Dynamics of gene regulatory cell cycle network in Saccharomyces cerevisiae

Bu tezde Saccharomyces cerevisiae hücresinin, hücre döngüsü içindeki gen regülasyon dinamiği incelendi. Hücre döngüsünü kontrol eden genlerin zaman içindeki ekspresyon değerlerini bulmak için matematiksel yöntem olarak asenkron biçimde güncellenen Bool tipi ağlar kullanıldı. Dinamiğin çekicileri ve bunların kararlılığı stokastik transfer matrisi kullanılarak incelendi. Rastgele ağlar ile karşılaştırıldığında hücre döngüsü ağının değişik dinamik özellikler sergilediği gösterildi. Sistemin sırayla geçtiği durumları gözlemlemek için bir entropi ölçüsü tanımlandı. Deneylerde görülen G1, S, G2 ve M fazlarının, ağın entropisinin yerel ekstremum noktalarına karşılık geldiği gözlendi.