Ramoplanin antibiyotiğinin derin kültür fermentasyonu ile üretimi

Ramoplanin hücre duvarına etki eden bir lipoglikodepsipeptit antibiyotik olup birçok klinik öneme sahip çoklu-ilaç direnci gösteren bakteriye karşı yüksek bakterisidal aktivite sergilemektedir. Amerikan Gıda ve İlaç Dairesi tarafından hızlandırılmış ilaçlar kategorisine alınmış olan ramoplaninin önümüzdeki yıllarda piyasaya sürülmesi beklenmektedir. Ancak, düşük üretim verimi nedeniyle maliyetinin yüksek olması büyük bir engel teşkil etmektedir. Bu nedenle bu antibiyotiğin yüksek verimlilikte üretimi için fermentasyon koşullarının optimize edilmesi gerekmektedir. Bu doğrultuda gerçekleştirilen tez kapsamında, soya küspesi, et-kemik unu, tavuk unu ve balık unu gibi çeşitli endüstriyel yan ürün azot kaynaklarının yanı sıra demir, potasyum, magnezyum, mangan ve çinko iz metallerinin farklı derişimlerinin inkübasyon süresine bağlı olarak ramoplanin A2 üretimine etkisi incelenmiştir. Ramoplanin A2 miktarları HPLC ile belirlenmiştir. En yüksek ramoplanin A2 üretimi, azot kaynakları içeren besi ortamlarından balık unu ortamında yedinci günde 406.805 mg/L olarak belirlenmiştir, ancak toplamda en yüksek ramoplanin A2 üretimi aynı zamanda daha düşük fiyatlı olan tavuk unu ortamında tespit edilmiştir. İz metal içeren besi ortamları arasında en yüksek ramoplanin A2 üretimi 75 ppm çinko iyonu içeren besi ortamında yedinci günde 647.415 mg/L olarak belirlenmiştir. Ayrıca, antibiyotik biyosentezini etkileyen önemli parametreler de incelenmiştir. Total protein seviyeleri, total indirgen şeker seviyeleri, proteaz, amilaz ve lipaz aktiviteleri spektrofotometrik olarak belirlenirken, hücre içi serbest amino asit seviyeleri ise HPLC ile belirlenmiştir. Sonuçlarımıza göre, ramoplanin A2 üretiminin genellikle artan pH seviyeleri, karbon kaynaklarının sınırlılığı ve ramoplanin öncülleri olan L-Leu, L-Thr, Gly L-Phe, D-Ser ve D-Orn amino asitlerinin biyobulunurluğu ile artış gösterdiği belirlenmiştir.