Pistacia lentiscus ve Pistacia terebinthus türlerinde yeni nesil sekanslama yöntemi kullanılarak cinsiyet ile bağlantılı DNA markörlerinin geliştirilmesi ve cinsiyet kromozom mekanizmasının ortaya çıkarılması

Bu çalışmada, Pistacia lentiscus ve Pistacia terebinthus türlerinde 15 dişi ve 15 erkek genotipe ait tüm genom tekrar-sekanslama Dna verilerini kullanılması ile cinsiyete özgü bölge veya bölgelerin belirlenmesi, cinsiyetle ilişkili olduğu belirlenen bölgelerin anotasyonu ve dişi ve erkek bireyleri %100 doğrulukla ayırabilen, P. lentiscus ve P. terebinthus türlerinin ıslahında kullanılabilecek markörlerin tasarlanması amaçlanmıştır. P. lentiscus türünde tüm dişi ve erkek bireylerde Siirt genomu kullanıldığında aynı pozisyonda bulunan ve cinsiyetle ilişkili olduğu bulunan 1310 adet SNP bulunmuştur. Bu bölgelerden dizayn edilen CAPS markörü ile agaroz jel yöntemiyle dişi ve erkek bireyleri baz farklılıklarına göre ayrılmıştır. Dişi bireylerde üç bant (≈550 bp, ≈ 410 bp ve ≈ 140 bp), erkek bireylerde ise tek bant (≈550 bp) tespit edilmiştir. P. terebinthus'a ait 15 dişi ve 15 erkek bireylerine ait Dna sekanları P. atlantica genomu hizalandığında P. atlantica genomunun 14.2 kromozomu üzerinde 65 dişi spesifik lokus tespit edilmiştir. Bu lokuslardan tasarlanan SCAR markörü sadece dişi genotiplerde 800 bp bant verirken, erkek genotiplerde ise bant vermemiştir. Bu çalışma ile P. terebinthus ve P. lentiscus türlerinde dişi genotiplere spesifik cinsiyetle ilişkili lokus olması, erkek bireylerde olmaması bu iki türün de dişi bireylerinde ZW, erkek bireylerin ise ZZ sistemine sahip olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışma ile markör destekli ıslah çalışmalarında bu iki türde de dişi ve erkek bireyleri %100 ayırabilen bu markörler kullanılabilecektir.