Farklı hücre hatlarında doğal antisenstranskriptlerin ifade seviyelerinin belirlenmesi

(lncRNA) Uzun kodlanmayan RNA'ların en önemli fonksiyonel özelliği RNA susturulması ve mRNA'nın kontrol ve düzenlenmesidir. LncRNA'lar kanserin bir çok safhasında düzenleyici rol oynar.. Antisens lncRNA'lar bir gen boyunca veya genin bir kısmını içerecek şekilde genin tersi yönünde aktivite göstererek o geni düzenler. Çalışmamızda kullanacağımız TSIX antisens lncRNA'sı XIST genine bağlanarak ifadesini düzenlenmektedir bunada lncNAT denilmekte . TSIX yeni bir regülatör molekuludur özelikle kolejen ekspresyon seviyesinin düzenlenmektedir . HAGLR, farklı kanser türlerinde kanserojenez ve metastaz için kritik bir düzenleyicidir. LCMT1, Akt proto-onkogen'in negatif regülatörüdür. böylelikle sonraki çalışmalarla desteklendiği taktirde kanserdeki rolünü anlamamıza yardımcı olacaktır. Çalışmamızda kullanacağımız antisensler; HAGLR, LMCT1, ve NAV2AS5 için henüz yeterli çalışma yapılmamıştır. Ancak literatürdeki bazı veriler kanser gelişimi ile ilişkili olabileceklerini göstermektedir. Bu nedenle çalışmamız sonucunda bu dört antisensin çeşitli kanser ve normal hücre hatında (Beas2B, CRL4010, CRL8798) and kanser (A549, MCF7, MDA-MB-231, CRL2329) hücre hatında ifade seviyelerinin belirlenmesi. İlk aşamada TSIX, HAGLR, LMCT1AS, ve NAV2AS antisens transkriptleri için primer dizaynı yapıldı. Hücre kültürü yöntemi kullanılarak çeşitli kanser ve normal hücre hatları kültüre edildikten sonra RNA izolasyonu yapıldı . İzolasyon sonrası elde edilen RNA'lar normal -PCR metodu ile cDNA'ya çevirilecektir. cDNA'lar kullanılarak tasarlanan primerlerle RT-PCR yapılarak, jel elektroforezinde yürütülerek antisens transkriptlerin çeşitli kanserli ve normal hücrelerdeki ifade seviyeleri nitel olarak belirlendi. Anahtar kelime: Kanser, HAGLR, LCMT1AS, NAV2AS5, Doğal Antisense RNA'ları.