Türkiye'de Nohut Nödül Bacteria'nın Karakterizayonu

Nohut (Cicer arietinum L), Türkiye'de kültüre alınan ilk tane baklagillerden biridir. Türkiye'deki topraklarda azot eksikliği vardır, rhizobia nohutta düşük girdi ile verimi artırarak kimyasal gübrelerin yerini alabilir. Ayrıca, nodüller bitki gelişimini teşvik eden nodüle etmeyen endofitleri (NEB) bulundurur. Bu çalışmada, nohut nodüllerindeki rhizobial (RNR) ve NEB bakterilerinin çeşitliliğinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Türkiye'de 6 bölge ve 17 ilden toplamda 120 RNR ve 13 NBR izolat, morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal özellikler ile karakterize edilmiştir. NEB izolatları moleküler anlamda REP-PCR ve 16S rRNA analizleri ile tanımlanmıştır. RNR izolatları %90 oranda mukoz, dairesel ve düz kenarlı koloniler oluşturmuştur. Ayrıca 13 rizobial olmaya izolatın 11 tanesi açık pembe renkli koloni gelişimi sergilemiştir. Her iki grubun tüm izolatları %2 NaCI dayanıklık göstermiş, optimal gelişme 25-35°C'de ve pH 6-8'de olmuştur. Tamamı gram-negatif, hızlı gelişen, katalaz ve oksidaz pozitif iken amilaz ve metil kırmızısı negatif olarak saptanmıştır. Her iki gruba giren izolatların %95'i karbon ve azot kaynağı olarak farklı bileşikleri kullanmıştır. Her iki gruptaki izolatların büyük bir bölümü Zn, Cu ve Cr ağır metallerine hassasiyet göstermemiş, kanamisin, streptomisin ve tetrasikline dayanıklılık sergilemiştir. Numerik analizler her gruptaki izolatları 3 kümeye ayırmıştır. RNR grubunun 1, 2 ve 3. kümeleri sırası ile 113, 5 ve 2 izolat ile temsil edilmiş, bu izolatlar sırası ile Mesorhizobium ciceri, M. mediterraneum ve Mesorhizobium sp. benzerliği sergilemiştir. NEB grubuna dahil olan 8 temsili izolat, 16S rRNA sekansı ile tanımlanmış, Rahnella, Enterobacter, Pseudomonas ve Rhizobium olmak üzere 4 cinse %99 oranında benzerlik göstermiştir. Anahtar kelimeler: Rhizobia, Endofit, Nohut, Fenotipik Karakterizasyon, Çeşitlilik