Türkiye endemiği Thermopsıs turcica'dan APETALA1 ve APETALA2 genlerinin klonlanması ve karakterizasyonu

MADS kutulu APETALA1 (AP1) ve iki AP2 kutulu APETALA2 (AP2) transkripsiyon faktörleri bitki çiçeklenmesinde sepal gelişiminden sorumlu A-fonksiyonlu genlerdir. Bu araştırmada, çok-karpelli Thermopsis turcica genç tomurcuklarından Arabidopsis AP1 ve AP2 homologları izole edilmiş ve farklı dokularda ifadesel analizleri yapılmıştır. Dejenere primerler ile klonlanan gen parçalarının tam uzunluk cDNA'ları cDNA uçlarının hızlı çoğaltımı (RACE) ile belirlenmiştir. 1074 bp tam uzunluk TtAP1 cDNA'sı 714 bp protein kod bölgesine sahiptir. MADS-I-K-C domenleri belirlenmiş TtAP1 proteini 238 amino asit uzunluğundadır. Hizalama ve filogenetik analizler TtAP1'in diğer legüm türlerinde belirlenen homologlarına benzer olduğunu ispatlamıştır. TtAP2 cDNA'sı 545 amino asit için 1638 bp protein kodlama bölgesine sahiptir. TtAP2 proteini 70 amino asitlik korunmuş bölgede iki AP2 domenine sahiptir. Proteinin diğer kısımları çok değişken ve korunmamıştır. Çiçek tomurcukları ve yarı açılmış çiçeklerin sepal, petal, stamen ve karpel dokularında TtAP1 ve TtAP2 göreceli ifadesi gerçek zamanlı nicel PCR analizi ile belirlenmiştir. Bu genlerin göreceli gen ifadesi belirgin bir şekilde sepal dokusunda fazla bulunmuştur. TtAP1'nin göreceli gen ifadesi sepal > tomurcuk > petal > karpel > stamen dokuları şeklinde belirlenmişken, TtAP2'nin göreceli gen ifadesi sepal > karpel > tomurcuk > petal > stamen şeklinde belirlenmiştir.