş, ayrıca porin protein sentezi ile mannitol arasında bir ilişki belirlenmiştir.Anahtar kelimeler: Fotooksidatif stres, Göl suyu, Mannitol, Porin proteinleri.