COVID-19 hastalarının plasmalarında bulunan protein değişiminin incelenmesi

SARS-CoV2 enfeksiyonu, 2019 yılından bu yana halk sağlığı için küresel bir tehdit oluşturuyor. Hastalığın mekanizmalarının ve patofizyolojisinin nasıl olduğu ve ne tür tedavi stratejileri önerebileceğimiz hala net değil. Derinlemesine kütle spektrometrisi tabanlı proteomik analizden faydalananılarak, bu çalışmada COVID-19 hastaları ve enfekte olmayan bireylerin karşılaştırılmasından sonra tanımlanan toplam 1147 plasma proteinlerinden 111'inin istatistiksel olarak önemli ölçüde değişim gösterdiğini bulduk. Ayrıca, hastaların protein profillerine göre nasıl kümelendiklerini kontrol ettik ve kritik hastaların plazma proteom örneklerinin, ciddi ve orta dereceli olanlardan farklı bir küme olarak kendi içinde gruplandırıldığı sonucuna vardık. Şaşırtıcı bir şekilde, kritik spesifik kümede olup yukarı yönde ifade edilen proteinler, nötrofil degranülasyonu (HP, SERPINA1, SERPINA3, CST3, PKM, FCGR3B, S100A9, VNNN1) ve amiloid oluşumu (SAA1, SAA2, FGA, H2BC21) mekanizmalarında rol oynuyorken, kritik spesifik kümede olup aşağı yönde ifade edilen genler, çoğunlukla hemostaz ve lipid metabolizmasında rol oynuyor. COVID-19'un farklı fazları (erken, inflamatuar ve iyileşme) ve hastalık şiddeti dereceleri göz önüne alındığında, CLEC3B, MST1 ve ITIH2 proteinleri, COVID-19 hastalığının şiddetini erken tahmininde kullanılabilecek prognostik biyobelirteçler olarak önerilmektedir. Son olarak, yalnızca istatistiksel olarak değişim gösteren proteinleri alarak COVID-19 hastalığı ile ilişkili bir plazma protein ağı oluşturduk. Ayrıca, plazma protein ağının viral proteinlere bağlılığını gösterip ORF8 ve NSP5 viral proteinler ile olan protein ağını gösterdik.