Prostaglandin D2 reseptör antagonist türevlerinin QSAR çalışması

Bu çalışmada, Toda ve ark. Tarafından sentezlenmiş 80 tane indol türevinin QSAR (Kantitatif Yapı Aktivite İlişkisi) analizi yapılmıştır. Bu prostaglandin D2 (PGD2) reseptör antagonistleri, PGD2 reseptörüne kuvvetlice bağlanır ve halkalı adenozin 3', 5'-monofosfat (cAMP) oluşumunu in vitro bloke eder. Oral olarak alındığında bu bileşikler vasküler geçirgenliği arttırarak alerjik inflamatuar etkileri büyük ölçüde baskılayabilirler.Bütün veri seti, uygulama seti (70 bileşik) ve test set (10 bileşik) olarak rastgele bir şekilde ikiye ayrılmıştır. En uygun moleküler diskriptörleri seçmek amacıyla CODESSA 2.7.2 programındaki Heuristic ve Best Multi Linear Regression (BMLR) metotları kullanılmış ve doğrusal QSAR modelleri oluşturulmuştur.Heuristic metot ile elde edilen beş parametreli model denklemin uygulama seti ve test set için çapraz validasyon korelasyon katsayısının karesi (R2CV) değerleri sırasıyla 0.7130 ve 0.6684' tür. Bununla birlikte BMLR metoduyla elde edilen beş parametreli model denklemin uygulama seti ve test set için korelasyon (R2) değerleri sırasıyla 0.7195 ve 0.7227' dir. QSAR analizlerine göre bileşiklerin reseptöre bağlanmasında en önemli faktörler N atomu üzerindeki bağıl negatif yük ve minimum net atomik yüktür. Ayrıca bileşiklerin inhibisyon aktivitesi H-Bağı Yüzey Alanı ile artmaktadır.