IDH-mutant gliomada kromatin değiştiricilerin rollerini ortaya çıkarmak için fonksiyonel genetik taramalar

Gliomalar, merkezi sinir sistemi tümörleri arasında yer alan ve dört farklı sınıfa ayrılan bir grup tümördür. Özellikle en agresif tür olan dördüncü sınıf glioblastoma, önemli bir sağlık tehdidi oluşturur. Gliomalar içinde yer alan IDH-mutant gliomalar, tedavilere daha olumlu ve hassas bir yanıt gösterme eğilimindedir, bu da onları hedefe yönelik tedaviler için ilgi çekici kılar. Bu tez, özel olarak tasarlanmış bir CRISPR-Cas9 epigenetik kütüphane olan EPIKOL kullanarak IDH-mutant gliomaların hassasiyetine yol açan temel epigenetik düzenleyicilerin araştırılmasına odaklanmaktadır. Tezin ilk bölümünde, A172 glioma hücre hattından IDH-wildtype ve IDH-mutant hücreler üretilmiştir. Ardından, bu hücre hatları üzerinde EPIKOL kütüphanesi ile CRISPR-Cas9 aracılı tarama yapılarak IDH-wildtype ve IDH-mutant glioma hücrelerinin hayati öneme sahip temel epigenetik düzenleyicileri belirlenmiştir. Aday genler daha sonra hücre canlılığı ve koloni oluşturma kabiliyeti gibi işlevsel in vitro deneylerle doğrulanmıştır. Doğrulanan genler arasında, histon modifikasyonu ve gen ekspresyon düzenlemesi ile ilişkili komplekslerde rol alan RBBP7, IDH-mutant glioma hücreleri için potansiyel bir temel hedef olarak ortaya çıkmıştır. Bu çalışmadan elde edilen bulgular, ileri deneyler ve analizlerle IDH-mutant gliomalar için yeni terapötik hedeflerin belirlenmesine temel oluşturacaktır. Moleküler mekanizmalar hakkında daha derinlemesine bilgi edinmek için RBBP7'nin transkriptomik etkileşimleri RNA-seq analizi ile incelenecektir. Temel epigenetik düzenleyicilerin araştırılması, bu zorlu beyin tümörüyle mücadelede hedefe yönelik tedavilere yönelik umut vaat eden yollar sunmaktadır.