İzmir ili erik bahçelerinde fitoplazmaların PCR/RFLP analizleriyle tanılanması, karakterizasyonu ve olası vektörlerin belirlenmesi

Yapılan bu çalışmada İzmir ilinde erik ağaçlarındaki fitoplazmaların varlığı belirlenmiş, fitoplazma ile enfekteli erik bahçelerinden toplanan olası fitoplazma vektör böcekler morfolojik olarak teşhis edilmiş, böcek bünyesindeki fitoplazma varlığı moleküler yöntemlerle araştırılmıştır. Erik ağaçlarında görülen en yaygın simptomlar; yapraklarda kloroz ve içe doğru kıvrılma, yapraklarda küçülme, kırmızılaşma ve aşırı sürgün oluşumudur. Yapılan arazi çalışmaları sonucunda 9 farklı erik çeşidinden toplam 110 erik örneği ve yine bu bahçelerden Cicadellidae familyasına ait 30 adet Psammotettix provincialis olarak teşhis edilen böcek toplanmıştır. Nested-PCR analizleriyle testlenen erik örneklerinden 29 tanesinde fitoplazma saptanmış olup bunlardan 8 tanesinin PCR ürünleri RFLP analizleri yapılmak üzere RsaI ve SspI restrüksiyon endonükleaz enzimleri ile kesilmiş ve 4 tanesinin elma çoklu sürgün fitoplazması (Apple Proliferation, Candidatus Phytoplasma mali), diğer 4 tane erik örnekleri ise armut yıkım fitoplazması (Pear decline, Candidatus Phytoplasma pyri) ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Nested-PCR analizleri ile testlenen 30 adet P. provincialis bireyinden 16 tanesi fitoplazma ile enfekteli bulunmuş ve yapılan filogenetik analizlerde ise bu bireylerin Candidatus Phytoplasma asteris (16SrI) ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Fitoplazma pozitif bulunan 29 izolattan 22 tanesi sekans analizine gönderilmiş ve elde edilen diziler virtual RFLP analizine tabi tutularak 17 restriksiyon enzimiyle [AluI, BamHI, BfaI, BstUI (ThaI), DraI, EcoRI, HaeIII, HhaI, HinfI, HpaI, HpaII, KpnI, Sau3AI (MboI), MseI, RsaI, SspI ve TaqI] kesilmiş ve elde edilen bant profilleri referans izolatlarla karşılaştırılmıştır. Virtual RFLP analizleri sonucunda 11 izolatımız Ca. P. mali, 4 izolatımız Ca. P. prunorum, 3 izolatımız Ca. P. pyri, 2 izolatımız Ca. P. asteris ve diğer 2 izolatımız ise Ca. P. trifolii ile benzer enzim kesim profili vermiştir.