Japon bıldırcınlarında miyostatin (MSTN) gendeki polimorfizmlerin araştırılması

Miyostatin, kas gelişimi üzerinde negatif bir düzenleyici olarak görev yapmakta olup, kas büyümesinin kontrolü ve et kalitesi özelliklerinin belirlenmesinde kritik bir rol oynamaktadır. Özellikle mutasyona uğramış allellerin veya inaktif MSTN geninin varlığı, artan büyüme hızları ve üstün karkas özellikleri ile güçlü bir şekilde ilişkilidir. Bu çalışmada, Karaman sınırları içerisinde bulunan Yamtar Japon Bıldırcını Üretim Çiftliği'nde yetiştirilen üç farklı Japon bıldırcını hattı arasında canlı ağırlık farklılıkları gözlenmiştir. Gruplar arasındaki ağırlık farklılıklarını değerlendirmek amacıyla Tek Yönlü Varyans Analizi (ANOVA) uygulanmıştır. Analiz sonucunda gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı farklılıklar tespit edilmiştir (p<0.05). Bu farklılığın Miyostatin geninde meydana gelmiş olabilecek polimorfizmlerle ilişkili olabileceği düşünülmüş ve üç farklı seleksiyon geçmişine sahip hattın MSTN varyasyonlarının karşılaştırılması amaçlanmıştır. Bu kapsamda 3 gruptan seçilen toplam 72 adet Japon bıldırcınından (Coturnix coturnix japonica) pektoral kas örnekleri alınmıştır. Kas dokularından RNA izolasyonu yapılmıştır. İzole edilen RNA'lardan cDNA sentezi gerçekleştirilmiştir. Her hattın cDNA örnekleri, kendi içinde üçerli gruplar hâlinde birleştirilmesiyle pool örneklerine dönüştürülmüş ve çalışma kapsamında toplam 24 pool grup oluşturulmuştur. Ekzon bölgelerini kapsayan forward ve reverse primer dizileri arasında kalan 1932 bp uzunluğundaki alan Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile çoğaltılmıştır. Hazırlanan 24 grubun DNA dizi analizi Sanger metodu ile gerçekleştirilmiştir. Analiz sonucunda ekzon 2'de 7, ekzon 3'te 6 ve genin 3' UTR bölgesinde 7 olmak üzere toplam 20 adet tek nükleotid polimorfizmi (SNP) tanımlanmıştır. Tukey HSD Post-Hoc karşılaştırma analizi sonucunda da Grup C'nin (Yamtar 2), Grup A'ya (Ebeveyn) kıyasla önemli artış (p<0,05) gösterdiği belirlenmiştir. Çalışma sonuçları, tanımlanan SNP'lerin gruplar arasındaki önemli farklılıklarda rol oynayabileceğine işaret etmektedir. Elde edilen verilerin, Japon bıldırcınlarında yapılacak ağırlık artışıyla ilgili yapılacak seleksiyon çalışmalarına katkı sağlayabileceği düşünülmektedir. Anahtar Kelimeler: Japon Bıldırcını, Miyostatin, Polimorfizm, Seleksiyon, Canlı Ağırlık