Tokat ili bağ alanlarında grapevine pinot gris virus, grapevine a virus ve strawberry latent rıngspot vırus etmenlerinin varlığının moleküler olarak belirlenmesi

2019 yılında Tokat ilinde yapılan bu çalışmada, bağcılığın yoğun olarak yapıldığı Merkez, Erbaa, Niksar, Pazar ve Zile ilçelerindeki bazı bağ alanlarından asmaların virüs belirtisi gösteren genç yapraklarından ve bir yaşlı sürgünlerinden örnekler toplanmıştır. Toplanan 189 adet asma örneği Grapevine pinot gris virus (GPGV), Grapevine A virus (GVA), Strawberry latent ringspot (SLRSV) virüslerinin varlığını tespit etmek amacıyla, virüslere spesifik primerler kullanılarak moleküler bir yöntem olan RT-PCR testine tabi tutulmuştur. Test edilen 189 adet örneğin 2 (%1.05) tanesinde birden fazla virüse rastlanmıştır. Toplam 189 bitki örneğinin 80'i GVA (%42.32), 3'ü GPGV (%1.58) tespit edilmiş ve SLRSV ise (%0) saptanmamıştır. Tokat Merkez ve ilçelerinden toplanan bitki örneklerinde en yaygın görülen virüsün GVA olduğu saptanmıştır. En az saptanan virüsler ise GPGV ve SLRSV olarak tespit edilmiştir. GVA enfekteli izolatların çift yönlü sekans analizleri yapılmış ve MEGA10 bilgisayar programında hizalanmış ve gen bankasına kayıtlı izolatlarla karşılaştırması yapılarak filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Filogenetik analiz çalışmalarına göre, GVA gen bankasında kayıtlı farklı izolatlarla ve kendi içinde de farklı dallanmalar göstermiştir. GVA ile enfekteli izolatlar kayıtlı diğer izolatlarla %92-94 oranlarında benzerlik göstermiştir.