Gastrik karsinomlarda ARID1A mutasyonlarının PI3K sinyal iletim yolağıyla ilişkilerinin araştırılması

Mide karsinomu, yüksek mortalite oranları ve heterojen moleküler yapısı nedeniyle tedavisi zorlu kanser türlerinden biridir. Tümör baskılayıcı bir gen olan ve SWI/SNF kromatin yeniden düzenleme kompleksinin bir alt birimini kodlayan ARID1A, mide kanserlerinde sıklıkla mutasyona uğramaktadır. Bu çalışmanın amacı, mide karsinomu hastalarında ARID1A gen ekspresyonu ve mutasyon durumunu belirlemek; bu değişimlerin PI3K/AKT/mTOR sinyal yolağı bileşenleri (PI3KA, PI3KB, PTEN, AKT1, mTOR, PDK1, TSC1, FOXO1) ve immün kontrol noktası PD-L1 ile olan ilişkisini ortaya koymaktır. Çalışmaya 28 adet mide karsinomu dokusu ve 9 adet tümör dışı kontrol dokusu dahil edilmiştir. Gen ekspresyon seviyeleri kantitatif Gerçek Zamanlı PZR (qRT-PZR) yöntemiyle, ARID1A genotip analizi ise TaqMan Genotipleme yöntemiyle gerçekleştirilmiştir. Veriler 2−ΔΔCt yöntemiyle analiz edilmiştir. Bulgularımız, mide karsinomu dokularında kontrol grubuna kıyasla ARID1A ve PTEN mRNA seviyelerinde belirgin bir azalma olduğunu (p<0,05), buna karşın PI3KA ve PDK1 ekspresyonlarının arttığını göstermiştir. Genotip analizi, ARID1A varyant allelini taşıyan tümörlerin, yabanıl tipe göre anlamlı derecede daha düşük ARID1A mRNA ifadesine sahip olduğunu ortaya koymuştur. Ayrıca, ARID1A düşüklüğü ile PD-L1 yüksekliği ve EZH2 artışı arasında güçlü bir korelasyon saptanmıştır. Sonuç olarak, ARID1A kaybı; PI3K/AKT yolağının hiperaktivasyonu ve immün kaçış mekanizmalarıyla ilişkilendirilmiş olup, bu moleküler imzanın mide karsinomunda prognostik bir biyobelirteç ve terapötik bir hedef olabileceği öngörülmektedir.