Karboksidotrofik mikroorganizmaların izolasyonu, tanımlanması ve kullanılabilirliği

Karboksidotrofik bakteriler, toksik CO gazını tolere edip bu gazda gelişebilme yeteneklerinden dolayı biyoteknolojik süreçlerde birçok fırsat sunmaktadırlar. Karboksidotroflar CO dehidrogenaz (CODH) enzimi aracılığıyla CO'nun oksidasyonunu gerçekleştirerek daha az zararlı bileşiklere dönüşmesini sağlamaktadır. Bu özellikleriyle CO okside eden bakteriler, çevresel iyileştirmeler, biyoenerji üretimi ve endüstriyel uygulamalar gibi birçok alanda potansiyel bir kaynak olarak değerlendirilebilmektedir. Bu çalışmada, karboksidotrofik bakteri izolasyonu amacıyla asid maden derenajından alınmış su örneklerinden ekim yapılmış ve izolasyon sonucunda Bacillus subtilis ve Bacillus sp. tanımlanmış, karboksidotrofik bakteri izolasyonu yapılamamıştır. İzolasyon sonrasında DNA sekansında aerobik karbonmonoksit dehidrogenaz (CODH) enziminin sentezini kodlayan DNA dizileri görülen Pseudomonas aeruginosa'da bu gen bölgesinin amplifiye edilmesi amaçlanmıştır. Pseudomonas aeruginosa B136-33 ve Pseudomonas aeruginosa ATCC-27583 suşunun genomları incelenerek çoğaltılması hedeflenen gen bölgeleri belirlenmiştir. Primer tasarımı ve PCR ile amplifikasyon işlemleri tamamlanmıştır. Gerçekleştirilen deneyler sonucunda laboratuvarda bulunan Pseudomonas aeruginosa'nın aerobik karboksidotrof mikroorganizmalarda bulunan CO dehidrogenaz dizisine sahip olmadığı söylenebilmektedir. İleri çalışmalarda farklı marker genler seçilerek hedeflenen çalışma için kullanılabileceği düşünülmektedir.