Investigation of the use of miRNA223 as a biomarker in glioma tumors

Bu tez çalışmasının amacı, miRNA223'ün glioma tümörlerinde biyobelirteç olarak kullanımının araştırılmasıdır. Yapılan çalışmalarda Glioma tümörlerinde, farklı mikroRNA'ların genetik analizi değerlendirilmiştir. miRNA223 ise farklı kanser türlerinde incelenmiştir. Bu çalışma, Türk popülasyonundaki glioma hastalarında miRNA223'ün ekspresyon düzeyini araştıran literatürdeki ilk çalışmadır. Bu çalışma, miRNA223'ün glioma tümörlerinde ekspresyon analizinde olası biyobelirteçlerin rolünü göstermektedir. Bu tez çalışmasında kullanılan kan örnekleri, Yeditepe Üniversitesi Moleküler Tıp Laboratuvarında bulunan ve daha önceden alınmış mevcut örneklerden oluştu. Çalışma öncesinde Yeditepe Üniversitesi Girişimsel Olmayan Klinik Araştırmalar Etik Kurulu onayı alındı. Bu çalışmada kullanılan hasta kan örnekleri laboratuvar dondurucusunda bulunan ve Yeditepe Üniversitesi Hastanesi'ne glia tümörü ile başvuran 35 hastadan alınan kan örneklerinden oluştu. 30 sağlıklı kişiden alınan kan örnekleri ise kontrol grubu olarak kullanıldı. Tümörün lokasyonuna bağlı olarak hasta serumlarından 3 farklı serum havuzu oluşturuldu. Kontrol grubundan da serum havuzu oluşturuldu. miRNA izolasyonunu sağlamak amacıyla Qiagen'in miRNeasy Serum/Plazma Kiti kullanıldı (Cat. No. / ID: 217184). Mikro RNA'lar ise miRCURY LNA RT Kit (Cat. No./ID:339340) kullanılarak cDNA ya konvansiyonel PCR yaparak dönüştürülür. cDNA seviyelerini ölçmek için florometre kullandı. Örneklerin dilüsyonları yapıldı. miRNA ekspresyon seviyelerini saptamak için miRCURY LNA SYBR Green PCR Kit (Cat. No. / ID: 339346) kullanılarak Rotor Gene' de (Rotor-Gene Q –Qiagen) PCR yöntemi ile ekspresyon analizi yapıldı. miRNA223 ekspresyon seviyelerini saptamak için Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR) cihazı kullanıldı. İstatistiksel analizler için SPSS paket programı (SPSS Inc, Chicago, IL, USA) sürüm 23.0 kullanıldı. ROC analizi yapıldı. İstatistiksel olarak anlamlı sonuçlar için p değeri 0,05 olarak ayarlandı.