Asma' da (Vitis vinifera L.) aquaporin genlerinin biyoinformatik analizi ve farklı dokularda ifade profillerinin belirlenmesi

Aquaporinler insan, bitki, hayvan ve bakterilerde bulunan suyun zardan geçişini sağlayan kanal görevi yapan membran proteinleridir. Bitkilerde aquaporin ailesinin su dengesinin ayarlanması, fotosentez gibi hücresel ve fizyololojik olaylarda görev aldığı görülmüştür. Asma (Vitis vinifera L.) şarap ve gıda sektörü açısından ekonomik olarak oldukça önemli çok yıllık bir türdür. Çalışmada Vitis vinifera L. aquaporinleri biyoinformatik olarak belirlenmiştir. Vitis vinifera L. Aquaporin ailesine ait 19 adet genin sultani çekirdeksiz çeşidinde farklı tane gelişim dönemlerinde, yaprak, sülük ve genç sürgünlerde Real-time PCR tekniği ile ifade profilleri çıkarılmıştır. Tanede incelenen tüm aquaporin genlerinin ifadeleri olgunlaşma döneminde azalmıştır. mRNA ifade analiz sonuçları aquaporinlerin gelişim dönemlerinde yer aldıkları fizyolojik olayların belirlenmesi açısından bir bilgi sağlamıştır. Biyoinformatik analizlerle aquaporin genlerine ait EST verilerine ulaşılmıştır. Bu şekilde Vitis vinifera L. aquaporin genlerinin farklı üzüm çeşidlerine ait birçok doku ve organlarda ifade oldukları gösterilmiştir. Vitis Vinifera L. Aquaporin ailesine ait 20 birey ile diğer bazı bitkilerde bulunan aquaporinler arasında oluşturulan filogenetik ağaç ile akrabalık ilişkisi gösterilmiştir.