Characterization of patient-derived colorectal cancer organoids

Hassas onkoloji, her hasta için ayrı ve etkili tedaviler bulmayı amaçlamaktadır. Hastadan türetilen tümör ksenogreftleri (PDTX'ler) gibi klinik öncesi modeller, tedavi yanıtlarını tahmin etme konusunda birçok teknik sorun sunmaktadır. Hasta kaynaklı organoidler (PDO'lar) ise kişiselleştirilmiş tıp için umut vaat etmektedir. PDO'lar, bireysel kanser hastalarından elde edilebilen ve orijinal tümörün morfolojik ve genetik özelliklerini 3D kültür sistemleri arasında özetleyebilen yapılardır. Bununla birlikte, standartlaştırılmamış ve kötü tanımlanmış kültür prosedürleri, kanser organoid araştırmalarında eksikliktir. Bu çalışma, kurum içi bir protokol kullanarak kolorektal kanser hastalarının organoidlerini oluşturmayı ve orijinal dokuya histolojik ve genetik benzerlikleri göstermeyi amaçlamaktadır. Hasta onamı alındıktan sonra, 18 yaş üstü kolorektal kanser hastalarından (n=17) taze doku rezeksiyonu örnekleri (tümör ve kanserli olmayan komşu örnekler) alınmıştır. Dokuların mekanik ve kimyasal parçalanmasından sonra, hücreler sayılarak matrigel içine gömülmüştür. Sonuç olarak, tümör biyopsilerinden ve sağlıklı dokulardan %90'ın üzerinde başarılı oranlarda organoidler üretebildik. Bağımsız bir patoloji danışmanına göre, organoidler orijinal tümör örneklerinde olduğu gibi kribriform yapı gibi CRC özelliklerine sahipti. Son olarak, biyoinformatik analiz, hasta ve eşleşen hastalık modelinin, özellikle tümörün iyi tanınan mutasyona uğramış genleriyle ilgili mutasyonlar için benzer somatik mutasyon profillerini paylaştığını göstermiştir. Bu nedenle, kurum içi optimizasyonlarımız bize PDO kurulumu için sağlam ve verimli bir protokol sunmuş ve bunları kişiselleştirilmiş tedavi yaklaşımlarında bir araç olarak uygun bir şekilde kullanmayı mümkün kılmıştır.