Ceviz (juglans regia l.) için mikrosatellit (ssr)primerlerin geliştirilmesi

Bu çalışmada daha önceki bir çalışmada J. nigra DNA'sı kullanılarak oluşturulan ve 'GA' ile 'AC' tekrar dizileri ile zenginleştirilen genomik kütüphanelerden dizayn edilen SSR primer çiftlerinin J. regia'da amplifikasyon ve polimorfizm bakımından test edilmesi amaçlanmıştır. Toplam olarak 'GA' ile zenginleştirilmiş kütüphanaden 99 adet SSR primer çifti test edilirken, 'AC' ile zenginleştirilmiş kütüphaneden ise 241 primer çifti test edilmiştir. 'GA' ile zenginleştirilmiş kütüphaneden geliştirilen SSR primer çiftlerinden 47 (%47.5) tanesi bant üretmiş ve 19 tanesi (%19.2) polimorfizm gösterirken, 'AC' ile zenginleştirilmiş genomik kütüphaneden geliştirilen SSR primer çiftlerinden 44 tanesi (%18.3) gradient PCR sonucu bant vermiş ve bunlardan 13 tanesi (%5.4) polimorfik bulunmuştur. 'GA' kütüphanesindeki 19 polimorfik SSR primerden 90 adet allel elde edilmiş ve bunların 66 tanesi (%73.4) polimorfizm gösterirken, 'AC' kütüphanesindeki 13 adet polimorfik SSR primer çifti 81 adet allel üretmiş ve bunlardan 32 tanesi (%39.5) polimorfizm göstermiştir. Özetle bu çalışmada 32 adet (%9.41) polimorfik SSR primer çifti geliştirilmiş ve bu primerlerin 20 ceviz çeşi/genotipinde analizinden 98 adet polimorfik allel elde edilmiştir. Bu polimorfik SSR primerleri açılım gösteren bir populasyonda da ('Maraş-12' X 'Kaplan-86') test edilmiş ve 13 tanesinin kodominant açılım gösterdiği belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmada geliştirilen SSR primer çiftleri bundan sonra cevizde yapılacak genetik karakterizasyon, populasyon genetiği, genetik haritalama, çeşitlerin tanımlanması ve genetik kaynakların karakterizasyonu gibi genetik çalışmalarda kullanılabilir.