Ksilan polisakkaritinin bitki hücre çeperindeki lokalizasyonunun mikroskop teknikleri kullanılarak incelenmesi

Lignoselülozik biyokütle, dünya üzerinde en bol miktarda bulunan yenilenebilir organik maddeyi oluşturmaktadır. Bitkilerin hücre duvarlarını oluşturan lignoselüloz, temel olarak üç bileşikten oluşmaktadır. Bunlar; selüloz, hemiselüloz ve lignindir. Ksilozun polimeri olan ksilan, odunsu bitkilerde hemiselülozu oluşturan başlıca bileşenidir. Hemiselüloz; selüloz ve lignin ile bağ yaparak hücre duvarının yapısını oluştururlar. Sert odun bitkilerinde hemiselülozun içeriğinde daha çok ksilan olduğu bilinmektedir. Ksilan, çoğunlukla ikincil hücre duvarının yapısına katılmaktadır. İkinci en bol biyokütle kaynağı olan ksilanın yapısı ve lokalizasyonu üzerine çalışmalar önem taşımaktadır. Bu çalışmada ksilan polisakkaritinin bitki hücre çeperindeki lokalizasyonunu incelemek için model bitki Arabidopsis thaliana kullanılmıştır. Besiyerine ekilip büyütülen 3 ve 6 haftalık A. thaliana bitkilerinin gövdelerinden alınan örneklere doku takibi işlemleri uygulanıp örneklerden ultramikrotom ile kesitler alınmıştır. Sonrasında, immünohistokimya yöntemiyle hücre duvarına özgün monoklonal antikorlar kullanılarak etiketleme yapılmıştır. LM10, LM11, CCRC-M144, CCRC-M148, CCRC-M150 ve CCRC-M154 monoklonal antikorları ksilan polisakkariti üzerinde farklı yapılar tanıdığı için tercih edilmiştir. Son olarak antikorların floresan mikroskobuyla lokalizasyon görüntüleri belirlenmiştir. Kullanılan antikorların lokalizasyonu ksilem ve interfasiküler hücre çeperlerinde incelendiğinde farklı bağlanma motifleri görülmüştür. Yine, bazı antikorların lokalizasyonu bitki gelişimine bağlı olarak 3 ve 6 haftalık bitki örneklerinde farklılık göstermiştir. Böylelikle ksilan polisakkaritinin Arabidopsis thaliana bitki hücre çeperindeki yapısal farklılıkları ortaya konulmuştur.