Saccharomyces cerevisiae'nin hücre döngüsü ağının gen regulasyon dinamiği
2009
0 views
0 downloads
Advisor: Yrd. Doç. Dr. Alkan Kabakçıoğlu ; Yrd. Doç. Dr. Deniz Yuret
Abstract (EN)
In this thesis, the genetic regulatory dynamics within the cell cycle network of the yeast Saccharomyces cerevisiae is examined. As the mathematical approach, an asynchronously updated Boolean network is used to model the time evolution of the expression level of genes taking part in the regulation of the cell-cycle. The attractors of the model's dynamics and their stability are investigated by means of a stochastic transition matrix. It is shown that the cell cycle network has unusual dynamical properties when compared with similar random networks. Furthermore, an entropy measure is employed to monitor the sequential evolution of the system. It is observed that the experimentally identi¯ed cell cycle phases G1, S, G2 and M correspond to the stages of the network where the entropy goes through a local extremum.
Author
Dr. Neşe Aral
How to Cite
Neşe Aral (Master Thesis). Saccharomyces cerevisiae'nin hücre döngüsü ağının gen regulasyon dinamiği, 2009, Koç University, Fizik Bölümü.
Keywords
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Koç University
- Ekom-Eczacıbaşı'nın Rusya piyasasındaki pazarlama stratejileri(1995)
- Barok döneminde Balkanlar Osmanlı Avrupası'nda mimaride, dekorasyonda, himaye ve kültürel üretim modellerinde dönüşüm, 1718-1856(2006)
- Erteleme kısıtlı tek makine çizelgeleme(2014)
- Sarayda Osmanlı tütsüleme gelenekleri: Topkapı Sarayı buhurdanları(2015)
- Selçuk Rumları ve Gürcistan Krallığının Birbirlerine olan benzerlikleri: 13. Yüzyılda sanatsal değişim çerçevesi(2015)
- Obje tabanlı akıl danışma-tavsiye iletişimi tasarımına ilham kaynağı olarak Türk kahve falı(2017)
