Genç kan plazma uygulamasının orta yaşlı ratlarda disbiyozis ve patojen yanıtta rol alan bağırsak dokusu gen ekspresyonu üzerindeki etkisi

Yaşlanmayla birlikte bağırsak mikrobiyotasında disbiyozis meydana gelmektedir. Ayrıca bağırsak dokusundaki deformasyonlar bağırsak epitel hücreleri tarafından patojen yanıtta rol alan genlerin ekspresyonunun azalmasına neden olmaktadır. Bu durum ise bağırsak geçirgenliği, enflamatuar bağırsak hastalıkları, doku ve organlarda kronik iltihaplanmanın meydana gelmesi gibi birçok rahatsızlıkla birlikte davranışsal ve bilişsel durumlar üzerinde de etki gösterebilmektedir. Dolayısıyla özellikle yaşlanmayla birlikte meydana gelen disbiyozu geri çevirebilecek ve patojen yanıtta rol alan genlerin ifadesinin düzenlenmesinde rol alabilecek farklı biyolojik yaklaşımlar oldukça önem kazanmaktadır. Genç kan plazma uygulamasının işaret edilen sorunların giderilmesinde alternatif bir tedavi yöntemi olarak kullanılabilme potansiyeline sahip olduğu görülmektedir. Bu doğrultuda gerçekleştirilen bu tez çalışmasının amacı genç plazma transferinin yaşlı bağırsak mikrobiyotası ve patojen yanıtta rol alan gen ifadelerinin düzenlenmesi üzerine olan etkilerinin araştırılmasıdır. Bu amaç doğrultusunda 5 haftalık genç erkek Wistar ratlardan alınan kan plazması 12 aylık erkek orta yaşlı Wistar ratlara 30 gün boyunca her bir hayvana 05ml aktarıldı. Plazma transferi sonrasında Kontrol ve deney grubunda bulunan ratlar feda edildi. Feda edilen ratlardan alınan çekuç içeriğine metagenom uygulanarak bağırsak mikrobiyotası profilleri belirlendi. Bağırsak ileum dokularına gerçekleştirilen RNAseq analizi sonrasında önemli derecede arttığı görülen E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, CD209 antigen-like protein C, complement component C7 ve collectin-12 gen ekspresyonlarının arttığı syndecan-1 genlerin artan ve azalan değerleri RT-qPCR yöntemi ile belirlendi. Ayrıntılı metagenom analizi sonrasında, alfa çeşitlilik indeksleri, plazma uygulanan raların mikrobiyotasında kontrol grubuna göre daha fazla bakteri zenginliği göstermiştir. Ek olarak, Firmicutes/Bacteroidetes oranı plazma grubu mikrobiyotasında önemli derecede azalmıştır, bu da genç plazmanın olası gençleştirme özelliklerini doğrulamaktadır. Ayrıca, plazma uygulanan sıçanlarda Bifidobacterium longum, Coprococcus catus ve Romboutsia ilealis türlerinde artmış sayımlar ölçülmüştür. RT-qPCR ile elde sonuçlar RNAseq verileri ile uyumlu şekilde E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, CD209 antigen-like protein C, complement component C7 ve collectin-12 gen ekspresyonlarının öneli derecede arttığını syndecan-1 gen ifadesinin ise azaldığını bulmuştur. Çalışma sonuçları genç plazma transferinin yaşlı bağırsak mikrobiyotasında meydana gelen disbiyozisi geriye doğru çevirilmesinde ve bağırsak dokusunda patojen yanıtta rol alan genlerin düzenlenmesinde önemli derecede rol alabildiğini göstermektedir.