Assessment of the error involved in the PCR tests

PCR testleri, COVID-19 hastalığının tanı ve teşhisinde altın standart olarak kabul edilen tanı yöntemidir. Dünya genelinde bu testlerin yapılmasında kullanılan hedeflenen gen bölgeleri ve kit içeriği gibi farklılıklar gösteren birçok farklı kit bulunmaktadır PCR test sonuçlarının doğruluğunu etkileyen birçok faktör vardır. Genelde bunların bir kısmı şüpheli hastadan, laboratuvar ortamından, uzmandan veya kullanılan tanı kitinden kaynaklanabilir. Bu faktörler yanlış pozitif ve yanlış negatif sonuçların ortaya çıkmasına neden olur. Bu çalışmada SARS-COV-2 tanısında kullanılan polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemi ile ilgili otuz bir makaleden elde edilen veriler kullanılmıştır. Toplamda yaklaşık 188,201 hastalık testi verisi elde edildi. Bu testlerden 1472'si uyumsuz test sonuçları olarak tanımlandı (yanlış pozitif/yanlış negatif). Bu sonuçlardan 1025'i yanlış negatif, 4472'si yanlış pozitif olarak kabul edildi. Bu verilere göre hesaplanan yaklaşık yalancı pozitiflik oranı (FPR) %0.56, yalancı negatif oranı (FNR) ise %0.95'tir. Bu çalışma genel bir sonuç elde etmek için yaklaşık veriler üzerinde hesaplamalar ve araştırmalar yapılarak gerçekleştirilmiştir. Araştırma sonucunda yanlış pozitif sonuçların pipetleme hatalarından, kontaminasyondan ve yanlış negatif sonuçların hastalığın erken evrelerinde uygunsuz örnekleme ve örneklemeden kaynaklandığı düşünülmektedir.