Mycobacterium bovis'in ve Mycobacterium bovis BCG suşlarının tanımlanması için RD bölgelerinin multiplex PCR'ı ve spoligotyping karşılaştırması

Mycobacterium izolatlarının tanımlanması, tüberkülozun uygun tedavisi için önemlidir. M. bovis BCG'nin, M. bovis'in diğer suşlarından ve M. tuberculosis Kompleksinin diğer üyelerinden geleneksel yöntemlerle ayırt edilmesi zordur. Evrim sürecinde de önemli rol oynayan RD bölgelerinin varlığını gösteren moleküler yöntemler hızlı tanıda çok önemlidir. Mycobacterium tuberculosis kompleksinin evrim ağacını dikkate alarak 7 RD bölgesinin multipleks PCR'ı ile M. bovis ve M. bovis BCG ayrımını amaçladık. Çalışmamızdaki kullanılan M. tuberculosis, M. bovis ve M. bovis BCG ve diğer suşları içeren Mycobacterium tuberculosis suşları 2007-2017 yılları arasında Çukurova Üniversitesi, Adana Bölge Tüberküloz Laboratuvarı'nda izole edilen suşların arasında rastgele seçilmiştir. Genomik DNA, Mickle cihazı kullanılarak ekstrakte edildi ve bütün suşlar, yedi RD bölgesinin varlığını veya yokluğunu anlamak amacı ile multiplex PCR yönetmi ile amplifiye edildi. Doğrulama testi için spoligotipleme yapıldı. RDs tabanlı Multiplex PCR ile moleküler tanımlama, MTBC alt tipleri arasındaki farklılaşmada yüksek duyarlılığa ve özgüllüğe sahiptir. Bu moleküler yöntemin, M. bovis ve BCG suşları dahil olmak üzere MTBC elemanlarının düşük maliyetle doğru ve hızlı tanımlanmasına olanak sağladığı sonucuna vardık.