Dynamics of gene regulatory cell cycle network in Saccharomyces cerevisiae
2009
0 views
0 downloads
Advisor: Yrd. Doç. Dr. Alkan Kabakçıoğlu ; Yrd. Doç. Dr. Deniz Yuret
Abstract (TR)
Bu tezde Saccharomyces cerevisiae hücresinin, hücre döngüsü içindeki gen regülasyon dinamiği incelendi. Hücre döngüsünü kontrol eden genlerin zaman içindeki ekspresyon değerlerini bulmak için matematiksel yöntem olarak asenkron biçimde güncellenen Bool tipi ağlar kullanıldı. Dinamiğin çekicileri ve bunların kararlılığı stokastik transfer matrisi kullanılarak incelendi. Rastgele ağlar ile karşılaştırıldığında hücre döngüsü ağının değişik dinamik özellikler sergilediği gösterildi. Sistemin sırayla geçtiği durumları gözlemlemek için bir entropi ölçüsü tanımlandı. Deneylerde görülen G1, S, G2 ve M fazlarının, ağın entropisinin yerel ekstremum noktalarına karşılık geldiği gözlendi.
Author
Dr. Neşe Aral
How to Cite
Neşe Aral (Yüksek Lisans Tezi). Dynamics of gene regulatory cell cycle network in Saccharomyces cerevisiae, 2009, Koç University, Fizik Bölümü.
Keywords
License
Tüm Hakları Saklıdır
This work is shared under the specified license terms.
More theses from Koç University
- International marketing strategies of Ekom-Eczacıbaşı in the Russian market(1995)
- The Balkans in an Age of Baroque transformations in architecture, decoration, and patterns of patronage ad cultural production in Ottoman Europe, 1718-1856(2006)
- Single machine scheduling with timelag constraints(2014)
- Ottoman olfactory traditions in a palatial space: Incense burners in The Topkapi Palace(2015)
- The connectedness of the Rum Seljuks and the Kingdom of Georgia: A framework for artistic exchance in the thirteenth century(2015)
- Turkish coffee fortune-telling ritual as a source of inspiration for designing object-mediated advice interactions(2017)